SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000560_2.0
Identity
PromoterSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesCholoepus hoffmanni (Sloth)
Promoter IDSPR00000560
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000495_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000560_2.0 # Promoter # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Sloth (Choloepus hoffmanni) Full length # Reverse
TGCAAAGGCAAACAAAAATAGGTAACTGTTTTATTTTCCTGTAATTATAAAATTATTGTA
GGAAAATATCTTTGGGAAAAAAAATATATCCAGTGAGAGGTCTCCACAAAAATCAAATCT
TTAAAACTTCTAAAATCCTTCAGTCAATTTAGAAAACCAAAAAAGTGATTGCCTGTTTCT
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TCATTTGATATTTGCTTCTCTGCTCAGGAAGCTGTATATTTAGATGCTATCTCTTGACTC
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GGAATCTACTATTTTGCTGAGGTACCAGCTGGAATCTTATGTGCTGGCTACTGTATGGGA
CTGAATCTTATTGAGCAACTGCACTCTGCATTGCAACAGACTTTGAGATTTCTACCTCAG
TGTGACATGTTAGTTTCATAAATGGAAGAAAGAAAACCAATAAAAATGACAAAAATAACC
ATGTAAAGAAAAGAAAGATTACCAATAATGTTTTGGATATAAAGGAAGCCAACATGAAAA
GAATTGTGACCGAAGAAACCTCATACAATAATGAGCTTCATAAATTTGAGAGTTTATAAC
AAATTCACGATTTAAGCCTCAAAAATATCAGACCTACTATATAGTTCTGATCCCCTTCTG
TGCCAGTTTGGATGTATTATGGCCCCCAAAATGCCATTATCTTTGATGCAATCTTGTGGA
GGCAGACATATTAGTGTTGATTAGGTTGGAAACTTATTGGTTCAGTGTTTCCACGGAGAT
GTGACTCAATCAACTGTGGGCAAGACCTTTTCGTTGGATTATTTCCATGGAGGTGTTGCC
CCACCCATTCAGGGTGGGTCTTTATTGGATCACTGGAAGTACTTTAAAAACAGCCACACA
TGCCCCAGATACAGAGCAACTGTGAGTGACATTTTGAAGATGGACATCGAAAAGCTAACA
TTTTGGAGAACGCCATTTTGAAACGCAACCTTATGAACAGCAGATGCCAGCCATGTGCCT
TCTGAGCTAACAGAGGTTTTTTTTGGCCCCAATGACCCTCCCTTCAACGAAGGTGCCCCT
ATTGGTCAATGCCTTACCTTGGGACACTTTATGACTTTAAACTGTACTCTGGCAACCAAA
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Chart Advanced