SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000868_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein R (SelR)
SpeciesEchinops telfairi (Lesser hedgehog)
Promoter IDSPR00000868
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000803_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000868_2.0 # Promoter # Selenoprotein R  (SelR) # Lesser hedgehog (Echinops telfairi) Full length # Reverse
TAGCATCCTATCATCGGAGGGCCGCATGTGGCCCACGCTGTAATTTGAGGACCCCTGCTT
TAAGGCTTCTCTTTTGGTGAAAACCAATTTTCTCCTTTATAATTTTTTTGTCATAAAATA
TTTATCTTGATGAGATTAACTTTGCTAAGCATAATGTTCTCTAGTTTGGCCCAGGTCTTA
AGGTGTTTGACAGACGTCACTTTTTTTTCTTAAGAATGCATCCTATTCCATTATATGAAT
ATACCAGAGTTGGTTTGTTTTTGATAATTAACCCAAATATTTTTTTTAATGTTCCTCTAA
AGTCACAGCTCTCTCTCTAAAGTGAAAGACAGATATTTTCTTTTCTCTTTTTCAAAACCA
TTTTATTGGGAGTTAATACAGATATATTGTTCCATATTTTAATCGCATACTTATCTCCGT
AGTGCTTGTACAATTCTACAGACCCACCAGAGATGTGTGAACATTCTATCCTCTCCACAT
CCTCACCAGCATTGATTATTTTCTAATATTGGAAGATTCGATGGGCAAGATATTGAATGA
TGCAGGAAGCACCCAATGAGCACAGAAAGAACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTACTGTTGGCCCTGCTGGA
AGTCTCCGCATGTCTCTTAAATATTTGCGAGGGTGCATCACATGAGAATGTCTCAGATGA
AGATCCTGGCCCCAGGCCTCTCCTCCCATCTGCACATGAATGTACTCTAGCAAAGACATC
CCAGATTCGTGTGTCAGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA
TATATATATATATGGAAAGTAGGTCACTAGACCTTTCCCAAGGTACTCTGAGGGACTTAA
AGCACATTACCATTTGTCCTACTCAGGGCCTCCAAAGCTACTTAACAGAGTGAAAGTTGG
GACTGAAATTTGAGCACTGGACTTGGGTACATGAAGGTCAGCGGTGACCTTGATACGTTT
TTTTTGGTGGTGTGTGCAGACCAAAGTCTGACTGGAATGGGCCCTGAGGGAATGGAGAGA
CAGTAAGTGATACAGAGAAATAGGGCAGTAGCTGAAAGAGAATGTGAGGTTCTGTTTTTG
TGTTAATTAGAAGAGATACATGTTTGTACTCTTAGAAGTGATGAAAAGGTGATAATGACA
GGGAGAGAGAAAGGATACTTGCTGGAGCTAGATCCTTCCATCAGTGTTTGAGAGGTGACA
GATTCAGTCACTGATGAAAACCGGCGTAAGAAGACAGGGAGTTTGTTCCTGTCTGCAGGA
GAGGAGGCAAGCACTGGTAAGGTTGGAGGAAGTAACATGTTTTCCCAATGAAACAGGAAG
CAAGGTCATCTTCAGCTGAGTATGAGGAGAGGGCTGGAGATGTTGCCTCTCAGAGGAGAC
ACGAGAAAATATGAAATAGTCATCTAGAACAATGAGAGTAAATGGAGTTTGAAAATACAA
TCATATTTGGGGGTAGCGATGAGGATCAGTGGTCGTGAATACGAAGGGGGGCAGTTAGCA
TTGCTTCTTCTCACCAGCCTTATTTACCTGCTTGACTTCAAATAAAACTGGACAGAGGCT
AATTTAAGCAGAATCTGGTGGTGCCAGGTGAATATGACGACAAGAGGCAAGGTAGTACGA
GGCAAGATTATATTGAAAAACCATAGCAAGTACATCAGGAAAGGTGTGCATCCCAGTTGT
CTCCTCTCACCATATTTGTTCAGTCTGTGTACTGAGCAAATCATCTGAGAAACTGAACTA
TATGAAGGCGAACACCGCATTATGATGGGAGGAAGGCTCATTACCAACTCTAATATGTAG
AGGACACAACTTTGCTAGTTGAACATGAAGAGACTTAAAGTAATAGTTATGGATGCAAAT
CAAAGACTATCACCATCCTTAAAGATCTTACCTCAATGTAAAAAAAAAAAAAATCCTCAC
AACCGTGCCAATATCATGATAAATGTAGAAAATAGTGGAACTGCCAACAACTTTGTTTTA
CTTGTTTCCACAATCATCATTCATTGGAAGCAGCAATGAAGAAATCAATTGATGAATGGT
ATTGGGCAAATCTACTGCAAACACCCTCTTTAAAGGATTAAAAATCAAATACCTCACTCC
AGATATTTTCAATACACTCGTACGCATCAAAAGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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