SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001925_2.0
Identity
PromoterMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesOrnithorhynchus anatinus (Platypus)
Promoter IDSPR00001925
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001860_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001925_2.0 # Promoter # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Platypus (Ornithorhynchus anatinus) Full length # Reverse
CTGGACGGAGCAAAGAGGACGTCAGTCCCTCCCCGGCCGCCGGGGGCCAGACACGTGCCC
TCTGCAGGTTCCAGCGCTGACTCTGTGCCCCACGCTGGGGCCAGACCGGATCATCAAGCC
CGACCCAGGCTCAGGCCTGACCCTCGCCTCAGTTGGAGCTGCGGGCAGGGATCTTTTCAT
TGGTTTAAGGATGAAGGGATTGAGGCCCAGGGAAGTTTGGCGACTTGCCCTAGATCACAC
AGCAGGTCAGAGGCAAGGCTGAGGTTAGACTGGACTCCCAGCCCCGAGCTCTCTCTGCTA
GGCCCTGCTGCCCCTCTCTTCTCCTGCCTTTTATCCCAGGCAAAGATTTGGAGGCGCGCG
AGGCTCCTTCCGCCCAAGGCAGAGCGATTCTTGGAGGGAAACCTTGCCACCGTAACTGTG
TGTGCAGTTAACTTGGCTCCGTCTTAAGTGGCATCACTCCCTTTTCCCCCTGCCCCCAGC
AAAGAAGGACGGGGGGAAGGGGGAGGGTGTTTCCAAATACCATTTTCCCTCAGTTGGTAG
CAAGCTGTCTAAACAGGAGATTCTGCATTAATGGTGAATACTTATTTGATGGTCTGCTTC
TTGATCTGTGCAGTCTCTGAAGGTGGCAAGGTAACACTGAACTAAAATACAGATTGTTCC
TGGTGGGGGGGTGGGGGACAGATTTCCTGCTTCGGAATTAGTCATCTCCCAGCCAAAACG
GCTCATAACAAATTGTCCCTTCTGCTTGCTTTCTTGGACCCAGGGACCCGCTGGCATCCT
GACCACACACTACACTGGGATTCATCTGGAGGTACAGGGAAGGAAGGGGGATGAGGGGAG
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TCTGGGAAATACAGGGGTACCTATCACTATCTGAGGCAGTGAATCGGCGGGCCCAAGCTG
GACATTTGTGCTCTCTCTCGCGCGACGCAAGGCGCAGGGGGGCCCGGCAAAACAGCCGGG
AAGCAGCGTGGTTTAGTGTAAAGAGCACGGGCTTGGGAGTCAGAGGACGTGGGTTCTAAT
CCCAGCTCCACCAATTGCCTGCTGTGTGATCTTGAGCAAGCCACTTAACTTCTCTGTGCC
TCAGTTACCTCATCTGTAAAATGGGGATTAAAACCTTGAGCCCCATGTGGGACATGGACT
GTGTCCAACCTGACCACCTTTGTCCAACCTGACCACCTTTTATCTACCCCAGAGCTTAGG
ACAGTGCCTGGCACACACAGAACATAACAAATACCATAAAAAATAAAGAGGGAATCAGCT
CCCAGAATAATAAATATCCTTTATAAACAACACATTTTTTCCTGGTGCATAAACCAAGGG
CTTTGTTTTTATGCTAGAACTGATGTAGAATTACAGGCTGGGAATAATTCAGGTCATCTA
ATTTAATTCAGTTATTTTTACCGAATTCACATCCAGTCCAGGGCAAAATCTAGCTCAACC
TCCAAAAATACGGTTGAACCGCTGAATAATAGATTTCTCACAGGGTTTCAAGGAAGAGAA
GTGGTTTATTTGGCTTAGAGCTGTGCTGTATATTATAGCTGAGGCAACAAAACAACCTAA
ACTATTTAACTGGCGAGGAGAGTGTTTGCAATTTCAACTGACCAACTGAAATGCCCTACT
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TTACGAGGTCAAGGGGTGAAAGGCTTCTGGGAGGGGAGCCTGAGTGAAGAAAATGGTGGG
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GTAGGACACATGGGATTCATAGTCATAATCCCCATTTTACAGACAAGGTAACTGAAGCAC
AGAGGTATTAAGTGACTTGCCAAGGTCACACAAGTGGTGTAGTCAAGATTAGAACGCAGG
TCCTTCTGACTCCCAGGCCCGTGCTCAGTCGATCGGTAGTATTTATTGAGTGCTGAACTG
GGTCCCGTAAACGCTTGGGAGCGTACAGACTTGGTAGATACATTCCGAGCCGAGAACAGT
CTGGAGGTGGTCTAGGCCATTCTCTATTTAGACTGGGAGTCCCTGATAGGCCAGGGACTG
TGTCCAACCTGGTGATCTTGTATTTTCCCCAGCTCTTAGTAGATAAATGTTATTATTATG
ATTATAATATGATGTTTCTAAAATGGAGTACTGGGAATTCCCAGTGGGTTGGGGTGGGGA
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AGGGACTCGGAGCCAAAATCAAAACCATCTCTGTGGCCTGGTGGGCATTTCAGTTCAGTC
GGCCCCCCTGGGAACATCTTCTATGGTCCCACCGTAATCATAATAATCATAATGATGATA
ATAATGGTATTTGTTGAGCCCTTATTATGTTTCAAGCACTGTTTTAAGCGCTGGGGTAGA
TACACGGTGATCGGGTTGGACGTAGTACCTGTCCCACATGGGGCACACCATCTTAACCCT
ATTTATTTTCTTAATGAGGTGTACGTCCCCTTGATTGTATTTATCTTGATGATGCTATCT
TGTTTTTGTTTTATTCTCCTTTGCTTTGCTGTCTGTCTCCCCCGTTTAGACTGTGAGCCC
GTCACTGGGCGGGGATTCACGCTTTCATACCGACATTATTCATCGCAATGCCTCCGTGCA
CTCATCTGTAAAATGGGGATGAAGACAACGAGCCTCTCGTGAGACGTGATTACCCTGTAA
ACCTACTCCAGCGCTTAGAACAGTGCTCTGCACATACTAAGCACTTTAACAAACACCACC
ATTTATTACCCTTCAGTGCCCTCAGTGACCTCATCTGTAAATGGGGATGAAGATTGTGAG
TCTCCCATGGGACAACCTGATGACCCTGTGTCTCCCCCAACGCTAAAACAGTGCTCTGCA
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Chart Advanced