SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001141_2.0
Identity
PromoterMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesGasterosteus aculeatus (Stickleback)
Promoter IDSPR00001141
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001076_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001141_2.0 # Promoter # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Stickleback (Gasterosteus aculeatus) Full length # Reverse
TTGACACGGCAGCAGCACCGACACACTCCTGCTCCACACCGACGGCTAGCTCGGCTAGCT
CAGCTAGCGTAGCTACACAGCAGCGACCTTACTTACCTAACGTCAACGCGAGGCTTGTGT
AAGGTCGAGGTGCCCACGTGTTACACAACAGTGACAATAAACAAAACGCCCTGCGTGAAT
GGATCACGTTCGCACGTAGTGAATGACATTAACATTAGTCTCTGAGGACCTAATCAGGAA
ACCGATTCCAAGCAGTAAATGTTTGGTAAAATTATGAACTTTCTCCTCATTTTGTTGTTC
GATTAACTATCTAATGTGCAGCACGTGTACGCCGAATTTACTCATACATGCAGATTCAAT
ATGTGCAATGTTTCCAATGAGTATAATTACACGTGATACAATTATGAATGGGGTTTGACA
TTGTTCAAAGTCCAATAGCTTTGCTTGAGGAAAATCACCATAGACGTTTTCCAACTGTAT
TTCAGTGAAGGTGTTTCAAATTTTGCTGCTTATTAAATTCATTTTTTTTTTTGCTTACTT
ATGAAAGTATGAAAATTATAATCAGCGTTCGACCCATAATCTTGACCGAAATAATGGCAT
AATACTCAGTTGAAGCCACTGGCCTATTTAAAAGCCTTTAGTATTAGTTTTGACATACAA
GCACAGCTTTCACACATAAAGCCGTACAACACAAGCAAAGTAGAAAGATGAAGCTGTGGT
GTACTAACTTGTGATTTCACCTCAATCAACGTGTGTTTGATTGAGGTGAAATCGTGTTTC
TGTTTCCTTCCCCCTTTTCAGATGATGTTTCATATTAGTCTTTCCAGATACCCATCTTGG
TTATCAAACAAAACCCCTGTTATTAGTCAATTAAGGTAAATGTTACGCATCTTAACGTGC
TGTGCTCAAATTATCATTGTGGAATTTATATGAATAAACTGACCCCCAGACACTAAAAGC
AAAACTTCAAGGTAGAACATACAGGATAACAGCACTATACGGGGTATCGTGAAAATAAAC
ACTATAAATGAGAACATCAGTTGATCAAATATAAGCAGCATAGAAAACGTGTATGTGTAA
AACCGTGCGCACCATCCCGTGTTATTAAGAATATCAAGGCTTGTGCGTGGTTTGTTTAAA
GAGAGCCGGGCTCTTTCAGATGGAAGCCACGGATTTCATGGATCAGACGAGAGCACAGCC
CCCCATCACTCCACCGGTTTGCAGTATACGCTGAGTAGGAGGGACGGCTAAGGGGGAATA
GATGACGAGCGATAAGGAGCCATGGAGGAAATGTTGCTCGCGTCGGCAAAATATAAACGA
CTTTCACCCTTTGACAGTAACGGCGAGGGTCATCTATAATTCAGAATGAAATGACAATTT
CACATTCCAGCAGAGAGGACGGGAGCAGATGGAGTTTAACGTGCATGATGTTTTAAGGGA
AGTGGTGGAATAAACATGTACTTTTACGTTACTTTGCTTGAGCACAATTTTGACATTGAA
TTAAAGTCAATCCTCTCATAGATGATAAATCAAAGCATTGTCTCCTTTTGCATATGCATT
ATATAATGCATATAATATAATGCTATGCTCTGTGTAATATGGTGTTTCCTGAAACCATTT
CAGTGAAACCACCGCATTAACAACGGCTAAGTACAGAGTCGGATGTTTCAATTGGTTTGC
TTTGTGAGGCAGATGCTCTCACTCTTTTTTTCCTCCCTCCATCCTCAGGAGAGGATGACA
AGCGGAGGGAGGACAGAGCTGGAGCTCCATCTGACTCCCTCTCCTACGGAGGACCAGCCC
CTCCCCTCCTCCTCTCTCCTCTCTCCCTCTGACTGCGCCCAACTTCTCTCACTCCATCCT
TCCATTCGGCTACTGTATCCACCTCCCGACTGCACCCAGCGCACACGACACCTTGTTTCT
GAGGGGTTGAGATATCGCCTGGCTCTAGTTCTCTTCTGGGTTTGGACTATTTTGTGCATG
AAGATGTTTTCTGCAGAGAATTTAAAAAACAAAAATCTCATTTTTTTTTTTCTTCATTTT
TTTTCTCCAAGTCAGCTGCAGAAGAAGAGCGGTGCGACCTCCGCATCCCCCTCAACATCC
ATCCCCGCGCATCCTCAGCATCCCTGCGTGGACCTCCAGAGGATGACTCCGCGGCACCGC
GCCGCGCCGCGCCGCGCACATCAGGGCGGCTGGAGAGCGTTCTATCGCCGGACGAACAGG
AGCTCCGGGCATCGGTGTGTTTTACGGAGGTCTCAGATGCATCAAACGTCGGTAACCGTC
CGGTGATGGTCACAAAAAATAGATAGCTGCGCAATCTCTCCATCAAACAAGCGATTTATG
TGTTCGGTCATTTAAGTAAATATCTTATTTGAGTCTTTCATTCATTTCCAATATATATCA
TTTTCAGGCCTTGTGGTTTTTAACCCCCCCCCCCCCCTCCCCTCTCTCACCCCCCGTCCC
CCCTCCCCACCAGCTCCTTTCATCTGCGCTAAATCCGCTCCTGCAGCAGCCGCAGTGGGC
TGTCGTACTCTGCGGAATCTCTGTGTGCGTTTAATTATTATTTTTTCAGTTTGACCAAAA
TGCCACATGCACACACTAAGTACACCGAAACGCATCCTTAATGTAATATATGCACATTTA
TAATATTATAATAGCAATAGACTCGTCGTTTTTATTTCATAAAACAAAAACCAAAAAAAT
GTAATTAATATGTAGTATGTTATAATATAAGTTATTGAAGATATTCCGTGTAATTGTAAG
AATTGTAGACATTTTTAACGCAGGCTTTGACACAAACGCCCGACCCCCACAAAGGCAGCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACTTTCTGTCACCGGCTAACGGCTTCGGATTAAGAGGGAT
AAAAGACAGACAGTCCATGTGTCCAATCAGAAAGGTCCGTCCTCTGCTTCCTGCTATGAG
GCCCTACCCTTTCCGTAAGAAGTTAATGTCGTTGTGCGTTCCTATTTGCCCTTGTGTTTC
GCACTTCAGGGCCACCGTAGTGGTAGGAGCATCCATCGCTCGTCGCAATCTTTGGAGGCG
TTATACGCAACTCCGACTGGTGGTCGCAAGGCTACAGGCAAAAGCGTCACTAGTCTAGTT
ACCTTGGTGTTTGCATCCAAGGCAGCAAGCCTGCGCTGTGAAAAGATGAAAAATGACTGA
TCACAGGCTGATCCCGGGACTCAATGACTGTGTCATCAGAGCTCACAACTGACTTTGTTG
TTATAAAACACTCCACTTGTGCGAGACGGAGGATATCCAGTGTGAATCACTGCCTCTCAG
GGTTAGTAAGGATGAAACAGAACAGTGAGTGTTTTCTGTAGTTCATGGCTTCTGCTGCTT
GTCATATATGCCAGCAAAAATATGTGCAAAAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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Chart Advanced