SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002234_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein U1 (SelU1)
SpeciesPetromyzon marinus (Lamprey)
Promoter IDSPR00002234
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002169_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00002234_2.0 # Promoter # Selenoprotein U1 (SelU1) # Lamprey (Petromyzon marinus) Full length # Forward
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGGGCGCATGACTTTAATTACCGAACTGTTATCGC
GCGGTGAGCTTTTCTTCATTCGGATGTTTGCTCAGTTCCTGAATGATCGGGGCAATTTCC
AGAAGATCCATGCAGTTGCTAGGATAACAGTCTGTACAAAGGTCAAACTCCGTGCCATGC
TGCATTATGCAAACTGCTTCTCTACCCCAGATTACAGGCGTTGTGCAACCGTGCCAGGAA
CCATTTAACTGCTTCAGCCACCAGGAGTGGGTAATCCAAAGAGCCGTCGGGCTTAATCGG
CCTGAAATAACTGCCGTCGAGAATTCTGACCCCCTCCCCCCCCCAAAACCATCTCACGAG
CCTCGAAACCTCTTTTTCGGGAGGCTCCTGCATTTGGCATGTTTGGCCGATAATTAATTC
CTCGCGAAGTAGCATTTCACGTGTGGAAGGAAACTCGGGTTGAAGTAGAAAACTAGCATG
AAGGCATAACAGCTCAAATGGTATGCAGAACCAGGTCAGGGACCCACTCGATGTACAGTC
GTGTTCTCCGATAACGGTCTAGTAGTTGCGTTCCTGAAGAACACCGCGTTATGGAAAAAT
CGCGTCATTATGAGTAATATACAGTAAAACCTTGGATTGCGAGTAACTTTGTCTGCGAGT
GTTTTGCAAAACGAGCAACATTTTAAAATAAATATTAATTTGATAAACGAGCGAGGGTCT
TGCAATACGAGTAGTACCGTGTACGCTTTGTCTGCCGAGCGTCACGTGATCACAACTGAT
ATACGAGTGCTTTGATATACGAGTGCTTTGGATTGCAAACACGTTTACCGGAACGAATTA
TGCTCGCAATCCAAGGTTTTACTGTATAACATAGGGGGTTAAAGCACAGTCCGCGATGGC
ACGTGAGATGCGTACGTAGGCTGAGCAAAGATTTAAGGCGCAGTGGGTAGCATCTAGAAA
CATCCAGCAGCATCCCACCGCCTTGTGTGATGATGCTACGCCGAGGCAGCCGCACAACCG
CCGCCTATTCCTGCTCGCGTTGCGACGTGGTTCTGTGCACTCGATCGCGTTCTATCCAAT
TCGCATCCGCGTTGCAAAACAAAACAAAAAAACCGCGTTGTATCCAATTCGCGTCGTTGC
GAAAACTCCACGGCGTTCCAGGAGGACGGACTGTACTTCCACCTCCTGGCCACCTCGCAG
TCCAGGGGCTGGCCTGGGCCCTGCTGCATGGACTGAAATGGATCCCATCCCCGTCCGCCT
TCCCCCTCCCTCCCCGTCTCTGTAGCCTGGCGCTGGGTCGCTTTGGCCTCGGTGCAGTTG
CACCGCCTGCACTCTCGATAGCCATCCACACCGATCGTTTTCTTGAAAGGGCTGGCTGGA
TTACAGGGCGTTTTAATTCGCGTTACGAGAGCTGAACCGTTCGACTATTTAAGCTAATTA
ATTATAAGACCTGTCATCAGTTTGAATACTCGGCTAATCGGATCACACGGACATGGTTGA
GAGAAAAAAACGTCCGACCTCTGTCCCCACTTGTGTGCGCGAGCGGTGGTGTAGCGGTAC
GAACCCGGCGACCCGAGTTAGATTCCCGCACACGGCCAACACCAGTGACGATTATCTGAA
CCGGTCCTGGGCTTCCCCTAGGTCGACTCAGCCTCAAATGAGTACCTGATGTAATGTGTA
AATATTGAAAAATAGCGTTATATCTCATCGGATTCCTCCAGTCTTATGCTATCTGTGCAA
TTGCAATATCAGTCTTTTTTAGTTTCGAGCAGGTATGTTCCCTTGTTGCCTTTATCATCG
TAATGTGTAAAATTTGCCACTGGGGAGACAAATACGATCGGGCGAGGTGCTGGCCACCCA
CCCCCTCGTGTGCCGTGGCCGGCCTTAATAGGTGCTCGCTAACAGCACTTGCCCCAACAG
TCTCTGATGGCTATACGGGATGGGGGGTGGATCTTTGTCTTTGCTCCCAGGGCAGACGTG
ATGGGGTGCTCCCTGGTGGTGCTGTCGCTGGGCGGAGTGGGGGCAGTCTTGGCCAGCCTG
ATCCTCGCCAACACAGACTGGCTGCTTCCGCAGGCCGAGCCGGCAAAACTGGCCTACCTG
GCAGATGCGCCGCTCAGCTCGCTCGATGGAGGTAAGTCAATCCGCTGGCAACAACGAACC
AAGCAACAGATACTGACAGCATTCGGTCCACTCGCTCACTCACCCACCTATCACTCAATT
ATCCACTCGCCGTTTCACTCCATCGCCTACTGGGTCACCAACTCCATCATCTACCCACCC
TTTCAGTCACCTACTTAATCACCCAGTCACTTACTCGCTCACGCACCGACTCATTTCAGT
CACCCGATTCAATCTTTCACTAAACATTTAAACATTTTAATTCTCTCGTCTGCTAAATCA
CCCAGTCAAGCCTTCACATCCACTAACTCACTGACCAATTCAATACACACATATATTGCT
TTAAGCACACGCCTGCGTGTGCATTAACCGCTCGCTGCCTGTTGCATGTTTTTTGTGGGC
GACTTCATGCCCGTGCGGAC
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