SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001053_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein H (SelH)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Promoter IDSPR00001053
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000988_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00001053_2.0 # Promoter # Selenoprotein H (SelH) # Cod (Gadus morhua) Full length # Forward
GGTATCTGGAATCAGCCTCATCTGGATCATCTGTTCAGAAATGAAAATGAGTCAACTTCT
GCTGTTGGAAACTATTTCCGATACGCAAGTCTGCATCACCGGCAGGAAAACAATCAAATT
TGCTACTGTCACCAAACGGATAATTGTGCATTTTGTGCGAGGGCTAATTTCATCACTGAC
AATTTCCACAATGGGACCAAATGTTTGTTCTGGCAAGAGTCTGTTCTCTCTCTGCTGGAT
GGTCGCTCACTCCCACTGCTTTCTCTGTTGAATAAATTTGCCATCACTTGACAGTCGCCC
AAGAATGCTCCCCTCATTTCTCTTCCAATTAGTTAAAACCAGTCGGGTTTAAATGCTGGT
ACACAAGTCCAATGCACTGGTAGTTCGGTCATTAAATATTTCACTTTCGGTTTGTGGGAA
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GGAGTCACTCAAACTTGTTTCGGAGTTGCTCGAAACAAGTTTGAGTGACACACACACCCT
GTGGCCCCCAACAGAGAGCATCCTCTGGACGGGGATCAAGAAGGGCCCGCCCCGCAAGCT
GAAGTTCCCCGAGCCGGCCGTGGTGGTGGCGGCCCTGGAAGAGGCCCTAGAAGTGGCCCC
CAAAGAGGCCGTGAAGACAGAGTAGAGCCCCCCCTAGTGGAGGCCCCCACAGTGGAGGTA
AGCTTTGTGACCATGAAGTGACTTTGGGTTTTCATTGTTGTTTTTTATGTCATTGTGATA
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CATGGCTGGACCCAGTTAACCCCCAAAGGACCTTTTGATATTGTGAGTCATGATTGTATA
CTGTCTTTTTTGGCAAAATAAGAAAATCCGATGGATTTCTATTGTCAAATATATTTTACA
TCAGTCCCAAAAGACAAGTAGACGTTCTGTTCAAACAGTATTTTAGTATGTGTTTAGGAC
TGGGAAAAGCGATCAACATATCATTTTTATTCTACAACTGAAAACCGTGCTACTTTGAGT
GGGCACTTTCATCTGTTTATGTTATTGTTTAATACACTGTTTCTTCATTTTCCTCGTCAG
CCAAATATTCTGTCTGTTGTCTTTGGAAGCCGAATGAAGAGGTTGGACCAACGGGCGATG
CCCAGTCTCTCCTCTGATGAGAGTGCTCCGAGGACTACCATACATGGATATATGGTGACC
ACTAGTGGTGAACCTCTGTTATACCGTCTCCTGGTATAATCCTGCCGTTTTCACCGAACA
AATGTTTTCTTGTTTTTCTTCTGTTTTTAATTGTTAATGATAAATAAAGTTGTTGTTTTT
TCTAAATGATGGTAACTAAAGCCTGTTTGAAGTGTGGGATTGATGGTACATTTTAATGAT
GTATTATATACATTTAAGTTATATTGTTTATGGCAATACCATTGGTGGGGTCATTGATAA
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TGTAAAAGTTAAGAATATTTCGTGATAGCCCTACTCCACAAAGCACTGAATATTGAGGAA
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TTGGAAGTGGAGCATAGGGGGCGGTACAGCTCATGGGGAGGGGGTACCTGTCGAACCACA
GAGTAAGAATATCTCGACTCCTGAGCGTCCGCCGAAGAAGGAACACGCTCTTGAAAGTTT
GGCTCTCCATCATGGCTCCTAAAACAGGTAGCAGCGTACGTGATAGTGGGTCGTTGTCAT
TGCTCCATAACTGAATCATTGATAGTAGGCCATGCGGTCTTATGGTGCTCTCTTCCACGG
ACTTTGTTTGAAAAGTCAATGCCAGATATGAAGTTTGATGCACAGATGCCGTTCCGTGCA
GCACGCCAACGGGTTGACGTGTTTGTTTTGGTTTTACATTGAGGACGCTGATGAGGTCAC
GTGTCTGTCGTGGAGGTTTGTTGATTCTGGTGTTGACTCATCGTGACTAATGATCCCATG
GTTGTGAATGCAGGTCGTCGAGGGACCAAACGCAAGGCCGATGCGGTTCAGGAGGAGGAG
GAGAAAGTTGCGGTGGAGCTGAAGGAATCAAAGGAGGAGGTGAAGGATAACGACTCGGGG
GGTCGTAGAGTCATCATTGAGCACTGGTGAGCTCTTCGTTTAAATGTATATTTGGGTTTT
CCGGATTCCTATGAAATTATTTGACTAGATACCCTTACCAATAAATTGAATATCTTATGC
ATTCAGGTCAGTAGTAGGTGCAGTCGGATGACATGTGTGCCTCACGCATGTTGGATGCAT
CATACGAAATAAAGTGTAATTTCAACATGCTTTGAATTATAATAACATTAAATAATTTGT
CAAATGTTTTAAAATCATTGATGAATTGTGATGTAATAAAATTCAGTGCGCCTATACAAA
ATGTAAAACGAATGAATTGCAAAATTAGGACTATTTACCTGTCCTGCACACTGTCCATCT
TTAACGGTCCATTTACTCCT
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