SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000415_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein H (SelH)
SpeciesCallithrix jacchus (Marmoset)
Promoter IDSPR00000415
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000350_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00000415_2.0 # Promoter # Selenoprotein H (SelH) # Marmoset (Callithrix jacchus) Full length # Forward
AGGTAAGGGGGTGCCAGAGAAGTCTTGCTGACTTCCTGGGGCATGGAGTTCTTATGGCTA
TGAGGAATGAGCAACAGCTGGGTGCTCTGATTGGCTCCAGGGGAGCAGGATAGGGATGGG
GTGGGCCACTGTTGGTTGGCGGGTTGTGGGGCGGGTTTTCTGGTGCAAGAGCTGGCCAAG
GTTGCATCAGCCGGAGCCTTCCAGGGGAGGCATGCGGCAGAGCTAGGTGCCGAGGGCAGA
GCATGGTGCTGGGTGCGGAGTCAGGTGCTGAGTGCAGAGGTGGGTGTGCCCGGCCTCCGG
GCAAGGCAACCGGCCTTACACAATAGTGTGCACCTGTAGTCCCTGCTACTTGGGAGGCTG
AGTCAGGAGAATTTGCTTGAGCCCAGGTGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCGCACCA
TGGCACTCTACCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAATAAAAAATTAAACACA
TGGGATAGCCAGATATTATATTAATGGGCTATTAAGAAAACTTACTGGAAAAGTTTTATT
CTACACTAAGTTGATTATAATAATCTTATGATTTTATACCATATCATGCCTTATTCAACT
TTTTTTTTAAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAG
GTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCCAAGTGCTTGGATTACAGGAGTGAGCCACTATGCCCG
GCCTAACTCTTTTTAATCTATTATTTAATCCTCACAGTAGCATTTTGAAATGGATACTGT
TCACTTGAGGAAACCAAAGCTGAGGGATTAAGTGCTTTGTTGAAAACCACCAGCAGGCTA
GGTGTGGTGGCTCATGCCTTTAATCTCAGCACGTTTGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACC
TGAGGTTAGGCGTCCGAGACCAGCCTGGCCAAAATGGTGAAACCCCCTCTCTACTAAATA
TACAAAAAAATTAGCTAGGCATGGTAGCAGATGCCTGTAATCCCAGCTTCTCAGGAGGCT
GAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCA
CTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCTGTTAAAAAAAAAAAAGCATCAGCAA
GTCAGCAAGTTTGTGGCGGGGGTAGAACCTGAATCCAGGTCTTCTGACTGATGTTTATCC
CAGTACAACTTACCTAACTACAGTTCTTTCTTTATTGTTACCATTCCCAGTTTGGATTGC
CATTGGTTTTTTATTACATATTTAGTTCCTTTTCCCACCTAAATTCACTCTATTCACTGC
ATTCCTTTTATAACATTTGATTCTGTTCCAGAGAGAAGTGGAGATCCTGATGTTCCTCAG
TGCCATTGTGATGATGAAGAACCGCAGATCCAGTAAGTTAAGCCCAATTCTCAGTCTCAA
GGTTAGACCTAATGCCCTCCGGAGGTGCTTTCCTTCATGTTAAGAGAGTGGCAATCATTT
GGTAAATGTGTCCTACATTTAATTCCAAGGCTGAATTTGAACTTTATCTCCTCCCTGTTT
CCCATTTCAAAGTGCCCCAAGAAGAGGGACAAAAAATGGGATATAGGAGTGCACAGCCCA
GCCTGACCTGTGGCATCTCTGTGTTTCAGTCACCGTGGAGCAACATATAGGCAACATTTT
CATGTTTAGTAAAGTGGCCAACGCAATTCTTTTCTTCCGCTTGGATATTCGCATGGGCCT
GCTTTACATCACACTTTGCATAGGTGAGGAGACTGCCTTTCTTTGGGTTTTTTGTAAGAC
TGTGTTGCTAGACTTGATTGTGGAAACCACAGTCCCAACAGTTGCAATCCCAAACATGTT
TCTCCATACCCTCCTTCCATATCTTGTATCTAATTAATTATATATGTAGCTCAGATGATA
GCAGTTTATAGACTGTATTTTTAGACGCAGAGGATGTGTTGGTGGTCTACATACGTCCAC
AAGTGTGTATTTGGGGGCTGAATTCCTTGAGTTGGTTTGGAAGTAAATTCCCTGTGTAAG
GCCTTTTATGTTTCCTCTGACATCTTCTTTCTGTGTTTAGTGTTCCTGATGACATGCAAA
CCCCCTCTATATATGGGCCCTGAGAATATCAAGTACTTCAATGATAAAACCATTGATGTG
AGTGCTCTTCCTCCTTTCTGTTTCTTGGGTCCCTTGTGGGTGATTTTGTAGTTGTGCTCC
TCTCTACTCGGTAGGCGGAACAACAGTGCTTCAAAGTGGATGTCGGCCATGTGGTTCATT
ATGAGAGCCAGAGGAGAGGGAATGGCAGGATGAGGAATCAGATGCTAAGCTCTGAACCTT
CCCAGGAGGCTATGTGATCCAGCTCACTTTTCTTCCCTGTATTTGGCAGGAGGAACTAGA
ACGGGACAAGAGGGTCACTTGGATTGTGGAGTTCTTTGCCAATTGGTCTAATGACTGCCA
ATCATTTGCTCCTATCTACGCTGACCTCTCCCTCAAGTGAGTAGTGCAAAGGGAGGGATG
ATGGAAATTGAGATGCTGTGTCTTCCCTCTCACTGTTTTTGGCTTTAATTTTTTTCTTTT
TTTCCATTTGGCCTTGATTTTTACACATGGCAACCAACAGCATCTCCTCCTTACCTCCCA
AATACCTATACTTCTATTTTCCTTGATCCGTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTCAATATATTA
AATAATATCTTCTTCTCAGGTACAACTGTACAGGGCTAAACTTTGGGAAGGTGGATGTTG
GACGCTATGCTGATGTTAGTACACGGTATGAAAAGACCTGGGCAGAGGGTCTGGGCGGGG
AATCACTTTGAATGATATATACAGGGGCATTTAAAGAACTTTCTGGGCCCTGCAGGTACA
AAGTGAGCACATCACCCCTCACCAAACAACTCCCTACGCTGATCCTGTTCCAAGGTGGCA
AGGAGGTAATGCGGCGCCCACAGATTGACAAGAAAGGACGAGCTGTCTCATGGACCTTCT
CAGAGGTACCTGAAAAGAAGGGCAGGTGCATGAAGGGTACAGAGTAGTAGATAGGCTTTC
GAGCCCTACTCGGGTTTGATTCACAGCTCTGCCACTTACCCATTAGCTTTGAGGGTGTGG
ACTAGTTACTAGACCTCACGTATTAATTCACTTAGCAAATATATATTATGTGCCAGACCT
GATAGTACTGAGGAACAATTCTTAGGTAAGATTCGGTCTCGAAGGCCCCTGCACATATTA
TCTGTAGGTGTTAGGTTCCCTGTCAGTTAATTGGAGATAATAACCCCTGGCTTACAGATT
GTTTTGCAGATTACATTAAATAATTTAGGTATAATTCTTGTTACAGTGATTGGCATATAA
GGGGTACTTAACTGTTAGTTTACTTTTCTGGATACCTGAAAAAGAGGAAGGTTAGGGCAG
ATTTTTGTCCTTTGCTTACTCCTTTCTTTCCCAGACTATGTGTAAAATACCTTTAACTTC
CCAGCTCTTTACTCTCCCTAACCCCAGATCCTGATGTCGTGCATCTCTTCTGTGCAGGAG
AATGTGATCCGAGAATTTAATTTAAATGAGCTATACCAGCGGGCCAAGAAGCTATCAAAG
GCTGGAGACAATATCCCTGAGGAGCAGCCTGTGGCCCCAAGCCCCACCAGTGTGTCAGAT
GCGGAAAGCAAGAAGGACAAATAAGATCCTCACCTTGGCAGTGCTTCCTGTCAATTCCAG
GCTCCTTCCGTAACCACAAGCCTGAGGCTACAGCCTTTTATTTATGTTTTCCGTTTGGCT
GTGACTGGGTGGGGCAGGGTACTGCTTCTGATTTTTAAAGAGGCATCTAGGGAATTGTCA
GGCACCCAGAAGAAAGCCTGCCATGCTGTGGGCCAACTGTATCACTGGAGGAAGAAAGAG
ATCTCATATGGTGGAGGAGGAAATGGTTTCCCTCCAAGCTTGGGCCAGTGTGTTAACTGC
TTATCAACAATTCAGACATCTCCATGGTTTCTCCATGAAACTGGTTTCATTATTCCATCT
TAGCCGACCTGCACAGCTTAATTAGACCTAGATTTAACCCTAAGGTAAGATGCTGGGGTA
TAGAACACTAAGAATTTTCCCTGGCTTGTTTATGGCCTTCATTAAAAGTATAAGCCTAAC
TTTGTCAGTAGTCCTAAGGAGAAACCTTTAACCACAAGTTTTTAATCATTGAAGACAATA
TTGAACAACCCCCTATTTTGTGGGGATTGAGAAAGGGTGAATAGAGGCTTGAGACGTTCC
TTTGTGGGGTAGGACTTGGAGGAGAAATCCACTGGACTTTAACCACTTTGACCAACTCCC
CACACCCAGTTGATGGTTTTCCATAATAAAAAGATTGGGATTTCCTTTTGATTGTGCCTT
TGTGTGTTTCTGTATTAGAAAAGCCTGGCAACTTCTGAGGAAGTCCGCCCATAAAAGGCC
ATCCTATTTGGTTTCACCAAATGCGCATCACTGATCCCCAGGATTGGCAAGACTTGGAGA
TCGCTGGTTTCCATAAGCCTTGAATAGGGGCCACACGTTGTTAGGTGGGGGTTTAGTTTG
GGATTGGTCCACGGATGCCAGGGAGGAGAGTTTGGCCGTGGATCATGGCACACACCATTT
AGCAGAACGCAAAGGTAGAGAAAAGATTGCGTGAAGCAAGGCTTGCAGTCGGACCTACCT
TGTCTCCGACCTTTCCTGCTGTGTTCACCATTCCAGCATCCCTTGTCCCCTCGACCCGAA
GTGATGGGTGGTTCCGTCGGGCGCTTCCAGTACCTCCCCGTTCCCTGGGTGTAAAGTGGT
TGTGCCCTAAGGTCCACCTCCAGGCCACGTGGGCGCTGCGGGCCACGCTTTCCGCTCCTA
GGGGAGTTTCCGCTGTAGGAGCGGAGCTTCCGGGCTGCGCCGCAGAGCGGGGTTCTTCAC
TGCCTGGTTCCCGCTCAGTGGTCGCGTCTCCGCCCCCTATCCACCAGGTCCGCTGCGTTC
TCAGCCGGGCCCTAGGCGCC
Chart Advanced