SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001839_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein U (SelU)
SpeciesOchotona princeps (Pika)
Promoter IDSPR00001839
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001774_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001839_2.0 # Promoter # Selenoprotein U (SelU) # Pika (Ochotona princeps) Full length # Reverse
GCCGGAGGCGGGGTCACAAGACCGGCCTGGCGCCCGCGCTCAGCCCGCGGGGGACTCGGC
CTGGGGGACCGAGTGAGGAGCGCAGGGAGCCGGCGCTCAGCTCGCGGGGGAACCAGGCTC
GGGGGACTCAGTGAGGAGCGCAGTGGAGCGCAGGGAGCCCGCGCCCAGCTCGCGGGGAAG
CAAGCTCTGACTATCCATTCGGAGGGACTCAGCGGGGAGCGCAGTGGAAGCGCAGGGAGC
TCGCGTCCAGCAGGGGCGACCAGCTCGGAGGAACTAGGCCCGAACCCGCACTCCCACCTG
CTCCAAAGGACAGGGTGCCCACGCCCGTTCTTCACTCTCTCGCGGGTCGTTCGCATTGCT
TCAGGACGCACGGCGCCCCACCGCGGGCAAAGGGTCCACGGTTGCTCATGGGCGGGCGAC
CCGTCTCTCTTCGGCTCCCGGGGTCCGGTCTGCGAGTCCTGGCTCGCGGCTCAGCGATCT
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CCTGCCCCAAAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GTATGAGCCCGCACCCCGATCCTGTGTCCTGGGGCAGAGCTGGTGGCTCTCCGTGTCCCG
GGGACTCGGCCCGAGCCACACCCTGCCACCTGTGGGGTCGCCACCACCAGCTGTCCCCTC
TGCCCACCTGTGGAGTCGCCACCACCAGCTGTCCTCTCTGTCCACCTGTGGGGTCGCCAC
CACCAGCTGCCCCCTCTGCCCACCTGTGGAGTCGCCACTACCAGCTGTCCTCTCTGTCCA
CCTGTGGGGTCGCCACCACCAGCTGCCCCCTCTGCCCACCTGTGGGGTCGCCACCACCAG
CTGCCCACCTGTGGGGTCGCCACCACCAGCTGCCCCCTCTGCCCACCTGTGGAGTCGCCA
CCACCAGCTGTCCTCTCTGTCCACCTGTGGGGTCGCCACCACCAGCTGTCCTCTCTGTCC
ACCTGTGGGGTCGCCACCACCAGCTGCCCCCTCTGCCCACCTGTGGGGTCGCCACCACCA
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CCGGCGAGAGGGAGGGCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCT
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CCACGCAGAGTGGTCTGGGTGTCCCGCCTGGCAAATGCGGTGACGCGAGGCCCCTTCTCC
CGCGGAGGAAGTGGTGGTCGGGGAGGTGACCCCAAACGGGAGCCCCGAGGCAAAGAGGGG
CGCTGGGGCCAAGGAGATGGGGGGGTGCACGCTGGCAGGGGCGCTGAGGCGGGAGCCAGA
GAAGACACAGCCCCAAGCACCTCCCCGAAACACGCTGTGGCCAGCGGGGACACACTTCAT
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TGGAAGCCCCCGCCCCCCGGGTCCTGCCGGGCCTGCTGCGAGCCAGGAGCAGCTGCCACC
ACGTCACTGTCCCGCGGTTCCTCCAGCAGCTGGTCCCACACGTGGCTGCCGTCGAGTCCG
CTGGCTAGCGACGGCCCCTAGGCCAGCACAGGGGCCGTCTCCTCCTCGGCCACCGTGGTG
ACGCTCGGTAGCGCCTCCAGCACCATGGGCTTGCTGGCTTCACTCCTTTTGCCCTGCAGG
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GGAAACAGGCGTCCCAAGGCTCGGAGTGCAACTACCCAGCTCATGCTGTGCCCTGGGCTG
CCCTGAGGTCCTGCCAGGGGGTAATGAAGAGCCCAAATTTAGTTCCAGCAGAAAAAGGGT
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GATAGAGAGCTAGGAGCCGTTGGATGCTTTCCAACAGCTAAGACAATTGAGTTTCAGTCT
CCCAAGTTTCTATTTCCCAAGAAAGAGATAAGTTTCTATTTCTCGGACACTGAGCCATGC
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CCATATCCTATAAAAAGACCCAGCTTGTACGGCTCGGCGCGACTCCTTACTCGATCAAAC
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TCTTCTGTCTCGTGTCTGCC
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