SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001682_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein N (SelN)
SpeciesMyotis lucifugus (Microbat)
Promoter IDSPR00001682
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001617_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001682_2.0 # Promoter # Selenoprotein N (SelN) # Microbat (Myotis lucifugus) Full length # Reverse
GCGGGGGAGGGCGGGCTGGGCACCAGCTGGACACCAGCCCCGGGGGCTCCACACCCCAGG
TCCTCTGTCTAAATGCCCCCCCGACCCCCCATTCCCTTCCCTTCTCTGGTCCCCCTCTGC
TCCCGCCGCACCCACTCGGCCCCCGCATCCCCAGTCCCTTCGTCCTGCCCATCCAGGGAC
CGCAGTCCTCCCTGCTCCCTCCCTGCTGACCCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GACGGGGATGGAGAGCGCGTGTTCACGGCACCCTCACCTGCCAGGGCCCCGCTCCCCACC
GCCAGGAGGAGTCCAGGAGCCTTTCTGTGGGAGGTGAGGAGGGCACCTTCACCTGGGGGC
TGGGCTGGGAGTCACTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAGCCAGGACCCTGGATCCACTGG
CGCTCTCTTCCTCATTCATGTCAAGGTCCCCAGGAGCTGGGAGCTCTGTCTGCACTTTCC
CAGGAGAGGGCAGCCTCTGGACGGAACGGAGCTCAGGGGGGCAGCGCTGTCCTTGGAGAT
GCCAGCCCCGTGCTGGTGCACCTGCCAGGTGTGGGAGGTCAGCGGGGTTCAGCAGGCACC
AAGCACCCACTGTGCAAGGCACTGGCTGTTGCGTGCCCCACGTGATCTCATTTTGCTCTC
GAGCCACCGGGTGAGGTGAGGATGATTTGCCTCTTTTTAAAGTGAAGGGGACTGAGTTCT
GGCACGTGGGTTTATCGGAGTCAAATCTCTTGCCATGCTTACCTCCCAGGGGATGACCCA
GCCGACTGCGTGGGGCAGGGGCTGGCCTCTCCCACCACTCCTGTCCCCCATGGGTCACCA
GCCATGACAGCACCATGCACGCAGGGCCCGTCTCCCCAGCGCTGCGTGGGACCTGGCAGT
GGCGGGCACGCCAATGTCTTTTGGATGAATGACTCCCAGGGACCAGGAGTTGTGGGTCCT
GGACCCAGCCCTTGCCCAGTGCTCTGGCCCCACATCCTCAGTGGCACCCGCTGAGGGCCT
GGCATCTGGTGTTGGCTTCCAACTGGGCCACTTCCAGCTCGTTACCATTAACGTTTGGGG
ACACCCAGCATACGGCAGATGCCATTAGAAAAGCAAATTCCGTTCTGTCAGGAAGCAAAG
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CAGGCCTCTCTGGGCCTCGGTTCCTCCTCTGTGAATCTTTGCCTGCAGGATTTGTCAAGA
CTCCAGACTCCATGAAGAGGAAATATGAATTGGACCTCAACCTTCCCCCAGAGCAGAGAC
ACCTCTCGGCCAGATCCCTGGGCATGCTCTCAGCATCCTCCTTCAACCCTCCACCCCGAT
CTGAGCACCCCCCAAGGCCAGGCCGGCCCCTGGAAGCCCTGGGATAGTCAACAAATCTTC
CTCCCAATTTCATAGATTCAGGGCCAACAACAAGATGCTTGCACAATGCGAAAGGCATAA
AATGTTCAGATTTATTGCTTTGAGAGTTTGGTTTGTCTCCTGGGCCTGGTTGACGCAGCT
TCCTTCAGGTTTCAGAGCATTTTGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTTTGACAGCAATG
TTTTGCCTCATATTTTCACAAGGCTTTATAGTTTACAAAGGACATTCACATAGAGGAATC
ATCACTATATGTATTGAATTTCTACACTGGGGAGCTCAACCCTGGAAATCACCCTCCTTT
TCCACAGATGGGGAAGCAGAGGCTCAGAGAGGTTAAGGGCCTTGCCTAAGGTCACACAGC
CCAGGGAAAGGTTTCACCCTGCTCTTGGTCTCTTCCGTCCTGCCACTCTGCTTTTCTCAT
CTTCAGCCTGCCCTAATGCACAGTGGTCTGCAGACAGACAGTGAGTGAGAACAAAACAAA
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GGACACCACTGTAGGAATGGCTGCTACTGGCGAGTCTGGGGTTAGTATTGCCTGGGTGAT
TGAATGGAGGTCCAATCCTGCACTGCCTGGGGTTGCCCTGAAGAGGTCATTGACTGATTG
AAATTTGCAGAGGGGTTGAGGGTTGATGCCCCTATTATTGGCGGGGCCTGGGGCTGGCCG
CCTCTCAAGTTTCCCAATTGAGGTGATGGGATAGAACCTCCTTGGGAGCGGTTTGTGGAA
TTTAAATGCCGACTGTTTTTATGGTATTTTGCTCTACATTCCTTTGCCCAATGGAATCCT
TTCTCAGATTGGGGATCAACAGTTAAACGGTCTTTTTCCAGGGCAAGAAGCATCCAGATG
GAGGAGCCCTCCCAGGGCCTAGTAGCAGTTCTCTGCTAACACTGATGCTGAGCTTCCCTC
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GTAGATGGAGTGTTTGTGTGAACTAATATAAATTCAAAGTAAACATCATTACATAAAACG
GTACGGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTTTTATTCATTTCAAAGGGGCCGGATCT
GGCCCGCAGGCTGTAGTTTGCCCACGGCTGTTATAGCTGGTGGAGGGAGGTCTTATCACG
CCCCTCTGGATGAATGTTCTGGAAGGCTCTTGGGGATTCTGTGATGTCTAGTTGACCTCT
GGTGGTCCTGGAGCTGCCAG
Chart Advanced