SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002057_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein U (SelU)
SpeciesOryzias latipes (Medaka)
Promoter IDSPR00002057
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001992_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00002057_2.0 # Promoter # Selenoprotein U (SelU) # Medaka (Oryzias latipes) Full length # Forward
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGCGTGATTGATGAAATATTTCACACTAGTTGGTTTGAAG
GAGTGAGTGAACATTATTTGTATTGTATACATGTTGACATGTGGACATATTTGGAGCCAA
CAGGTATGTTTATAACAATTGGTGTGTGTGGACAGGCCCCGCCCTTATAGACTTCTATTA
CATCTGAACCTGACCACAACGATTATAACCATCCAGTAACATGTTGCTTTCTGCTGCTTC
ATGGTTTTAACCCCCCTCTTTCTATAATCACCCTCCTACCCCCCCCCCCCCCCCTAAAAA
ACCCCTTTTTTTTTTCCCCCCTTTTCTTTTCCCCCCGGGCCAAAAAAANNNNNNNNNNCT
TTTCCGTCCGGTCCAACACAACACAAGAGATTTTCAAACTTAATTAAAAAGAATATAGTT
TGGCCTCGATTACAAAAGGGGTTTAATCAGACATACCTTTGGTTTGTCAGAAGATTCATA
ACCCCTGTTGTTAAAGTAAAATATGTCCAACTAAAGAGGCCCTCAGCTTTCATTTGCCTG
CCCAGCTGTTGGACAGGACAAGTTAAAAAAAAAACAAAATAAAAAGCAAGATTTTTGTTA
AAAAACAGGGTAAATTCCTCTAAACACGTAAGCTTCTTAGTCAAGCATGGTGGTGGGGTA
CAATGATTAGGGCTCCGTTTGTGGCCTCAGAACCTGTTTAAATTTTATTCACAAACACTT
GATTTCTGCAAATCAAATTGGGGTTTAAAAAATTGGGATTATTATTTTTTATCTCCAAAT
CAGAGGTTAATCTGTGTGTTCGTGACGAGACTAAGATAAGGAAATCACTCATCAGGGAAG
AAGCATCCATGTTTCTGCAGTAATTCTGAGCATAAAAACCTCAGAGGCAAAAATGATGAT
GGGTTTCAGAATTCATCAGATGGAGGTCCGCATGACAAGTACGGTAGATAAAAACTGTGG
ATGCTTTATTTTTGTCAAGGAAGTCAAACAGGAAAGGAGAACCTTAACTCTTTGATATAA
AAGAAATAACATTGATCTGATGAGCAGTTTCTGAACTGCATAAATGACAACCCCTTCATT
TTTCTCTGTCTTTTTTCTCCAAACAGCTGCTAAAAAAGCCTTTCCTGAGTTAAATAAAAG
AAAAAGAAACACAGAAATGTCTTGTATTTTGTGTCGTCCAACATGTGAGAAAAAAATTCC
TCTGCTTCCTTCTGGTGGTACGTCTTTGAAGTTGGTCCCCGATGAAGTTTATGCAACTTT
TGCTCCCATATAACACGATGCTTCCACTCAACTTTGATGACGAGTTGCTTCAGAGAACGA
TGACCCTTTCATCTCCCCCACATAAACCAGCTTTAGCCGCGACTCCCAGAGTTCAGTGTG
ACTGAGCCCGAACTTTCAAGAATGTTTTCTGGTTTGATTGTGGTTCCTGTCCATCATCCA
ATCCCACGTTTGTTTCATCCTTCAGGAAGTTTGACGTTTTTCTGTCAAATTAGAAGATAG
AAACAAATCCACCCAAACATCAGGAAATCGATTGTTGAGGACAAATCTTCTTACCTACTT
TTAGAGATCTTCAGATTCTTTCTACTATATAAAAAAAAAGGGAGGAACACTTTTTTATTC
GTATACCGCCTCACCATAGGAACAAAATTATGTAATGCATTAAAAATTCAACACGTATTT
TATTTCCAACTGAAAAAAGGTAAACAACTAAAGGTCTGATCTTAAAAAAAAATCCATAAA
AAAAACAAACAGACGGTATATATAAAATAGAGCTGCCTTTGGAAAAACCAACTGATATAA
AGAACAGCTTTTTTAGAGCTTAACAGAGTTTTTACTTGTAGAAATCGTCATCATCGTGTT
CATCTTCACTGTCCTGACTGGCCTCGTCTGTTTCTCACACAGCACGCTCTTTTTTCCTCT
TGAATTTGAATGGTTGGTCCCATTCTCCACCGTAGAACCAAAGAGGAGAGAACAGCAGAT
TATTATTCCATCCTTATTGGTTCTACGGTGGAACCTTAGAACATTCCAGCAGGTACGATG
GGAGTTTCCAACCATGTGTTCTGAAAAGAATTGATAAATAGCAGCAATCTCCATGTAAAA
TTAAAGCTATGAGAACAATGAAGGAGCCAACTGACATTCGAACATCAAAGTAGGAAAACT
GCATTTCCTTCAATAATAAACCAGAAAATGTTAAGATATACTAAAATATACTAACTGAGC
AACAACAGCTATTTTAACCAGGATCTTAAATACAGACAAATGTTTATGGTAGTATTTAAT
TATTTGCTAGTTTTGAAATTTTATTTTTTCCATTTATTTATTGACTTACTTGTTTCAAAA
GGAAGTCTGGTTTGCTTTAAAGCACTTTGATGTACAATAAGCTGAACAAAAAGTAAAATT
TAAATGAAAATTTAGATGAAATAATTTAAATAATGTAAAAAATCCGTAAAAAATTAAACG
GAAAAGACCAAATTATTGAAGCGATGAATTCATTTTAAACAGAAATTTGCTTTTGATTTA
GTCTCAATACATGAACATAAATTGTTAATTAACCCTTGTGTTATCCTATGACCCCACCCT
TCCATTAACGTGTTCTCCCTACCATGACAAAGGTGGATAAAGGTGGAAAGATTTCATGTA
ATCCATGGACACCAGTGAAGATCACAAATCATTGAAGAAAAAAGGTTCAGATCACTGTCT
AGTGCAGTGTTTTTCAACCAGTGTGCCGCGGCACACTAGTGTGCCGTGGGAGATGGTCAA
GTGTGCCGTGGAAAATTGCCCTCATTAACTGATCTAAAAGCATTTCCCAGGACCCATCTC
CAGGAAATCAGCTCTTTGTTCATCCAAACAGGTCCTGATAAAACACTGAGTAGTTAGGAA
TATAAACGATCATAAAATACTTTTTTCTTTGTGTTTATTTGATTCTATTAAAGACATTTT
GATAAGAATGACAGTAACGCGAAATAGCTNNNNNNNNNNGGGGCCTTAGATCATAACCGG
CTTTGGGGTTTTGCTTTTTTTTTTTTTTTGGGATGCTGGTGTGCCGCGGGATTTTTGTCA
AGGTTAAAGCGTGCCGTGGCTCAAAAAAGGTTGAAAAACACTGGTCTAGTGGGTCTAGAT
GACCCAACTCCCAATGTTAAAGTGCCTAGGATAGCGCAAGGGTTACAAAAAAGAGCAGAA
ATAGCAAATGAGGGCTCAAAAATTGATTAACGCTTAAATACTGATAACATAAACATAGAA
ATAGGTCAAGGTGAAACTCTGAGAGTTTCAAAAGGTTTAAAGTTTTTCCTGTTTGTTTTC
CATGAGCATAAAACAAGAAAAATGTTTTTAAAACTCCCTTGTCAGTATTTGTCTTGTATT
GTTATTCATTTATTTATTTTTTACAATTTTAAAACTCTGTATGGATTATTCTTGTTTTTA
ATGACTGGTGGCCCTCATAGATTAATTAAACAAATAGAATTTTATTGTTTTTTTACTATG
TTTATTAGTTAAAATAACTAGCTGTAAATTAAGCAAATAATATATTTTCTAATTTACCTC
ATCACACCTAAATGATTTACTTGCAAAAATATACTTTAAAACCCCCCAAAAATCTGGGCG
TTGACCTCCAGGTCTGCAGGAGTCCAGGAGTGTGGCCCTGTTGTCCCTGTCACCTTAAAG
ACAGGAGCATTTTCCCAGTGGAGGAATTCTGCTCATCTCTCCACCATGGAGCTGCTGCCA
CACAGCAGCGGCCTAATGATGTTACCAGGTTGTGATCATTTACGGAGGGAACCTGTCCCC
CCAGGGCAGTCAGGCTGACACACAATGCCCAAGCCCCAGCGGGGATTGGAGGAGGTGGAC
TGAGCCCATATTTAACTCTGGCCAAGGCCTCTTCCCTCCTATCCGTCCCGATTATCCTGG
GAGCCTTGGAAGGGCTTTGAAATCAGCCTTTGCAGTAATGGAACAAAACAGGTTGGTCAT
CACGCAGGTGAGGACGACTGTTAAAGCCAACTTGGCCAGTGTTTAATCTGAGCCTCAGCC
TCTTGACAACCTCGTTCAGGGATGCTACGCCTGCTGGCTCCAGAGCTTATTTCCAAGCAG
GACTGCAGCCAGGCGGGTGTTAATGATGGTCAACAATACTTATAAACACACATACGCGAT
GCAACCACTTTTGGCAGCTTAGCCAACAAACTGGGAGGGTGTAGGAGCATGGAAAACGGA
GGCAGGGAGGGGGCACAAGAGCCGCACTCGGAGGAGAAAGAGGGTTTGTTTTTTCAAAGT
GAAGCGCCTCGGCGCTGTAATCTGGTCACGAGCAGAGCCGGAACATTCAGAGCTTTTGAC
AGATTTTAAGCCGTCTCACATTCGTTTGATGAAATCCCTTCAAGAACACCAAGCTTTGTT
TAGTATGTCCTTCAGATCAAAGAGCGGAGGACGCTCTCGGTTTGCAAAAGCTAATATTTA
GCCTTTACATAAAACAAAAGCCTGCAATATTAATGGAGATTTCCAGTAAATAAAAATAGA
GCTAGAATCATTTATTAGACGTTCATTTTAAATTTAATCGGGCTTTAATAATTTACTAAA
TATCTAACACACATTTTTTTTGCAACATTTGCAAGCTATCTGTGTTTATTAGCAGCTTTT
TTGTCTCTGTGTTATAGGATTTCATCCGTTTCATCCAATTTTTTTAAATAAAAAAAAAGA
AACTTTGACACATTTTCATTCTAAAAAACTCTAACATAAAGAAACATCAAAAGGCATCTG
CATCTAATTCTCTTTCATTTTAATTTCTTTTGGGTTAAACAGAATGATGAAAATTTGATT
TCTTTTCGTTTGCTTTGATCTTTCCTGTTTTGTTAACTGTCTAGTGGGTCTAGATGACCC
AACTCCCAAATGTTACAGTGCCTAGGATAGCACAAGGGTTAAGGTGGCTAACTTTATGCA
ACCTTAGCTTGGAATTAGTACTTTATCACGACACAAATTCAAATAGACCAGTTCACAAAT
ACGACTGCGTATGCACTGGG
Chart Advanced