SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002038_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein J (SelJ)
SpeciesOryzias latipes (Medaka)
Promoter IDSPR00002038
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001973_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00002038_2.0 # Promoter # Selenoprotein J (SelJ) # Medaka (Oryzias latipes) Full length # Reverse
TCTGTGGAGAAAGGAAAAGTCTTACTGAAGGACTTTGTTTGGCTGCTTTCCTCAAAAGTT
TATGATCAAGGCTGGAGCTGACACTCCTTAAAGACCTTCATTAGACAGGAACTTACACAA
CAAGGGGTCACTAAAGGTCACGAGTACTCACTGACTTTCTATTTCATTTATTTTGATAAA
ATAATGTGATTTAAAAATAGATCTAAAATGGATTTTGGCAAAGATGTGTGGTAAAATGTA
AACAAAAACAGCCAACACTCTTGACAGTTTATAGCCTATATTAAATAGAGCTGCTAAAAT
TAAGTAGACCAAACTAATAATGAACGAACAAAGAACATTTATCTACTTACTAACTAATCT
ACAGTGCCTAAATGTTATTATTATCTGATCATCTTTGCTTATCCTACACTTTTATTGCTC
ACTGTTTGCAGTCTAAACTAACGGATTCGGCATTTTTTCAGCGTTTTTCAACATGATAGA
TTGAAACGCCAGTTAAACACAAATATTGACAAAAATCATACATACTTTAACCACCGCTGA
ATGCAGGACGAACAGTTACGAAGTCCGTAGCTTCTCTGAACTTCAGTGGCGTCTTTACAC
AACAACCTCCATGTTATGAAAACGTCTGTCGCTTTCTCCGCCCACCAGAAGAGGGCGATA
GAGGACCACGACTTTTGAACGTTCAACTTTTTTCTCTCCAACTTTATTGACTAACGTGTC
TGTGACAAAAATTGAACAGTGAAAAAAATGTGCCCCTCCTTCACAAAGCATTTTTCCCCG
TTTTTTTCTGATCACTTAAGTGCTTTATTTAATTCTCTTTTCATGTTTGCTGCTCAATCA
CAAATATTCCGATTATATGAGGAGAAAGTCACCAACTTTTTTATTTTTGTGTTCTTTAGG
GTTTCTTTGAGACATCAAAGTTGTAGAAATTGTTTCAGAATGCAGTGCTAACAGACAGGA
ATATTTTCAAATGAACACCACACAAGACAGTTGTTAAATTGCTTGTGGAAATTGATGGAT
TACAATAATAACAAGACAATCCAAAAAAACAGATCAAAAGTGAATTCAGAAAATGGAGAA
GTAAGGTAGATGGAAAATAGGAACATTAAGATAGGTCAGCAAGCCTTCCAAACCTAAATC
ATAGGATATTTTAGCTACAGAATAAACAAATTATAACAAGAAACATGGGGCCCGCGTCGG
ACTGGCGACCTGTCCAGGATGTCCCCTGCCTTCACCCACGAGTGGCCAGGATAGGCTCCA
GCAGCAAAAGTAGACGTTTAGTTAAGGAGTTGTGTTTAACAATTTGGCTAACTGTGAGAT
ATTATATTGATCATTCATTAGCTGATTTTGATCAGTTGTGTGCATGTGGACACAATTAAC
AAGCTTTAAAGTGTAACTTTCAACATGTTTTTTAAACAATAAGCTTAAAAGATTAGCACT
GTTTTGTTTTGTTTTATATTTTATTTAAAAGGCATCTTAGCTCCTTTGAAATTGTGACAG
TGGTTAGGAGGTTCTACTTAATAGAGAATTTTACGTCTGAGCTTTTTTTTCATGCCTCAT
GCCTGAACTGACAGATTTCTTGTAACTCAGGCCTGTTTCTGAAACATAAACTGGAAAGAG
CTGTGCACACTGTCAACACATGAGGTGCAAATGAGACACTTTTCATTGAGAGCCTTTCAA
GGCTAGTTGAATGTTAACTGGAACACGGTAAACCTGGACTCTTAATAGTTTTTTTGGTTC
TCAGCCTAACTGCTCAGCATCAAAACACACTTTATTTGTGTATCTTTTCCTGTGATCACA
CTGAACAACTCCTGCAAGCTCTTCAAAAAATTGTTTCAAAAAGCCTAGTGTGTTGGAAAT
ATGTCATTCCTTGAATTTGTTTATGCAAATATTGGAGAGACAAAAGTTTTACAAAACACA
AATTCTTCACTTATTCTTGAGATTCCTAAAATAATTTAAAATCCTTCTTAAAATCTTCAA
TTCTTCTTAGGTCAGGGCTAAGTGACACCTATATGCACAGAAGCCTCAGCAGGTGCTGCT
TGTCCTTGAGTGACCCAGGTCCGCATTCTAGTGCTGTGGCACTGCCAACAGCAGCAAATT
AGACACCGACGGCAGCCCCTCCTGATATGTACTTCACTGTCCCACATCCATTATTTTTAG
CTGATATCCAAGCCACCGTCTTCACTTAATATGGGAGGAGACAGTCTTACACTACATTTT
CAGTCATTTCTAAGTTAAACATGTCGCTTTTGTTCTTCATTTGGTACAAAAGCTCAAGAA
AAGTTTGCAAACTTGTCATCTTCCCCCTCTTTTTCTTGCTCCACAGAAAGAATGTAGAGC
TGATATGACCCCAGTCCTCTGACTGCACTCAACTTTTACAGGTCTGTAACATACACTCAA
GCACACACACGAACCAACCTTCGCTCAAAGCTGTCACCCAAGCAACAGCCCAGACCCTGC
CTCATCTTTCCTATGTTCAGTTACACCCCACGTAGACATGCACACTCACACCTATGTCAA
GCTTAGCCCTGCCCCTCTTGCCCCTTGCACCCCTCTGCAAGTTTCCCATGAGGGGTTTTT
AATAAGGTGGACCCAGGAGTCTGTCTTGCTCTCTTCTGGGTGGCGCGGATTGGAAGGGGT
TCTGCAGAGATTCACAGATTTCTCTTTTGTTTTTAACTGAACAGAATCGTTACCAATTCT
AAAACATCCCGAAGAGGAGCCATGAAGTGGACCTGGGTGCTTGTGGCAGTCTTGCTGTCC
TTTGGGGGTTTCTCACTCTGCAAGGACGCTTTAGACTTCCTGGAGTACGATGGCAAGGAC
CGTGTCCACAACCTCAATGCCAAGAACTACAAGTCTGTGATGAAGAAGTACGATGTCATG
GTGTTGTACTACCATGACCATCCTGGATCCAGCCGCGTCGCCCAGAGACAGTTTGAGACG
GAGGAGCTGGCCCTTGAGGTGGGTGGAGAACTCGGACGGCTAAGATGAGATGCTTTTGAG
GTTTTACTGGACTTTGACCTCAAAGAACGCAGAATCCTACTAAGAAAAAAGTTGTTTGAG
ACTCGAAATGACATGTATAATTCTCCAAATTAAGTCTGGAGGCTGATAATTCATACAGCT
AAACATGATTTTGAATATTTAAATTTAGAAATTTCAATACGAATGCACCCATTTTCTGCA
AACACATGACCCGCTTGAACGATTGCAGACTTTGTGCATGAGTATTTGTTTTTGTAAGGG
ACTTGATCCACATGAGCGCTGTGACAGTCCGTCAGCACCTTCTGGGTGGGTACTCAGCAT
TTCCCACATAGAGAGTCATTACATCACCTGTAGCATAAAACGCCAGTGTCAGCTCCCAAA
GCATCAAGCAACCGCATACCTCTGCTGTCAAGTTTCAACATTTGCCAAAAAAGGTCAGGT
GCATGTCTGCATTTTTGCAGAGACAAACATTTTTGACAGCTGGATTAATATATTAATATA
AATAATTATTTCAATAGCAAATGAGGCAATTAAATATGTGCAATAATGGAAAGAGTCAGG
GTAACAGGTTAGNNNNNNNNNNAAAACCCAAATCTACAATTTTAACATGTAGACAATAAA
ACAATGATGGCAGAAATATATATTTTTTAGCATGTTTGGGAAAACAGGAGGGTAGTTGGA
GAGTCCGCCCTAAGTAAAATCACATAATCTCCTCAAACCCCCAGACTGTGGTGTGGTGCC
TGCAGGCTGCAGTCTAGAGCCTACAAACCAGAGGACGACGTGCTGGCTCCACTAAAGCCA
GCTCAGCTCTGTGCAATGATTGACACTTGCAGTACTGTACTTGTCAGCGGATCCCTGAGA
GATGAGCATCACTTCTGCCTCACCATAATAGTCCCTGGACCAGTGTGGAAACTGGCGCTA
TATTTATCCCAGGACCCTTTTGTGGTCGAGTTCCCCAAAGACTTGTGTTTGTACTTTAGT
TTGTAATAATTTAGTCGAAATTTAATTCAATTACATTTCTTAGAGCTGCATTGTTCAAAA
TAAAAAACATTGTCATGGGAAAAAATTTAAGAAATATTTTTTGCTAAACTTTAAAAGTGT
TTTTCATAAAACAACCTCCTATTGTCCAGAATTTAAGCCATGTTCATTACACCAAATGCA
TATCAATCATATATAAATGTTAAACTATTATAGATTCTTATTTTATGGGTAAAAATAAGA
ATCTGTTATTGTCCAGTGGAAGACTAAACGAAATGAATTTGTCATCCTAAATACTGCAAA
AGAAATGCAGGTTCTTCAGGTTGCATGCTGATCAACAGCTGAATCCGAAATCGGAATTTT
CTTTGTATTTTTTTCTATTACAAATTATATAACTTAAAAATGTGTGAGTTTTTATTTTAT
TTTACACAACATTCAGCGCAACATAACAAAAATCTTTTTTCTTAATCTTGAAAAAGCATA
GGAGATGAGATTTATCTTATTCTCAAGTGGTTGTAGAGGTGGAGGTAAAATTATTACTTG
ATTTCAGAATGTACAATAGATTTTTTTATTTTTTTATTTACTCTTTTTAACATAAGTCAC
AAGCAAAAAAAAAAATTTTAATTAAAGATGTAACATTTTTCCAAGTCTATCAAAAAATAA
ATGTTGCAGAAATTTAAAAGATACAACATTTAGAGTTTTTATGTTTTTATTTACTCTTTG
TAACATAAGTCACTAGCAAGAAAAATAACTTTTAAATAAAAGGTGTAACATAAAATAACA
AAAAATAAATGTTGCAAAAATTTGAAAGATACAACATTTAGAGTTTTTTTTATTTGTTTG
TTAATACCACAGTTTTCTTCAACAGCTGACACTTTGCCAAGTTGTTTAGCTGCTTGTCCT
TGCTCATTCATCCACTCAAGTTAAGAATGATGCTGTTAAACAGCCTGTTGGTCTGTTTTT
GCCAAAGAAAACAGCTGTTCAAGAGCTCTGACACCAGTATGCTTCAAAATTTATGCGTAT
GTATGCACACACACATACCT
Chart Advanced