SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000789_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein K (SelK)
SpeciesDipodomys ordii (Kangaroo rat)
Promoter IDSPR00000789
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000724_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000789_2.0 # Promoter # Selenoprotein K (SelK) # Kangaroo rat (Dipodomys ordii) Full length # Reverse
TCTTGCTCCCAGCTTCCGGCTGGCTAAAACACACACACACACACACACACACACACACAA
AATAAACCCAACACACACAAACACACACACACAAAAACAACTAACGCCTCCTTCGGCTTC
CGTACCTAGGTTATCGCCCCGCCCACTAAAAACGTCACAGGCCACGATTGGACCACCCAT
TGGCTGCTTGGGAAACACGTTCCGGATTGGAGATTTGCCCGGTCACGCACTCAACTTCCT
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TTTCCGCACGTCTCTAAAAGTGGAGGCTGTGGAGCTGCTTTGCACGTGTGGCGAGCGAGG
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AGTTTGGCGTCACGTGGTGTCTGTACCGTAAAGCTCCGAGTGGTCGCGCCTCCGGGCGGT
CTCCGGGCGGCCCTCCGACTAGTGCTTATTCCGTTTGACACCAGCCTTCTGCCCCGGCTT
CAGCAGTCCTGGAGCTTTGAGGACAGCACGACGCTTTCCTCCGCGTGTTAGCACTGGCTG
CTGCCTGTCGGGATTGTGGAGGTGACACCTGAATTAATTGGGTGCCGAGGACGTTCACGA
AATATGGACCGCATTCCCTGCTGCCCCCGTCACGCTAAGTCTGGCCATCGCATTCTTAGT
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TTATATTGGGAAAAAGACCTTTTCTAAAGGAAATGTGAAAATTACATTTGGAGAATTACA
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TTGTGTGTGCCAGTTCTAGGGCTTGAGTGCTCCCTTGGTCTAAAGAGCTCAAGGCTACCA
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TGAGATTTTGTTAGGAAACTTAGTCATGATGGTATTAGAATAAAGAAAGAGCAGAAAATG
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TTTGACTTTAAGTCATTCTCCATCATTCTTAACTCTGGAAGCACAAGAAAAATGAGTGTG
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CTTGAACTGAAGAGCTGAGGGATGCAACCAGGCCCAGAGTTTAAGCCCCACAACTGACCC
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AAGATTAAGGTTTTCATTTGTTGTTTCCAAAGTATTTCTAAAAAGTTGTTCTTTTAGTTT
TGTGAATGAGTTTTTTTAATATGTCTTGGATTCTGCAGGAATCTCTACCTGAAACACTTT
CTCCTGACTGCTTACACATT
Chart Advanced