SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001061_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein N (SelN)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Promoter IDSPR00001061
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000996_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001061_2.0 # Promoter # Selenoprotein N (SelN) # Cod (Gadus morhua) Full length # Reverse
TCCTGCCCTCCAATCCAGATATGGAGACTATTTAGGCCATACTGTGCAAACAGCCTCCTT
GACTGAAATGATTTATTGTAATCAGGAAAGAAACGGACCACTTATAATCCGGTAATATAC
TGATTTGCGGTATTCAATCTCACCACTGGACTACAGAAATGTAGCGTCACCAGTTAACTG
TTTACCCTCACATCCAATCAGAACCGAGGCTGGGCTGCCTGCTCTCTTAAAGGGCCAGCC
AGTCGGAACCTCGGCTGTCTGATCCCATATCATGCTTTTTTCGAGTTAATAATTGCATTT
TGGGGTACTACTAGAATAGTGTTACATGCCAGTATGTGGAAGTTGTTAACATTGCGGGTA
GGCGGGAGGCAGGACTACTGCCCTGGAAGTAAAGTTTGAGCGCAAACGAGCCGTTTCACG
CACTTATACAATCCTGCTTTTAACTTGCTCTGTTCCTAAACCAGGCACCCCCGCATTGAC
CACAGATTTGTCCCACTTATCTTTATGGAGTCAGAACAGTCTCATTNNNNNNNNNNNNNN
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CTCAACGGTAGTAATCTGTTCATAAAGCTAAAGACAAAAATTGAAATTGACACAATCACC
CAGTTAGTTTTCTCTCCATTTATTTAATCAAAATTGACATGTAGGTCATTTCTGTTAGAC
ATTTGAATTACACTATTCACTCAAATATAGATAGTTTATTTAATATTTGCATGGGAAATC
CTTTTGATTAGGACTTCAAGTAAAGATTTTAAAACCATAAATATAGTTTTATTGATCATG
CATACAATAACCAGTTATGTTTGAGTATCAGAACGATAATACACAGAGTCATTGTAGGGT
CAGGAAAAGTCCATTCTCAATTCTTGTAGGGTCAGGCACAGTCCATTTTCAATCCTTCCA
GGGTCAGGTCGAGTCCATATCACTCCATTTCCTCTTCAATGGGCTGCGTCGTGACTTCTA
TCTTCTTGGGGGCGATGAAGGACCCCATGCCGGCGGCCCTCTCCGCCTCCGCCTGGGTAT
AGGGCTCCTCTCTGAGGAGCCTCAGCCTGGAGAAGGGGGGCAGAGAACCAGACAGCATTA
CCATGGAGACCAGAGTCACCAGACAGCATTACCATGGAGACCAGAGTCACCAGACAGCAT
TACCATGGAGACCAGAGTCACCAGACAGCATTACCATGGAGACCAGAGTCACCAGACAGC
ATTAACATGGGGACCAGTCACTAGAGAGCATTACCATGGGGATCAGCATCACCAAACAGC
ATTACCATGGGGACCAGGGTAACCAGACAGCATTACCATGGAGACCAGGAACTCATTTGG
ATTCCCTTAATTCACCTATTGTTATTATTAATATCAACATCATAATCGTCATCATTAACA
ACTTGGAATGATGAGGGCTATTCTGGATTTTCTATACATATATTGGTCGAGGCTTGGTCG
AGGCTTCGTCCAGTATTGGTCGAGGCTGTCATACAGCGCGTTGGAAAAAAAAAGTTTGAA
CCATAGTGCCAATTAGGAACTCGTGCCAAAACAACATTGATACATGTATATTTCGTTTTT
GACGGTAAGGATTGTATTTTAATAAAGAGTTGTAATATTTAAGAGCTAATATTTGAGCAT
TATTTGTCTGTCAGCTATTAGAGGGTGAAATGCGCCGAGTTGATTTGACTGCGTTTGAGC
CAGTTTGGATTTGAGACCGCTCCTGGCTGGATTATGGTCGTTGAGTTTCAAAATCTTGCA
CTCTTCTGCTCTATTATGCTCCTGCTTCAAGATATTGATATTAATACAAATAAACATTTA
CATAAATAAATGTATTGCTTGAATATGGTATCTTACTGTTTTTTGTGGATTTTTGTTTTG
AAATGTTCTTTCAATGACCT
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