SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001060_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein M (SelM)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Promoter IDSPR00001060
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000995_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001060_2.0 # Promoter # Selenoprotein M (SelM) # Cod (Gadus morhua) Full length # Reverse
ATGACACAGGAAACGTTATCAGAAACAGCAACTGGTAATAAGCTTAACAGAGTATGTTGA
TTACTAGATTTGCTTTACACTATGCTGTAGCGCGGTCACCTGCTGCCTCCTATTATACCA
GTGATTAGGCTCCAGGGCACTTCGGTTCATTCGATACGTTTTTCTAGGCCAACCTAATTG
TTTTGTTGGCCCTGTTCCCTCGGGCCCCACGTATTTTGCTCTCTGGAACTCGACACCAGG
TGTGAGCTGCTTTACAACAGCTGCTTCCGAGGTGGTGTGGTGAGTGTTTACACAAAGAGG
AGGGTAGCATTTCACATAGAGATATATAACCTAGATATGTCTTTGAGACTAGGAACTAGA
CATTCTTCAATATATCTTGTCAGATTTTCAGGTTACTAATGTATTTTAATTCACAAGTAG
TCTATACGTACATCCTAATATACATACATATGGTTTTAAAGTTAAAGGTGAGGCTGGCTG
CTCCTCTCTGATGTACGCTGCCCACATCCCTCACGCATGCGCGAAGCAGGAAATGTGGGG
ATATTCAAATATTCATTCAAATACCAAAACATAAAAGGTTTATTATTGTTATTATTGAAC
ATTACAACTCTTATCATCGTGTAAATGAACGGTAATTCAGCATAATACCGTAATAACGTT
GACGGGAACCTACCTCCACCTTCGCCTTCGCCAGACCATCCAGTTTCTTCACGTCGATCT
CGTAGGTCGACGCGCAATGGAGGAAACTGGAGAAGACAAGCAGCCAGATCATCTCCCTTC
TTTACGGACTGGGGCCTGAAAGAATCGGAGATTCTAGGTCCTTTCCTGGAAGGTTAGGTA
ATGATGGAGAGACGAAGGATGATATGTGTGACTGCGTCCGTACCGTTTGCCACGTCAAAC
GATTCTCCTCCTACGTTCTGAGAGACAGGGGCGGGCGTAAGACAATACAGGGGCGGGCGT
AAGACCTCCAATTGTGTGAGAAAGGGACGTGAGTATGACCTCTCGTTCAGCGAGACAGTG
CCTGGTGGCGTAAGACCTCCGCAGACATACTGCGGTGGGGGGCTACAATCTTCACCCAAA
GGATTTGGAATAACTATTGAGCATTACCTAAAAATATCAGGTTCTGGTCATTATAAGATT
ATAATGTAGTAAATATAAAGTCACCATTTGGAGGATGTTTCCTCTGGGAAGTAATCCTTG
CTCTACTGTCAGGAGCAAGTTATTTTGAATCTGAACATTCACTACCAAAGATATAATTAA
GTAAGCGTTCTATAGTAAAAAGCTGTTACTTATATTTAGTGTTTAATAGAGAATATATTA
ATTTAATAAATCCCCTATGGGATTAACAAATAATGATAAGATACGTCGACAGGCATGGTT
TCAATATCATTAAAGAATGTTATTAGTGTCTATCTTAATATATATTTTACGTCATGTCTG
GCTACATCACTAACTTGATACATCAATGCATTTGAAACGTGAGCGTCCCTGGTCAGGGTT
TGAGAGTATCTGATGCATGCTGTTATGGTCTGTACAAGGCCTTTATCGCAGAGGTGTATC
GGATGATGTTCATTATGGGCAATCAGCATACCTACATCCAATAACAGATGAGCTGCCCCC
TGATTTCAACCCTATTAATACTGTTGTTCTTTTCTTTTCTATGTATCTGTATCATGTTCT
ATCTTGTTGATTCTCTAGCGCTGAGGGAGTCTTATACGCCTCCTGGTGCGTGTAAGACTC
CTGGTCATTTTCCTGTGTAGGACTATTTGTAGTTATTCTTTTTATGTAGGTCTACTCCTA
TCGTATTCGTTTATTATTATGTGCAAACGAAGAAACTACCAAATCAAAGGACCATTCTTG
GGTCCTCACGTTTCCCAACATGATGAGCCACTAGGGGGAGCCACGACCTCAGCCTCCCCA
TGGCGACTCGGTCCTCCACTAGCGGGCTGCAGAAGCCCGTGTTGGCTTTACGGAAACGAC
CCGATCACGTTTGACTTCTGAATCCGAAGGACACAGAAACGGTTACGCTATTCGGTGTCC
CTCGATGCGTTGAACCGATACTTTCCAGGCGATTTTGTGGAGGGAATGAACAGTTAAGGG
TCATCATGGGGCTGGACGGTTCCAGCGAAGTAGCCGATGAGATCTGCTCGACATTATTTC
TTTAGGATCCCCTCCAGGACCACCTGCTCTCCGGTCCTCGGTGCCCTACGCTGGGATGCC
CCTGGTCTCGTGTGGGAAGCGGCTGACGGGTTAAGGTTCTGAACGCTCGGTTTGACTCAG
AGGACCACCTGGGTCCTGGTCGTCTTCAGGAACACATCGGGTCCTGGTCGTCTTCAGCTG
CGCCCGTGGATCTTCGTCCCGTTCTTCTCCAGGCGCCAATAGAACAGGTAACGCATGACG
TCAATAACAACACCCATCCGTCTGGGAGAAATAGCGTTGAACGTAAAGCCGAGCAAACCG
GGTATTATTACACATTTTCGATGGTTGGAAAGGGCAAAAAAACAAAATGTGCCCGAGGTA
TAGTATGGATATCTGATAGAAAACAGATTGTTCAGAGTGGTCCCCGCTGGCAACAACGGT
ATGCTGCACAAACTAAAGGCTGGTTAGTTGTGGACAGTTGCTATTTGCCGTGTCAGAGCA
ATTATGAAGAAAATAGAAAGCCAATGCAAAGCCACTAATGCGCGAAGGTGATGTAATGAA
GGCTGTTGATTGCGTTTTCTGACCAAGTAGAATTTGAATTTGGATTTGTCTTGCATTATA
ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC
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