SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001260_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein N (SelN)
SpeciesIctidomys tridecemlineatus (Squirrel)
Promoter IDSPR00001260
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001195_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00001260_2.0 # Promoter # Selenoprotein N (SelN) # Squirrel (Ictidomys tridecemlineatus) Full length # Forward
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GAAGAAAGGGTAGGGTAGGCAGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAG
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ACCTCCTGAATACGGTACAGCCAGGTCAGGGCCTCCCTCTTCCCTGGGTGGGTGGAGTGG
CCGGGAGTGTCCACTGCAGCAAGGAGTGTGGGGACCAGAACTTCCTCACCTCCAGGCAGA
AGCAGGACAGTGGGAGGAGAGGCCACGCCCAGCAGTCTGCAGCACATCCCGTGGCTCAAT
GTCCCTCTCTTCTGGGGACTCTGCATTGTCTCCAGGATAAAGTCCAGACTTTTGTCAAGG
TAGCCAGAGCCCAAGCCTGTCTCTCTGGGCTCTTCTCCCTTCAACTGCCCCAGGTCCCTC
TGCTCGAATCCATGGCCCATGTCCTTGCAGTGCCATGGGCACTTCATGCCTGTGGACCTC
CCTCTGCCTCTGCTCTTCCCACATGCTGTGATTGGCCACCTCTGGGTCTCCAGCCCGCTG
GACCTCTGCTCTGTGCAGCCTCTTCTGAGTGAGTCAGGAGGCCCCACCTCTGCATGCTTC
CCTCTCGGGGCACACGACAGGACAGGGGTCACAGTGCCCTCTGACATGTCTGGAGGGGCA
GAGGCTGTTTTGTTCTCTGATGGAACCCTGATCCCAGAAGAGACTGGAGCAGACCCTTAA
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AAGCTCTCAGGGGGCCCCTGTGAGGACATAGAGCCAGAACACAGGGAAGGACAGGTTAGG
CTTGCAGCCCTGGAAGGTCCCTGGAAGCCACCCATCCCACAGACAGTGTGGAGTACCTGT
CCTGTGCCAGGCCCTGCGGGGTAGGGGGGGTGGGGGTGAGAGTGGGGGGGCTGGGAACGC
CTGGCCCTGCCTGCTTGACAGTCAGGACTGGTTATCACAGAAGGACAGAAGTAGCCATGG
TTACTTCATGCCTGTGGACCTCCCTCTGCCTCTGCTCTTCCTACATGCTGTGACTGGCAT
GTCCATCGACCCCAGCTCAGTCATGTGGGCCATTCCCTGGGTTGCCTGGGAGGCAGGATG
GCAAGAGATTTGGACTCAGGTGCAGTACATAGAAGGGACTTGGAATCCATTAGAACCGTC
TGGCTTCCCAGACCTGACAGGCTCACCCGGACTGGAATTCCTAGTGATCTCCAAGGCGTG
CTGTTCCCACCCTTGGCCAAGTGACAGAGCCACCCACTGCCTCCCCGGGCCTGAATATAA
TGGAACAGAGCCTGGCAGGAACCAGGGCTTCTGGGCATTGACAGCCAGGAAAATATTTCC
TCCAACTCCCCTGGCCTCCTTTCCCAAGGCCCTCCTCCAAGCGTGCCAAGCATTCTCCAG
AAAAGTCACTCCTGGGCCACCCAGGTCCCGCAGTGGAGAGGTGCGCGGTAACTCACAGGG
TCACCACCCGCCCAGGGCTGCAGTCTGCACATCCACCAGCTGCGGGTCAACAGACCTGTC
CTTCGCTGGCCTCCCTCCTGCCTGTCCGCAGAGATAAGGTCGACCNNNNNNNNNNNNNNN
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GCAGTGGAGAGGAGCGCCCTGGACAGTGACCACAGACAAAGGCAGAGTGGAGCTGGGACG
GAAGGCACCTGGAGGAAGGCACCTGGAAAGGGACGGGGGAGCACAGGGATGTGGGAAGGG
GAGGCAGGAGAGGACTGTGGCAAGAACTGGGTGGAGCAGGACAGAACCAGATGGAGGGGG
TCAGAAAGGTGGGATGGATGCCGATGGAGAGGGGCTTGGTGGACAGCCGATAAAGGCACA
GAGTGAAGCAGGGACCAGAGGATCTGGAAAGGGAACAGGGGACTCTGGGCAGTTCAGAGG
TGACATTTGAACAAATGGACTGGGAAGTATGGCCAGAACTCTGGAAGAGGTGGCCGGACC
TGCTGCATCAGGAAGCAGTTCCTGTTTGGGAGTAGGGAGATGGGGCATATAACTGGGGCT
CAGCCCAGTGCCTTCCTCCC
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