SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000875_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein R (SelR)
SpeciesEchinops telfairi (Lesser hedgehog)
Promoter IDSPR00000875
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000810_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000875_2.0 # Promoter # Selenoprotein R  (SelR) # Lesser hedgehog (Echinops telfairi) Full length # Reverse
GTGCTACCAAGTTCCCTTACTGCTCTCACACTCCGACAGCTCCGAATGCCAGACCCCACC
GCACATAACTTATTTTGAAGTAAAAAACACCCGGCGGGCCTCATAAATGTCGGCGGACCA
TAGATTGAAGACCCCTGTTGTAGGGGCTGCCTCTCTTTTGCCGGCCTTCTAATGTACCAA
TATTTGTGTCTTCCTCTAGGACAGTGGTTCTCAACCTACCTAATGCCACGACCCTTTCAT
ACAGATCCCAATTTAATGGTGACCCCCTAACCATAAAATTACTTTCATTGCTACTACATA
ACTGCAATTTTGCTAACGTTATGAACGGCGACCGTTGTGAATGGGTCGTTCGTCACCCCA
AAGGGGTTGCGACCCACAGGTTGAGGACTCCTGCTCTAAAGTATTGCATGTTTCTCTTAA
GGTCTACTTCAGCACATTGTTAGAAGGACAAGTCCTGTTGTTTTTGTTGTTAGGTGATGT
CCAGTGGGTATTGACTCATAACAACTCGATGTAGAACACAATGAAACGCTGCCCCGTCCT
GTGCCATCCTCACAGTGGTTCTTTGGCTTAAGCTCATTGTTGCATCTGTTGTGTTATTCC
ATGTTACTGGGGGCTGACTCTATTTTGCTGCCCTTCTACTGTATCAAGATTTGTGTCTTC
CTCTAGGGCAGTGGTTCTCAAACTTCCTAATGCCATGACCTTTTCATACAGTTCCTAATG
TAGTGGTGAGCCCTCAAACATAAAATTATTTTGGTTGCTTTTTCATAACTGTATTTTTTC
TAGTGTTATGAAAAGGGCCACCTCCTGTGAAAGGGTCATTCGACCCCCCCNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNTACAGTTATGAATTGGACCACCACTGTTGAAAGAAGTTGCTTG
TCCCCCCCAAAGAGTCGCGAATCCACATGATGAGATCAGCTGCCCCAAACTTAATAGGAG
TTTCTCTTAATGCCTTCTTCATTATATTGTTAAAAGCACAATCCCTGTTGCTGTTGTTGT
TATTGTTGTTGTTGTTCTTAGGTGATGTCGAGTGGGTTTTGACTCATAGCAACTCTAAGC
CCAATATAATGAAAGGTTGCCCCCTCCTCTGCCATCCTCACAGTGGTTCATTTGCTTGCA
GTCATTGTTGCAGCCATGTGATCATCCATCTTGTTGGGGCTGCCTCTCTTTTGCTGTTCT
TCTACTCTACCAAGATTTCTGTCTTCCTCTAGGGCAGTTGTTCTCAACCTTCCTAACTCC
ACGACCTTTTCATTCAGTTCTCAATGTAGCGGTGGACCCCCAATCATAAAATTATTTTCA
TTGCTATTTCATTACTGTAATTTTGCTACCATTATAAATCGGGCCACCCCTGTGAAAGGG
TCATTACCCTCAAAGAGATCGCGACCTACAGGTTGAGAACCGCTGCTCTAAACTAATAGG
AGTTTCTCTTAATGTCTTCTTCATCATATTTTTAGATGCCCAAGCATTGTTGTTCTTGTT
TGTTGCCGTCGAGTGGTTTCAACTTACAGCAGGTCTATGCCCAATATAATGAAATGCTCC
CCCATCCTGTGCCATCCTCACAGTGCTTCTTTGGCTTATGCTCATTTTCGCAGCCACTGT
ACTACTCCATCTTTTGGGGGGCTGACTATTTTGCAGCCCTTCTACTGTATCAAGATTTGT
GTCTTCCTCTAGGGCAGTGGTTTTCAACTTTCCTAATGCTATGACCCTTTCATACAATTC
CTAATGTAGTGGTGACCCCTCAACCATAAAATTATTTCATTGCTATTTCATAACTGTAAT
TTTGCTTCTGTTATGAATTGGGACACCCCTGTGAAAGGGTCGTTCGACCCCCAAAAGAGG
TCGCAACCCACAGGTGGGGAACCACTGCTCTAGCTAATAGGAATTTCTCTTAATGTTTTC
TTCATCATATTGTTCAAAGCACAATCCTGTGGTTGTTGTTGTTAGGTGCTGTCAAGAGGG
TTTTGACTCATAGCAGCTCTATGCCCAATATAATGAAAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTGGGGGGCAGTGACACCCCCTCCTCGATAATCCCACTG
CGTGTGTGGGGAGGGGGACTGATAATCCCACTGAGGTGGGGGAGGGGGACTACTGGCCGT
ACCGGGTTCAAAGTGATTCTGGAAAACCTCGCCCCCGGAGAAGCTGCAGAAAGACATAGT
GCCACCTGGTTCCGGTCCCGCTCTCACACTCCGACAGCTCCGAGTGCACCGACCCCAAAA
CCTCCAGGCTCCCAACCCGACCCCAGTCCCGAGACCAATCACACTTGGAGTTACGGACCG
GCCCCGAGCTGGACGCCCCGCCCTACTCCGGCGACCAATCACTTCCAGGAACTTCCCTCC
CTAGGCCGCCTCTCGAAGTCCCGCCCACTCCCAAGGACCAATCGCTCCCAGGCATGCCGA
ATTCGGGTTCCGGCTCGAGGCCCCGCCTCCTCCCGGGGACCGGTCCTACCCCGTCGGCCA
GCAGGCCCCGCCCACCAATGGCGTCATCTTCTGAAGACCACTCCTAGGCTATTTCTTCGA
GGCCCCGCCCCCTGAGGACAGCCTCCATTCGACTTGCTGGGCCCCGCCCCGGCCTCCCGG
AGGCCCCGCCCCGGCCTCCCGGAGGCCCCGCCCCCTCGAACGCCAGCGGACGCCGCTGAG
CTGCTCTCGGGTGCAGGTGGGGACAGACGGGCGCATCTGGGGCCAGGCCCGGATTTGTGA
TGGCTTTCCCTTAGCCTGTCCCCAACCTTGAGCCTCGGTTGGCTCAAGTGTCCAGTGTGG
CCTTTCCATGGGACACTGAAGGATGCGTTGCCACCAAGCTTTATTAGACAGGAAGGGCTG
ATGGGGACACCGCCTACAGCTCTCCGGAAGTCTCTGGAGTTTCCTTCTGGAGATCTTTCT
TCTGGGGGCCCTGCGGTCGGTGACAGGAGGGCCGTTTGTCACTGGGTCTGTCTGAGGATA
CAGGTTCTGGCCAGCCACCAAGTTCTACCAGGGTGGACCTGGCTGTCCCCTCCCACCCCC
ACCTTGTCTGTCAACAAGGGTCAGTGGCCAGGGCTGGACCCCCCTCTGCAAATGAGTGCA
GGAGGCCTATTCCCAACAGGGGCAGAGGGAGGGGGAGGCAACCGCAGGCTGGCTCACCAT
GAAGGCCCTCTTCTCCTGGGCAGTCTGGAAGCAGCCATGGCCAAACTTGGACGTGGTATC
GATAAACTTGAGCTCGATGCTCTCCAGGGCCCGGCGGCTGTGGGGGACCCGGAGGGACTG
GGAGCCCAGGTGAGAGGGGATCCTTGAGACCCAGTCACCCCTCCCCCAGGTCATGTCCTT
GTTCCCCCAGTTCCCCCTGCCCAGATGTTTCACCCAGCTCCTACCAGAACCCCCCTTTCT
GCCACTGCCCTCTGTGCTGTGAGTCCCCAGCCCACCTTCCTCAGCGTGATGATCCTCTTC
TTGGTGCCAGCGATGCAGCCCTTGAGCATGACAAAGTCGTTGTTGACCTCTCCATAGTGG
GGGAAGGCACCCTGCCAGAG
Chart Advanced