SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001147_2.0
Identity
PromoterSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesGasterosteus aculeatus (Stickleback)
Promoter IDSPR00001147
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001082_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001147_2.0 # Promoter # Selenocysteine synthase (SecS) # Stickleback (Gasterosteus aculeatus) Full length # Reverse
TCTCTGTGAAAGAAACAGCTTCACGTCAACATTAACGGTCTACTGCCAGGCACAATATTA
GTTGTACTTAAATGTGGAACTGTAATATGCAGGAGAAACACAGGATAATATAATAAAATC
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CAGCAGTTTTTCAGTCACCTGGGAAAGTTTTTGAGAGACTGCTTTACTTTCTCTTTATTT
GTCCTTATTTCACTGTTTCT
Chart Advanced