SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000425_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein T (SelT)
SpeciesCallithrix jacchus (Marmoset)
Promoter IDSPR00000425
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000360_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000425_2.0 # Promoter # Selenoprotein T (SelT) # Marmoset (Callithrix jacchus) Full length # Reverse
GCAGCAGAAGCCTCATCTTAATTGAGCCAGCCACTTCGGCCGACCTCAGAGTGATACTGC
AGCCAGCCGAAAGCCCAGGCGCGAGATGCTCCCCACTGCGCAGGCGCGATTAGCCAAGGT
CGGGGGAGGGGAGCAGGAATGCGCCTGCGCGGCCTGGCGCCTGCGCACACTCCTGGAAAG
GAGCCGACCTGTTTCACCGTCCTGACTCACCACCATGTTGGTAGTGTGTCAGACTGTGGG
AAGGCATGAGAAAGGCAGACAGGGAGCAAAGTCGCTGGTGGGTGTCACATGGCCTATGTA
TGAGGCAGATTTGAGTTCTGCATCCAGTTTTAGCAATTTATCCATTTATCTGCCTAAGAC
ACTTGGAAACATCTTGTACTTGACAGCCCTGATTCCAGCGTTGGCGGATAGAAGTGCTGA
CCCTCAGGATAGTAATGTGATATAGCTAGCCTAGAGTTAGAACCTGTACAATGCCATTTT
ATAAAGAAGAAAGCTGTTTCCATTCTCACAATGACTGCTAACCTTGGCTTTTGTAAATTG
CGAGATCATTTGCAGGATGCAAATTGAAGTAAAGCTGCATACCTTCTCTTATCTGTAAAT
GCCAGAATTGCTGGCCTTTGTTTACCAGAGTAAGCACCCCCAGATAATTCCATCCTGTTG
CCAAGTAAATAAAAAATCTATGGCTCCCACCCCTACCCAGACGCTGTGTAAACGAATGTT
AATCTCAGCATCTGTGAACCCCTTAGATAACAATCAGAATGTCAAATAGTCCCCTGGCCC
TCGAAATGTCCGGAACCCCCTCACCCTCCTCTCCGCCCAGAAGGTGATTTGAATCCACTG
GCCCTCGGGATGTCTGAAGCCCCTCACCCCATCCTCTCCCCTCACCCCCAAGGTGATTTT
ACGGGTATAAAACGTCTTGTCACCCTCTTTTACGGGGCCACGGGTTGGAGAGACGTGAGT
CCTCCGTGGTCGCCGGCAATAAACCCTGCAATTTGGCATACTTTTGTTCTGGTGTTGACT
TTCTGTGCTCAGTTTGATATAACAGTAATGCTGAAAATTTTGGGGTGCCTTGTTATGGCC
TTTTCTTTGATCTTACAATATTGTTTTCTCTTAAAAGAATATTAAACATAAGTTTTTAAA
AAACCTTTGGCCGGGCGCTGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCGAGG
TGGACAGATTGTAACGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCCAAAATGGTGAAACCCCGTC
TCTATTAAAATACAAAAAAATTTAGCCGGGAGTGGTAGCGCGCACCTATAGTCCCAGCTA
CTCAGGAGGCCGGGAGGCGGAGGTTGCCGTGAGCTGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGTC
TGACGACAAAGTGAGACTCCGTTTCAAAACAAAACAAAACAAAAAACCAACAACAAACTT
TGGACAATTCCAAACATATACAAAAATAGAATAACTACCTTAGCAAGCTTTAACAGTTAC
TAACATTTTGACAATCTCGATTTGTGTATATCTCTAAACAATACTTTTCTTCCTAGTCAT
AGTTGGAAGCAAATCTCAGACATCCTATCATTTCAACTATATATGTATTTTTTAACACGG
TCTCACTGTTACCCAGGCTGGAGTAGCATGATCAAAGCTCACTGCAGGCTGAAATCCTGC
CTCAGCTTCCCAAGTAGTTGGGAATACAGGCACAGGCAACTACACCTGGCTTACAATTAT
TTAAGCATATACTTCTAAAAAATAACTATTATTTGAAAAAAAAATGACTACAGTATCATT
ATCTCACCTTTAAAAAACAGTAATTGCTTAATATTAGACAGTGTTCAAATTTATCCTGTG
GTCTTAATAACTACTTATTTTCCTACTGTTCATTTGTTCAAATCAAGATCAAAATGAAAT
TTATACATTGTCATTGGTTGATATGTCTTTTAGGACCTGTCAAAGACTAAGACCAGAAAC
ACACCAGCAATTGAACAATTTTGTTTATGATTAATTGCAGCAAAAGGGATGCTATGGTTT
GAATATGTCCCCCAAAAAGCATATGTTGGAAATTTAATACCCATTTTAACATTGTTGGGA
GGTGGCTCCTAATGGGAGATGGGGCCTAATGGGAGGGCTCCACCCTCATGAATGGATTAA
TGCCAATTATGAAAGGGTTTAAGTCTTCAATTTCTACCTATTGCTCTTTCACTCTTGCAC
TCTCCTGCACATTTACCTTCCACCACTGGATGATAGAACACAAAGCCCCCGTAAGATGTG
GAGCCCTTGATGTTGGAATTTCCAGCCTCCAGAACTATGAAATAAATCTCTGTCTTTATT
AATTCCCCAATCTCAGTTATTCTGTTATAGCAGTCCAAAATGGACTAACACAGAGGACCA
CACACCACGGGAAACCATTAGAAGACTCAGTAAGGAGGTGTTAGGATCTGGGGCTTGATT
AGATGATTTGGAAAATGGAACTGGGGTGCTGAGTGGTTCTACGGTCAGAGGTGTTCAAAC
CAGAGTGAGTTCATCTTGTGCAGGTACTGGGTAAAATGAGGTGGAAACCTGCTGGACTGC
ATTCCCAGTCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGAT
TCAAGCGATTCTCATACCTCAGCTTCATGAGTAGCTGAGACCACAGGCACATGCCACCAT
GACCAGCTAATTTTTGTATCTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGGTGGT
CTTGAACTCCCAGTCTCAAGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAAATTATA
GGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGCTTAGGTTTTTCTGTTACCATTCCCACCTTCAAC
TCGTAAACAGAATTATAGACAAGGCAACACTTGCAAGTTCAGATAGTAGACTGTCCGTGT
CTGGGAGGCCATTACACAGAGGTAAGAACCCTAACCAGCAAGTTGTTTAGGCCAGCAAGC
TTAAAAAGCAAGGGCCAAACCTCTGTACAAGGTAGGGGCTACAGTAAGAGCCTATGATAA
ATTCTGGAATGACGACTTTTGAGAAATCCAGTTATCAAAAAACACAGAGCTCAAATGTAA
GAACAAACAAAATCATAACTAGCATCAGGTTGCTTTGCACAAGCATCGAAACTAATGCTG
TATAATACTGTTTTTTACTTACTAAAAATAAAAGTGAAAAAGACTAATGATGTATACCTG
GTTTTATTTTGTGGGTTTTACGTTTTGGTTGCTGTGCTGGAGGGATAGTAGGATATGCCC
AAGTCACCAGCCCCTCCATAAAAGTCTCAGACCCTGAAACTCAAAGGGGCTTCCCTGGGC
AAAGAAATACCACACATTCACTGCCAGAGAGAGAAAGAGAGAGCGAGGGAACCCCTGTGC
AGTCCCCAGTGTGAAATGCTGAGGAAGCCTGGTTCTGGCCTCTCTGAACTCCCTTGAGGC
ATATCATTTCCCACTGCTTTTGCTCTGTAACCTTTGCTATAATGAGCCTTACTATGAATA
TTATTTGCTCTTCCATCTTGTGAGTCCTACCTGATCACTGAATTTGGGTCATAAGACCTC
TGAAACAGAGGGCATGGGAGGAGTTCAGGGAGTACAGGATAGAGGAGGACCTGGTGAGCC
TAGGGCCTTGGAAGAAGCTGATCAGGAAAACAAAATATATTCACTTACCAAGTTGTAATA
ACTGTGGGAGGAAAAAAACTGTACTCAGTTTTGGCGATACTGTTGGGGAAAGGGTCATTT
TATTAAACTAACTTGGGAAAATAAGTAAGTCCAGTTTTTTGGAACTATAACTGTCAACAT
AAACCCAAAGTCTTAAAATGTACATGAACCTTGACCCAGAAATTTCACTTCTAAATCTAA
CCTAGAGAAATAATAATATATAGCTAAAGACTTTAATTACAAAAATGTTCATCAGAATGT
TATTTTATAAATGTATCAATCGGAAACAATCTCAGTGTCCAACACCGAGTTAAATAAATC
ATGGTGTATTAATTTGGTGGCATTTTAACAACCATTAAAAATGACTTATAAGTTTTTATA
TATGTGTAAGCTATATGCAGAATAATATACAAAGAACCAAAAAGTGGTTGATTTCTGAGA
GAACAGGCAACAGAGCAGCTAGGGAACAGAGATGGCAGAGAAGTCATTCTTATTGCATAA
GTAACTTTTGTATTTTAAAATTTTGTGCTGTTGTCATGTTACACTTATTCAAAAAGTAAA
TAAAATAAACGTTTTATAATTCAATGAAAAATAAATTATTAGAGTGTTAAGAAAAAAATT
GAATTATGAAACAGTAAAATGTTACTAGATTATTTATATATATTTTAAAGTACATAAAAA
GGAAGACATGGATAAAATGTTTTGTTTGGCTTTATTTCCTGCTAAACATATTGTATTTTG
GTAATAAGAAAAAAAAGATAGCTGAGCATGGTGGCATGTACCTGTGATCCCAGCCACTCA
GGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGTGGTCGAGGCCACAGTGAGCCAATGA
CTGTACCACTGCACTCAAGTCTGGGTGACAGAGCAAGATGCCATCTTTAAAAAAAAAAAA
TTGGCCAGCCCGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCACATACCAAGGAGGGGATGATCAC
TTGAGTCCAGGAGTTCAAGACCAACTTGGGCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACAAACA
AATATGAAAATTAACCAGGCATGGTGGTGCACACCTGTAGTCTCAGCTTCTGAGGAGGTT
GCACCTGTAGTCTCAGCTACTGAGGAGGTTGAGGCAGAAGGACTGTTTGAGTCAGGGAGT
TCAAAGCTACAGTGAGCCATGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGTGAAAGA
CCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGAATTGTTTTAAAATAAATAAAAATTTAAAAAGAAAAAA
TAGAGAAGTAGAAAACAAAA
Chart Advanced