SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000792_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein N (SelN)
SpeciesDipodomys ordii (Kangaroo rat)
Promoter IDSPR00000792
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000727_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000792_2.0 # Promoter # Selenoprotein N (SelN) # Kangaroo rat (Dipodomys ordii) Full length # Reverse
AGTGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GCCCCGTGCTCCTCTGGGTAGCTTGGCTCCCCTTGAATAGGAGTGTGGGACTGGCAGTGG
CTGAACTTGGCTTCTCAGATCCTCTGCTCAGACACGGGCCACGGCTGCCATCATCCAGCA
TGAAAGGAGAAAGAAGTCAACGTCCAAAGTGATGGCTACAGGGCTGGGAAGGTGGCTGAG
TAGTAGTGTCTGCCTAGCAGGCAAGAAGCCCCAGGTTCCATTCCTCAGCACCACATACAC
AGAAAAAGACGGAAGGGATGCTATGGCTCAAGAGGGAGAGTGCTAGCCTTGAGCAAAAGA
AGCTCAGGGACAGAGCCCAGGCCCTGAGGTCAAGCCCCAGGACTGGCAAAAACAACAACA
ACACAAAACCAAAGTGATGATCAGCTTCAGACACCTGTGGCAGGATGCAGCAAGGGGGAG
GCCTGGCCCCCGGCTGACCAGGGTGATGAAGTGTGCAGAGGGCTCCTAGCCTTTGGTGGC
CCTGACAGCTGGCAGCCGGGAATGTGTACATCAGAGCTGGCTCTCAGGCAGTCACAGAAA
CACACAGATCACCTCTTTAGAACACAGCTTCCCAGATCCCACCTCAGACCTACTGAGTGG
GGGCCATAAGGTTGTGAGTCAGGGAACTGTGTGTGTGTGTATACAGTACTAGGGTTTGAA
CTCAGGGCCTGGCACTTGCCACCTGAGCCATGCTCCAGCTCTTTTTATTTTATCTTTCAG
GTTGTGTATTACACTTTTTGCCTGGGTCAGTCTGGTCCTTGATTCTGCCTCCCTGATAGT
TAAGATGACAGGCACTCAGTTGCAACTTTTTGCTAAGGTAGGCAAAAAGGTTGCTGGGGT
AGGATCTGTGATCTGGATCTCTGTCTCCCAAGTAGCTGAGATACAGCCTGAAACACTGTC
TGCCCTAGCCCTTTGGTTTTAAAATAAGAAGCATTCCAGCTGGATGCAGGTGGCTCACAC
CTTTAATCCTAGCTATTCAGGTGGCTGAGATCTGAGGATTGCAGTTCAAAGCCAGCCTGG
GCAGGAAAGTTTATGAGATTCTTCTCTCCAGTTAACCACCAGAAAACCATAAATGGTGCT
GTGGCTCAAAGTGGTAGAGACCAAGCCTTGAGCAGTGCCCAGGCTCAGAGTTCAAGGCCC
ACAACTGAAAAAAAGAAGTATTTCCCTTACTGTAAATAACACTTGTAAGAATTTTAAGAT
ATAAAGCAGACATACGCATAGCTCTATCAACTACACACAGCCATTTGTTTCTCTTGCTTC
TTTTGAATTTGTTGCCCTCTAATTTCCCAAAACACGGTCCCTTTTATACTCACAGACTAG
AAGCAATAAATTATTCTTCTCCCTGTGAATTAAAAGTGCCCCCAACTCCAGCAGGCTTTG
CTGACTTATCATTATGAGGGAATGCTAGCTCTCTGGCCATAAGAAAGGACCAGGAGTCGG
CCGCACAGGGGCAGTGTAAGAATCAAAGGTAATGTCAGCGTGACTGACAGAACTGCCCAC
CACTGACACAGGGTCACTGCAGCTAATTTGCATCTTCATCTGACCTTCCTCCTCTGGCAG
CAACTTCAGGTCACCGGGTAGCTAATGGACAACTTCCCTGCACATCCCTGAAACACAGCA
AGCGTTGTGCTACTTCTGCCCGGAGAGAAACTGGAACCTCTCTCCTATATCTTCCATCGA
TTGACTGACTGACTTCAACCAGGTGATCGGTGTGCCAAGGTCCTAAGTTCAAAAATATCC
TAAGAGGTTGGAGGGATGGCAATGCAGACTTCAGTAGGGGGGTGGGTGTGGCTAGGGAGA
GAGAAGCATATTATACTTTCTTAGAACCCTTCTTCAACCTCTCATCTTAAAAAGAAAACT
TAGATTAGAAGAAGGCAAAGATAGCAAGAAGGGCTAGGAATCTGATAGCACCTGAGCAGA
CAGCTGTAGGTCACCACACGCAGCTGTGGCTCCTCTCTGCCTGACACCCCTGACAAAGTT
ACCTGTGGTGACTTTACATCCACCTCCTCTAATCCTCATACCTATTCTGACCTGGGCTCT
CCAGTTTGGGCATACATTACGTTTTTTGTCACAGTGCCTGTGACTTAATATTCCAAACTC
TGGGAACAGGGTCCATCTCCCTGAGCTGTCATGAGGTTTAAGGAGAGAGCTCCAGGAAGT
ACCTAATGACAGTGGCTGGCAGTCAGGGCATTATTCAGAAAAGTGTGAGAGTCAGGCACC
AGTGCTGATCTCAGGAGGCTGAGATCTGAGGATCACAGTTTGAAGCCAGCCCGGGCAGGA
AAGTCTGTGAAACTCATAGCTCCAATAAACTCAGAAAAGGCCAGATGTGGAGTTGTGGGT
CAAGTGGTAGAGCACTAGCCTTGAGCCAAAGAAGCTCAGGGACAGCACCCAGGCCAAGTT
CTAGTCCCAGGACCAAGGTGTGGGGGTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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