SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001032_2.0
Identity
PromoterIodothyronine deiodinase 1 (DI1)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Promoter IDSPR00001032
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000967_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001032_2.0 # Promoter # Iodothyronine deiodinase 1 (DI1) # Cod (Gadus morhua) Full length # Reverse
TTGTCTCTTTTTCAGGTATGGTTGGGACCCTTGCACCAAAAACGCTAGAGTCACGGTTGT
AGGGTAACCACACTCGCGAAACTTTCAGACGAAAACTTGGCCCAGCCCCTCCAGTCTTTA
TTATTGTCCGATTGTACCGTAATGTTTAAATTATGCGCGCAAAGAAAATAAAAATTAACA
TCATTTTGACTATAACCATTGAAAAATGCATTTGCACTAACAAAAGCGCAACATGACTAT
AGTATCGTTCTGTTTTTGAGGCCTACTCCGTTTTTATCAATTCCATTTCTTACCGTAACA
GTTTTACAGTTTGTTTGCTCGGAATTAAAAAAAAATGTCTTCGTTTAAAACATCTTTGAC
TAAAGTAACATCACGATATAGGCTGGCTTGTTCTCGATGATGCACCCATATCCCCTTTGA
GCAAGTTGTAACCCTAAACCCATTATTCTGAACATCGTTGGTAGATATCGACGCTTGCCT
CTTAGCTCCGCTAGATGGCGCTCTAGTCAACCGGATCATCTTAACCNNNNNNNNNNNNNN
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TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGAGGAATGATGTC
GATTTAAATTAATATTTAATTTATCTGATTTAATTTTGTTTGTGTCACTCACAGCCCTCC
CTTTATGAGAGCTTGGCGTGGCTACATCGTTTAGCAACAGTTTCACAACAAGGATGTGTA
AATCAAAACAGTGTTTAAACACTGTCATTGTAGAATGACATGCTAATATTTTATTACAAA
AAATACATTAACAAAAAAAATATGGTTTCCTTGTAATCGTCTGTCATTAATTGACGGAGA
GACAGAATTGGAATTCCTAATTTATTGTGCGGTGTATTTGAAGCAACAAAATATACTGTG
CCTCTTTGTTTATCTAATTAACATGATATGGTCATTATCTGTATCATAAATACAAGTAAC
ATCATATTCACAGGCAGCCATGTGTTAGACAATAACACCTACCTTTTGATGGGTATAGAT
TATAACATCACAAATCACATCTCTTATATAATTCATTTTAGGGTAATGATGATGTTTTTC
ATTTATGTATGGGGATACCACTGTTGAAATTGAATTCTCCTTGCTTTCCAAGGATCTAAT
CTGAAAGGAATATATGGAAAATAATAAATCATTGCAGATATAACCTATGACAATATTGAT
AATAACACGTTTTGCCTGGTTCAGAGCAAAACATGAACCACAACCTTCCACTTGATCCTG
CAACTGCAAAACATTGAACATTCTGAACTAAAATAAATCCTCTGTTGCAAACCATGCCAA
TTTATAAACTTTACAATCATTAGCATACAAGCTACATTGTCAGCAGTGCATAAGTTACTT
GGAAAATCATTGCCAAGTGTCTGCCATGCTAAAGCTGCTAGCTGGAGGATGATACCGCTT
GGCTGGACCAAAGCTAGCCAGCAGCATCGTGTGCCGATTTGCAGTGCGATTTTCTCAGGA
GTGGCTGTGTCGGGAAAAAGTGAGTGTGGTTTGAAAGAGGGTGAGAGAGCTTGTGAAGCA
GTGTGAGTAAGCAAGAGTGAGTGAGTGATTGTGTTAGTGAGTGAGTGATTCAAGAGAAGG
TTAACAAGAGATTAAATAAGTGACTAGTACCAAGGATGTGCGTGAGGAAGAGAGGTTAAG
GGCTCAAGGAGACTAAGCTAAGTTTGTCTAGGAAACTGTCTAGGTAAGGATTCATTTGCC
TGGCTGTTAATTGGCTGACTGAGTGATGTGAACCAGGGTGAGTGTTGAAAAGCAGTGATG
TCATGCCTTAGTCAGATATGTGAGGAACTGGAAGGGGGAATGAGCTGATGCTGATAGGCT
GCAGGAGCTCAATGTTTGACAACTCCCCCATTTTAAAGTTTGAATTAATCGAACAATAAA
GTCCCATCGATCATCTGAAGTATCATGAGTACGAATCATATCGTAGAATTAGAACTACAT
ACAAATTGTTGGCAAACAAGTAACATTAGAAGTATTAGTACATCCATGAGCATACATATA
TGTATATTGAAGTATGTAAGCACCAGCACCACTATAACTATATTTACAAGAATAGTATAG
TATTATAGTCCAAGTATAGTAGGTATTTAAGTACAAGTAAAGTAAGAAATGTTACAGCTG
TTGGATTTGCCATTTAATGTTCTGGTTTAAATGTAGTCTTGTGTCTACTTCAGCGAAAAC
ACAGTTCGATCATCGGTCCATTATGCTAATAATATCTCTGCCCACTAGCAAAGAAAATAT
TTAGCTTGCAGGAGACTCTGCCGACTTGATACAGAAATGTTTGAATAAGCGCAAACTCGC
ATCATCCGATACCTTCCTAAAGTTGCGTCTGGCATGGGCCGCTGTTGCCCATTGGAGGGA
AAATGTTAAAATTAGAGGAGTGTGCTGGAATCCCACACTCAGTCAGATAAACGTTGGGTT
GAGTAATAGACTTTGGAGTCGGTCCTGTTGGCTAACGTAGTGTCAACATGGCGATGGCTG
TTTCCTGTTCATTTTGGTGT
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