SelenoDB: selenoproteins database

SelenoDB
Release 2.0
Chart
Advanced
Promoter Report for SPR00001962_2.0
Promoter
tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
Species
Ornithorhynchus anatinus (Platypus)
Promoter ID
SPR00001962
Promoter release
2.0
External ID
None
Transcript
SPT00001897_2.0
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A)
[Report annotation error]
Orientation
Forward
Structure
Feature	Col Promoter	Col Coding exon	Col Non coding exon (UTR)	Col Intron	Col SECIS
Residue	Col Sec	Col Cys or Other
Toolbox
Sequence
>SPR00001962_2.0 # Promoter # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Platypus (Ornithorhynchus anatinus) Full length # Forward
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GGTTGCCCCTGACTGCGCCCGCCTGCCCACAGCTGGAACCCTACATGGACGAGAATTTCA
TCTCCAGAGCCTTTGCCACCATGGGGGAGACTGTGCTGAGCGTCAAGATCATCCGCAACA
GACTGACAGGGTACCTCCTCCTCCCCAGCCTGCACCACCACTTCCTCCCCACCCTGCCAT
GAGGTGGACCAGTGAGAGAAGGGTGCAGTATCCCAGTCTGTGGGTTGGAAAGGCCAAAAT
GCCCTTTTCCCACTCCTCCCCCTCTACTTCCTGTCCCAGACTCAGGGACTTGTTCGATAG
AGCATGGGTCTGGGAATCAGAAGGACCTGGGTTGGACTCCAGGCTCCGCCGCTTGTCTGC
CATGCGACCCTGGGCAAATGATGCAATAATAATAATAATAATTTTGGTATTTGTTAAGCT
CATACTATCCTAGGCGCTATACTAAGTGCTGGGTTAGCAAATCGGGTTGGACACAGCCCC
TGTCCCACATGAGGTTCACAGTCTCAATCCCCATTTTACAGATGAGGTAACTGAGGCACA
GTCAAGTGACTTGCCCGAGGTCACACAGCAGACAAGTGACAGAGCTGGGACATCTCTGTG
CCTCAGTTACCTCGTCTGTTAAATGAGGATTGACTCTGAGCCCCAATGTGGGATATGAAC
TCTGGTCCAACCTGATTAGCTTGTATCTAACCCCAGCACTTAATACAGTGCCTGACACGT
AGCTAAGCCACTTCACAAGTACATGAAAAAAAGAGCAAAAGAACCCCGATCCCCCCNNNN
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AATCCAGACTCTGCCACTTGTCAGCTATGTGACTTTGGGCTAATCATTTAACTTCTCTAT
GCCTCAGTTACCTCATCTGTAAGATAGGGATTAAGACTGTGAGCCCCAAGTGGGACAACC
TGATTACCTTGTATCTACCCAGCGCTTAGAACAGTGCTGGGCACATAGTAAGGGCTTATC
AAATACAAAATTATTATTATTATTATTATCGGGAGAGTATATTACAACCAGAAACAGACA
TATTCCCTGACCACAACCCTTTCTTCATCCCCGGCCCTCCGAACCCACGGCTGCCCCTGA
CTGCGCCCGCCTGCCCACAG
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