SelenoDB: selenoproteins database

SelenoDB
Release 2.0
Chart
Advanced
Promoter Report for SPR00001852_2.0
Promoter
Eukaryotic elongation factor (eEFsec)
Species
Ochotona princeps (Pika)
Promoter ID
SPR00001852
Promoter release
2.0
External ID
None
Transcript
SPT00001787_2.0
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A)
[Report annotation error]
Orientation
Forward
Structure
Feature	Col Promoter	Col Coding exon	Col Non coding exon (UTR)	Col Intron	Col SECIS
Residue	Col Sec	Col Cys or Other
Toolbox
Sequence
>SPR00001852_2.0 # Promoter # Eukaryotic elongation factor (eEFsec) # Pika (Ochotona princeps) Full length # Forward
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GCTTCCTTGGGTGCCAGTTGATGTGGGGTCTGGAGCAGGTTATCCTGCCTCTGAGTCCCG
CTTCCTGCATCGGAGAGCAGCAGAGCTGATGGAGTGAGAGAGGCTCACTGTGCCAACAGA
CACCCCAGGCCCCTTTCCCGTCCCTGCGCCCAGCACGGGCTTGTTGTCCTCTGCCTTTCC
AACACTGCCCTTTGGATCTGGAAAAATCCTCATGGACACTCTCATACTGTTCTAATATAT
GCACCAAATATCACCATTCATTTCAGAGCAGAAAATTCTCTAATTTTTCTGCCTTCTTGA
GCAGCACACTGTTTTTGTTTGTTTGAAATGAATGCTTCTCCTTAACAAAGGACATGGTCA
CTTTGGCTTCTGGTTGTGCCCCTTCCTTGATGTCTCCGTCATCGGTCCACCTGCTGTTTG
GTTCTGGTGCCCTCCGTGCAGGTGATGCTTGCAGCAGGGTCCACACATGCATGTCCAGAG
ACCCAGCTGAATGGTACGCAACGGAGCTGTGCGTACTGCCCCTTGCCTCCCAGAAGGAAT
GAGGGCCTCCCGAGCAGGACAGGACGGGCGAAGGAAGAGTAGAATACCAGTCCAGTATGA
CATGCTCCCAACTGAACCACATGGTGTTGTAAGAAGACACCGCTCACTCCAGCTCCTCTT
CTTTTCCCATGTCTCTCCTCTTCCTTTGCCCTCATCTCTGGATATTTCCAGGCGCAGCAC
AAAATGTGAGATTTTTCTCCCCATTGTCTGTTGGAACGGCGAGGAGATTGGACTTTTTAT
CTCGACCCTGTTGCAGGTGATGGCTGCACAGCCTTTGGCCAATCTCTGTGTTTTGTGGGC
CTCATAGCCTTGTCTCCTGGTGGATCTGAGGTGTGGGTGAGCTCCTGCAGCTCTGGGCAC
CCTGCATGGGCAGGGCTGGAGCCCGCAAGCATGTGGTTGCCATGCATCTCATGTCACCCA
CTCTGAGCACTGTGTTCTCCCCAACCTGAGGTCTTGGGTGACTTTCTGCATGGTTCAGTG
CCCTCTTCCCCTTTCTGACT
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