SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001943_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein O (SelO)
SpeciesOrnithorhynchus anatinus (Platypus)
Promoter IDSPR00001943
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001878_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00001943_2.0 # Promoter # Selenoprotein O (SelO) # Platypus (Ornithorhynchus anatinus) Full length # Forward
CGCTTAACAAATACCAACGTTATTATCAAGATAACTAGAATCATGGAGATGTGCGCCTCA
TTAACAAGATAAATAGGGGAATAAATAACCTATGCAAATATGCACAGTGCTGAGGGAAGG
GGGAAGAGCAGAGGGAAAGGGGGGCTCAGCGTGGGAAGGCCTCCTGGAGGAGGTGAGCTC
TCGGTAGGGCTTTGAAGGGGGGGGGGGAGAGAGGCAGTTGTTAAGCGCTTACTATGTGAA
AGGCACTATAATAACAATAAAGTTGGTATTTGTTAAGCGCTTACTATGTGCACAGCACTG
TTCTAAGCACTAGGGTAAATACAGGGGAATCAGGTTGTCCTGGTGGAGGCTCACAGACTT
CATCCCCATTTGACTAATGAGGTAATTGAGGCCCACAGAACTGAAGCGACTCGCCCACCC
TCTCCCAGGACAAGTGGCTCAGCCGGAATTCCAACCCATGACCTCTGACTCCCAACCCCG
GGCTCTTGCCACCGACCCATCCTGTACTAGGGACAGCGGTAGATACAAGGAGATCAGATT
GGACACGGTCCACGTCCATGCATGTGGGCTCACCGTCTTGATCCCCGTTCGGCAGATGAG
GCACAGTAGTGGCTTGCCCAAGGCGCCAGATGATACAAGGGGCGGAGCTGGGATTAGACC
CTGCGGCCTTTAAAGAGTATTTAATTGAGCGCTTACTTCTGTCGCACAGCACTGTACTAA
AGCCGCTCGGGGAAGGTTACAGGGTTCATCCGCGTGTTCCCAACGCGAAGGCTCACAGAA
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GAGGGCAGCATCATTTCTCATTTCCCTCTGACCGGATAACCCTGGAGGAGTAGGGCCATT
TTATGCATTTTTGTGTTTCCCAGTTTTCCAATTTGATGTATTTTTTAAAGGGCTACAATT
CCATCACATTCTCAGACATTCACTCGCCCATTTTACAGATGAGGTCACTGAGGCACCGAG
AAGTGAAGTGACTTGCCCAAAGTCACACAGCTGACAAGTGGTAGAGCCGGGGTTCGAACC
CACGACCTCTGACTCCAAAGCCCGTGCTCTTTCCAGTGAGCCACGCTGCTTCTATGTGCA
GGGCACCGTCCTAAGCGCCGGGGGGGGGATACAGGGTGAGCGGGTCGTCCCCCCCGGGGC
TCACGGTCTCCATCCCCGTTTTACAGAGGAGGGAACCGAGGCCCAGAGAAGTGAGGTGAC
CTGTCCGGTTCAGCCGGCGCCGGCTGCCCTGGGCCCCCAAGATGGTACCCGCCGATGGCG
TGGGGGACCCTGGCCGTCCCCGCTGCCGCCGGTTCTGCCCGAGCCGGTCGGAGGGCGGCA
GATTGTGGGTGTGGAGGGAAGGTTCCCGGCTTCCTCCGTAGCGTTTTCAAGCCTCCTGCG
AGGGAGAAGGCAAGGCAACGGAGGGAGGATTCCGTTGCTACGGGTTACGCTAATCCCCTG
TCTCAGAACAGTGTCCTGCAGAGAAAGGAGGGAAGCAGCAGGTGAAAGGAGGGAAAGGAG
CAGGTCTTTAACCCTCCTCCGTGAACTCCTCCAACCCAAGTCCCGCCAACCCACTAGCCG
CCTGGAGCATTGACTTTTTTATTTCTACCCTTCCTCAACACACATCCTTACGACGGGATT
ATGGATGGCCCCGTTTAAAATCCACTCTCCGGCTCCCCGATCAGAATGGAAACTCCCGGC
GGGCAAGGAACAGGTCCCGCCCTCCTGTTGGACTTCCCCGAGCGCTTAGTACAGCACACT
GCATCCGGCGGGCGCTCGATAAATACCTCGACTCCTATCATTACCTTTCCCTTCTCCCCC
CAGCCTCTTTAGCGTCACCACCGCGTTAAATAATGGTGATTACGGATTCTTCCGCAGCCT
CTGAGATGGCTGCTTCTCTCCGAACACAGTATAGAGGAGCGGTGTTTCAGTTGGGGTTCC
CGGTTGAATGAATGAATGAACGAACTGCGTAGTTTCTCAGGACATCCGCCCGTGACGGGG
GTCCCCTCCGTGGGCCGGGTGGGCCGAACTCCCACCCGGCTCATCCCAGGTCCCCGACCG
GACCCGAGGGATTCCCATCGGGGCCGAAAAGACCCAAATCGGCGACTCCCTCCCCGGCCC
CATTGCTCCCGGGATCCCAGTCCCCGGGAAAGGTTGGGCCCGGGGCCCGGGTCGGGTTCC
GGGCGACGGTGAGTCCACCCGTCCCCGGGGCCCGCGGCCGGAAGCTGGGAACGCGGGGTT
TCGAAACGAGAGCCGAACCGAGCGTCGGCGGGACCCCCTCCCCCCCCCCCCNNNNNNNNN
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GCGGGAGGGGGCCCGGGGGGCGGCGGAGGGCGGGACCCGGGGGTTCCGCCTCCTAAACCG
GCCGGCCCGGCGCGCCCGCC
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