SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001177_2.0
Identity
PromoterPhosphoseryl-tRNA kinase (PSTK)
SpeciesGasterosteus aculeatus (Stickleback)
Promoter IDSPR00001177
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001112_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00001177_2.0 # Promoter # Phosphoseryl-tRNA kinase  (PSTK) # Stickleback (Gasterosteus aculeatus) Full length # Forward
CTGGTCGGCATCCAAATCTTTAAAGGCAGTAACCCCTTCAATGTGGACGGCTCCGCCGGA
CAGGTGTTGGGCGACTTTGTCCGGTGGAGGCGGGATGTTTTGCTGCCAAGGATCAGACAT
GACGATGCTCAACTCATTGTGTAAGGAGTGTGTTCTTTCGTCATACTCGGAATTCAGGGA
TGTAGATTCAAGCTTGTTACTCATCTCTCTGTAAACTTTGTTCCCAGTGGTCAGCCTAAT
GCATACAATGGCAACATATTAGGTATGGCCTTCGTGGGAACGGTCTGCCACGTAGGGACC
GCCGGAGGAATCAACGTGGTTAGTTCAACTCCCTGTAATTACTAAACACCATCTGTCACA
TCATGCTTTGGTAGCATGAGCTTTTGTTAGGAAGCCGATACCATCTTCATTATTCATGGG
GCATTCTAAAAGTGCAAATTCATTCTCACACCCTCCGAGTAACAAGTAAAACAGGTTAGA
CTTCAATTCTTTAACTTGTGATGGTCAGTGTGAGTCAATGATTGAACATTTGTTGCCATT
TTCCCTTCCAACATGGCACATTTTCTTATTTATTTCCAACGTTTTTCACATTTTTGAAAG
ATTCATTCATGCCAGTACATTAGAAACGTAAAATCAATCACACGAAATGCTCTTTTTCAC
TGTGAATATTTATATACGTATTGATTGACTTACACTTGTACTTCAGGGTTGTATATTTAG
ATATATTGACAATGATGATTGTTGGTACTGAATGTGTGTTTTTCCCAGTTCAGTGCGAAC
AACCTGCTTTTGGCCTCCGTTGTGGTGGCCCATGAGATGGGCCATAATCTTGGCATGATG
CATGACCGTGACGGATGCAGCTGCAATGGGACCAGTAGATGCATCATGGGTGCAGCTGTT
GGGTAAAGAAAACCTGCAGTTGCATATACACTCAATTTATGAATTCAATGTGATCTTTTT
CATGTTTTCACTTTTTCAATCAGGTAGGAATAGAGAAATAAAAAATTACGAAAAATAATC
ACAGCTCAAAGGTCCAGGATTTTTCTGGCCTGTCCAATTGAACATATCCATTCATTTTTA
TTCTGCCGTCTTGTAGGGGTGTCTCCACTTTCAGCAGCTGCAGTGGACAAGACTTTGAGA
ATCTGATTGTACGTGGAGGAGGCACTTGTCTGAAAAACCAGCCCTCCCCGTCAGATGTGG
TTGGTGTAGCTGAATGTGGCAATGGCCGACTGGAGGAAGGAGAGCAGTGTGACTGTGGCA
AACCCGGGGTAGAGTACTGCTTCCCAGATAAACAAACACACATGCACACAGGATGTTTTT
TATTTAGTAGGATTATTGTATCGGAGAAGGATTTGTTTGATACCTCATTCCACATTACTG
GTGTTCCGTTACTCGATGTTTGGAGATTTATTTTTTTTTACCCACAGAAAGTTATACCAC
GCAGAAAATATGTTGTGGAAAATATATTTTCTTTTAATATATATTCTGTACATTATTTGC
TAGTTTTTTTATTTTATTACTGTGGTGTGTATATGATTCATCTGCTTCTATTTGCTACAG
GAGTGTAACAATAAATGCTGTGATGCTGCCACCTGCAAATTGACATCTGGTTCGGCCTGC
GCTCAGGGAGGCTGCTGCTCCAACTGTCAGGTGAGCATTATGTTAATTCCAGAGTTATGT
AGTTCATGACTCATTGAATGAAAGCAATGTTTTGCGCGAACGCTTTTTATTTTAGATCAA
AGTTGCTGGAACGCCATGCAGAGGGTCTGCCAACACGTGTGATCTTCCTGAATACTGTAA
CGGCACGGCTGGGTTTTGTCCCAACGACTTCTACGTCATGGACGGCCTGCCCTGTCAAGA
CAGTCAAGCTGCTGCGTACTGCTATGAGGGTCGATGCCAGACGTATGGTTTCCAGTGCAA
ACAACTCTTTGCACCAGGTACATTTAATAATGTGTGAAAAGAGACCGTTGCAGCTAATTA
AACCTCAAACTGTGAGATGTGTTTACTTCTGTTCATTATTTCGGTCTCTAATGTATACCC
GTTGTGCCAGACATGACTTTTTTTTTATTTTTTTATACTTATATCTGTTTGTGTAAAACG
CTTATTACCCAACCCAAAGTGTAACAAGAGGCCGTGGTCACCTGGAAAGATATTAAAACA
CGTCTCCTGCTATTAGTGTTATTTGTTGGTTATTTTTTCTCTTTTCTTTTTATTTGTAGG
TCCAGCAACAAAGGCCGCGGATATTTGTTTTCAGAATGCAAATATGAGGGGAAACACGTT
TGGGAACTGTGGAATTGGTACCAACGGAGTTCCTATCAGATGTACTTTAGCGTAAGTACT
GTAGTTTTTCATTACTGAATCATATGAACTAAAATGTTCTATTTCTCAAAAATGTAACTC
ATTAACAACTGTGCTCCCTTGAATCTGCACTGCAGAAATTCCATGTGTGGGAAGTTACAG
TGTACAAACGTGGACGTCAACAACCCCCCTCCAGGTGCCCAAATCAGTGTCGAAGTACTT
GGGAAGGAAAAGTGTATAAATGTAGACTTCAACCTCGGCACAGATGTGCTGGATCCGGGT
TACGTGAACTCTGGCAGCCCTTGTGAAAATGGAAAGGTAGGCAGACAAACCATTTAAGAA
GTGTACATGCCTAAGCGAAGGAATGGAATGCGGACCTACTTTAATGACGTCTTCCAGGAC
AATACTCTCATTGTGAAAGTAAAGTAAGTTATGATTCCTTATGACAGCGTCATCTTAAAA
ACCTTCTCCCTCAGACCTGCATAGACTTCAAATGTGTGAACGCCTCTGCGCTGCTGCCCA
AGCTGAACTGTGATGCCAGGGCAACGTGTAACAGCAAAGGGGTTAGTCTGCATTGTATTT
GCTTTTGTTGAACTTTTACTTAGTTACCAGCCAAAATTTACCAGTGTATCTTTGCTGTTG
TAATGTTTTCTTCAGGTATGTAATGACAGAGGGAACTGCCATTGTGAAAACGGGTGGGCC
CCACCTAATTGTGACCGGGCGGGACGCGGTGGCAGCATAGACAGTGGCCCTGCTCAGATC
GGTGGGTTTGAATTGATGTTTTTACTTTTCAAAATAAAATGCACTCTCTACTACGTACAG
TCCACTTACATGGCACACTTTTAAACCTCAATATGGATATTATATAAAAATGTTGTGGTT
AATGTGCATCAATAGATCGGTCATCAGTCCTCTATTCTGCTTCATATTAGAATCAGAACC
ATTCGTGGCCAAGTATGTTGCACATAGAAGGAAGTTTTATTGTCAGGATAATAGACAAAC
ATGTACAAAAGACAAGAATAAAGTGTCCAGTGTATTATATATTAAATGTAGAGCAAGATG
GGGGAAACCGAGTTAGCGGCGGTCAAGGGCTTTTTTTTTTAGCCCAAATGCTGACGGTAA
GATGCTGTTTTTGTGGCGAGAGGTGACTTTTTGTCTTCTATTTATATGACGAAGGATGTG
TGGTTAATAGTTACGTCTGTTGTTGACACACCCAGATACAAACCGGTTTTAGTCTTTGAT
AATTGGATGCACAATATTGAGCTTAATGGCTACTAATGCAAGTAAATATAAGTTGTACTG
TAATGTTTGCGATTCAAACATGATCTTTTCTACCACAGACCACTCCCTCAGGGACGGATT
GTTGATCTTCTTCCTGTTGGTGGTTCCTGTTCTTATCGTTCTCATTCTGCTGCTGCTGTA
CTTCTTCAGGAGAGAAACCCTTGACCCATGCCTCAAAGGACGACACCTTAAGTAAACATC
AGCTCAAGTTAAAAATATACCTCAAGATACTTTATGGGCTGTAGTGTTTTATATTTATAT
GGGAAAAAAAGTACTCCTTCTAAAATGGTTTTGAATTTCACAGGTCGCGTAATGTTCCGA
ATGGAAATGCGAATGGGCAGCCAAACGGCATTGTTCAGACAAGGGCCACAACTCAGCCTC
CATTGCAGGCTCCTTCTAATGCGGTAAATATGTTTACTCTTCTTAGGGATTATCACTGCA
GTGTTTTTTTATTTTCGCAGTAGGAGGATCTGTCTTTCATTACCTGAAACTTGTCAGACA
AGAGAAAAAGGGAAATCAATCAAAACGTTACTTGTTTTTCTTCCAATTCAAGCCTGGATA
TCCACCAGCTACCGTAACTCCAATTCCTGGGTACGAACTTTTTTTTTTATTTCAGTAAAT
CCATATTGTCCTCCAACGCACAAGGAAATATAAGCTTGCAATGCACAAGCTGATCACATG
TAACTTAATTTCCCACTCATCCTGTCAGTTTCAGGTACGGAGATCTGGATTATTGGAACG
CGGATGAAAATGTGGCCCCTGCACAAGCACCAGTTCCAAGGCAGGGCCCCGGAGTACCCA
GACCAATCCCTCCCAGGAGGATACCTACTTGATTATCTTGTTCTTTAGCATATTTTTTAA
TATATTGTGAAGATGGTTATTAAAGATTAACACTGTATGAAGAGAAGTTTTAAACGCTCT
GAAAACAAAACCCCTACTCTGAGTTTAAGGTCTGAGTGTTGGTGGGTGAGGCTTATAGAC
AAGTAAAGACTTTAATATGTGTTTTATCTGTTTACCTATTTGAACTTCATGCACATGAAG
TATCTCTTTATCCCTTTTTTGTATTTTATGGTACGTAGACTTTAAAGATTTTGATATCAT
GCCTTTAAACCGAATAAATAACACAATTTATTTCAACTTGTTTCGTTGTGAATGTTTGTT
TCTCAGAACTCCTGTAATAGCCTGAATAAAACGACCATTTATTATTTTATTGATAAAATA
AAAGCACTGGTACAGTTTTCAAGAGGTCTCTCAAGCTATCCAACCTTTTATTTTTTTATT
TTGAAAGGCATGTTGACGGAAGTCACGTGTTCTGTTCAGCATAACACGGAAGTTATTTTT
TATTTGCTTTCCGCTAACAACCGTACCCGTCGCCTAAATGTGCTTAAATGTCGTTTTTTT
AAGCGGCTCTCTGGTAGCAC
Chart Advanced