SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001794_2.0
Identity
PromoterMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesOchotona princeps (Pika)
Promoter IDSPR00001794
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001729_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00001794_2.0 # Promoter # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Pika (Ochotona princeps) Full length # Forward
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GAGGGCTTCTTTTATTCTTCTTCTGTCGGATAATTTTGGTATGTGTGTGTGTAAAAATAT
GCCAATGGAAGAGACCACTATTAAACTGTCTCATTGGAATGACTCTCAATTCTTTCCCTT
TGTTTGGAAAAGAAAAGTGTGGGGGAGTCCTATGATAATTCAGAGACTTTCAACAAAACC
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GTCTGCCCTCTTACAGTCTGGTGGACTGAACTCTATGAACATAGGACTTTGTGTTGTTCA
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GGTGCTTCAAAAAGTTCACGCAAATGGAATGAAAAGATAAATTTATTTTGGTACAAAAAT
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TTTCTCTGATCTGTTTTGAAGTACCCCCATCCTCACCTACGCACATTGACAGCCTGGGTA
ACCTGTGGGTTAACTCTGATTCCTGCCATTTTGGTATTATTTCAGCCTCTTTTGTTGTGG
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATTTCTGTATTTCTGACACTACAGTCGGTACT
GTGATGGTCCAGCCCAGTCCTCTGGAAGGCCCAGAGAGGAGGAAGGTAGAAATGCATTCA
CAGGTGCAACTGATAGAACCTCTGCAAGGCGCCTGCAAGGTCAGGTGAAACCCAAAGGAG
ACAGTTGGGTTGGGCACAGCAGATGAGTTTGATCAGAGAAAGTGCTGAGGAGGGAAGGTG
CTGGAACTAAGTCTTGAAAGCTGACTAGGGTAGCAGCAAGGGAGTGTGTTAAATGATGTA
GTTGAGAAGAAGTGCCTGCTGGAAGTGAAAGATTCTCCTGAGGATTAAATAAGAAAACTT
GAAAATATCTGAATAAACCCAAACCTTTGCTACTCAGTGTGGTCTCACTACATGAGAAGT
GGACATCCAGCCCCGCCCAAACCTGCTAGACCAGAGCCTGCATTTTAGCCAGATTCCAAG
GTGATTCCCTTGCACATTCACACTGGAAATATCCAGACCCAATGTGTGTGGAGGATGGCA
TCCTCTGCTGAGGGTGTCTGGGTTACTTGCTGGAGCAGAAACTCATTCTTGAATGATGCA
ACAACCACGCGTGAAATTCATTGTGACTGCAATTATGGGAATCTACAGGGGGCATTTAGT
GTGCCTGTGGCTGCTTCATTTTGGGAACTTTATTATTCGTAAGAGATGGACTGCTCATAC
AATGAAGTTGCTGTGATGGGGGAAATACACTGTGTAATGCTAGGCTCCCTGTGCTAGATT
CATGGCCTCAGTCATATGATGTCTTAAGATTTCTGTGTGCCACTCACTGTTTCAGGACCG
CATATCTCCACTATACCATCTCCTTCTCTGCCAAAAGAGTAAGGGTGAGACCTGCTGCAC
GGTGTCTCTTCGGGACCCAAGGAAGCAGTGTGTAGCATGGCACTTGACATGTAGTACACA
GGAGAGATTATTATCTAGATATCTGCATGTTAAATATAGCTATGAAACATTGAATATGAC
CTGAAACCTGCAATACTTCTGTCAAGTGTAAAGATTTTTGTCACAGCTAAAATCGTCCAG
CTGAAATCAGTGTATTTCATACTCACTTAAAGAGAGTAATGTCAAGATAAAACTAAGCAC
ATCAGTCAGAGAGACTGTAGGGAAAAGTGTCGAAACATCTGAACTTTTGCACAGCCTACC
TGGTAATCCTCTCTGTTTTT
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