SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002037_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein I (SelI)
SpeciesOryzias latipes (Medaka)
Promoter IDSPR00002037
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001972_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00002037_2.0 # Promoter # Selenoprotein I (SelI) # Medaka (Oryzias latipes) Full length # Reverse
ATAGAACCATGGTGGCACAGTGTGGCTCATCGACGAGACAAATAAATCTGTTTTTCACAA
ATACAAATCCTTATCGTCAGCCGCCGCCGTCGTTCACCGGGTGAGGCGGTGTCGAACTAA
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ATACATATGTTTTTCCTAATCAGTCAGTATGAGAATGTGGGGTGTAAACCTCAGCTTGTC
CTCAGCAGGGTCAATGTTTCACACACGTTCCCAGCTACAGGCCCGGCTTCAGTTCCCTCA
GCCTTCAACGATAACATCACACTTTATTGTCGCGGTTCACGTGCCGTTTTCTCCCAGATT
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TCTGCTGCGTTGTGGAGACTCTTGTCGGACGTCCTTAGAGATGCAGAGGGGAGCTGCACG
GGTGGATCTTTCTCAGAGAAACCTGTAGATGCAAACAGTGCAGAATTAGACCAGCTTTTT
TTTTTTTCCACACAGTGTTCAAAGGTGGTGTCAAGAAGAAGAAAAGCATCAATCTAATGT
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GGCTTTAAAGAAACATGCTAATGCTTTTAATAAATAATAAATTATTGGAGTTTTGTTATT
TCTTTTTAGGTTTTTAAACTGAGGTGATCTAATATTAGTCAAAATACTTTTTTTTATATC
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ATACGGAGCCCGTGTCCTGACATTAAGATATAAAAATATATCTTGTTCCCACAGATTAAT
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TGCTCTCTGTACGCCGGCAAAAGCCGCTTTCAGCGGTAACTTCCGTGTCTCTGTGACCCA
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Chart Advanced