SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000986_2.0
Identity
PromoterThioredoxin reductase (TR)
SpeciesErinaceus europaeus (Hedgehog)
Promoter IDSPR00000986
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000921_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000986_2.0 # Promoter # Thioredoxin reductase (TR) # Hedgehog (Erinaceus europaeus) Full length # Reverse
CTGGGGGAAGAGGCGAGAAGAAAGATCAGCACCAGTCTAGCCACAGATCCTAGAAGGAAC
CACCTAGTTTCTTTCTTTCATCCTTCCTTCCTTTCTTTTTTATTGCCACCAGAGTTATCA
CTGGGGCTTGGTGCTGGCACTATGAATAACAGCCATTTTTTCCATCTTAATGGATAGGAC
AGAGGAGAAATGAGAGGGGGTTGGGGGAGATAGAAGAGGGAGAAAAGAGAGACACTGCGG
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TCCCCCACTGAAGAGAGATCTGTTCACAGACAGTGAAAGCAGGTCTGCAGGTGTCTATCT
CTCCCTCTCCCTGTCTTCCCCCTCCTCTCTCCATTTCTCTCTGTCCTATCCAACAATGAT
GACATCAGTAACCAACATCAATAACAACAACCAGTAACTACAACAATAAAACAAGGGCAA
CAAAAGGGAATAAATCAGTAAATAAATATTTTTTTTAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAAAAC
AAGCAAAATGACTAGTATATGGGAAATAGGCGGTTGATCTCAAGGCCCAAGTACAGTCAG
CCACTCAAGGCCCATAGGAATACCCCCATCTGTGTCAGCTCCTAAGGCCTGTGGTCACCT
CAAGCTTCTAGACTGGCAAGGTTGTGGAGAATATGCCTGGATGTCCAGAGACCTCAAGGG
GTTCCCCAGTGGTGTGGACACTCATGGTCCAGAACCTATGTGTCTACAGGGAACTGGAGC
TCAAGAGCAGGGAAAGCCCTGGCTCACAGTGAAGGAGGCGAAGGGAGCCATCATCAGAAG
CTGTGTCCAGTGTTCAGCCCATGGATGACAGACTCTGCCTACTGTGCCCATCCTAGGCTC
TAACCAATATGTGAGAACCACTTAGACACATGTGCATGCACATGTAGGGGTCAAGTGGGG
TCCCAACTCAGTTCCAGCAGCCGTCCAATGTGGACACAATTCCAAACACAGCTCAAGGCC
TCTGCAGAGGTCTAAATTTTTGCCTATTGCTTGAAAGGCTTTGCTAAGACCCCAGAAAGC
TGAGGACTGGCTGATTACAGGTTAGAGAGATTCCCCAGGAGCACAAGCCTGTATAAAATG
GAGCCTCTCTTTTCCTGCTCTCAAGTAAGGAGAAGGAACAAGGCTTTTCCCAGAACACCC
CTACCTTCCATTATAGGTCCTTGTCCTTCCTGCCACCATCGGGCCTTACAGTGCTCCTCT
GTCGGTTGTCAGGCAAAAGGCAGGACAGGGGGTGGCTGTTTGGAATATGGGCTTATCTTG
GGCAGTTTACTCACCAGATGCACACCCAGGAGTGCTCTTGGTTTGATAAAACATAGAAAA
AGTCAGCAGTGGAGTCTTCTACAAGTATAAAAACCTACCTTTTTAAATATGTGAGGTTGG
GGGAAGGTTCAGGCAGCCTGCTATCATGGAAGAACCTCAAAGGGCCCTAAGGCAGGTGTG
GCAGACATTGCTCTCTGTGAGTAATATGGGGACACATCAGTGCACCTGTGAACTCCAGGC
ACACACTTCCCCCTCGGGGTTCACCTCAGGATCTGTCTCATCTCTATGTCCTCTCATTTT
GTTCATCTGGGTATAGGGAGCATTGACCTGGGAGGGCAAGCAGAGCCTCCCTGTGCACCA
GTTACCTTGGGGAGCCCCTATGTGGCTGCCCCCACCATCCCCACCAGGATCTCTCTCTTC
TCTCTCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGAAGAGCTG
GCACCTGCAGTGCAGTCATTCTGGTTTCTTTTCAGGACCTGTGTCAGCTACCCCCCAGCC
TGGGACAGAACAAGTGTTTTTCTGCTCTCAGAGAAGCTGCAGTGTGAACTGAGGATGTTC
AAATTCACCCTGGGTAATGGTTGACAATGCCAAAGCTCCAGGGGCTTCCACTTGCTGCCC
AGGGACCCTGATGGCCACAAAGGCAGATTCCTGAGGTTAATGTCTCCTGCACAGCTGGAA
ACATAAGACGTCTATTGCAGAAGGGCCCTGGGCTTGTAACCACAGAAGNNNNNNNNNNNN
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