SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002239_2.0
Identity
PromotertRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesPetromyzon marinus (Lamprey)
Promoter IDSPR00002239
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002174_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00002239_2.0 # Promoter # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Lamprey (Petromyzon marinus) Full length # Forward
GACTCATCTTTAATAGGTATGCAACAATCGACCACCATCTGTCATTTTATGTCACGATTG
GGATCTTGATGCAGTTCAAGAATACTGTATTGTTTTTAATCTTGCTTGTACAATATTGTT
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TGAGGAAATATATTATGGAAGCAAAGACGTTCCGTGTGGGAGGCGTCAATCCCAGTTCTT
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TCTCCAACAATTCTGCTGAGCACTTCCCACGTCCTTGTGACCATGGGTTGGGAACCACTG
CTCTCGTGCATGCTGGCATTTGCAGGTGTGTGTAGTGTTACATTGGAAATATGTGCAAAG
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TTTACATAAATTTTTTCCCAGTTTCTTTTGATGATTGTATATTGTGCCCTAAATGTGATG
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TGGTGGGCGTCAAGGTGCAGTTGAAGTGGCACTGCGAACGGGGGCATACCTGCTTCTGGA
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TAACCCTCAGTCGCGTTAATATGTGAGGATCCAGATTTAAAACGTGTTATAATACGTTGC
AGCCCTTTGTAAGTGCACTGTTAGATGGTGACCTCCCCATGCTACTGTACAGGAATCGCG
GTGCCACCCACTGCACTCTACCAGCGACTCAGAAAATGTTCAGTGAGAAAGATTAACCCC
GTGCCGCAGGGCCCTCCTCGCGTTAGCCGCGGCTGCGAATCGCACCCCGAGGATCATAGC
CCAGCGCGCTAACCACAGCGCCACCACTCCAATGTTTTTGTGGAGGGCTAAAACATTTTA
ATGGGCGGCTATACCCTCATCTATATTTCGGGTGGGGGCGAGCGATAGTGCGTGTCGGTG
TTCCTGTGGTAAACACCGAATCAACACCAAACATCACCACCACCACGAACAACGCATGCC
GGACCCCTTCGCCGCCGCTTTCCGATGACGCGGCGCCCGACCTCTGGCTGCCATTTTGCA
GTGACGAGAGACGAGGCCACAGCAGCAGCCGCAGCTCCACCACCACTAACTACCACCGTC
GTTTTCTTTCCCTCGTCAGAGACCTTGCTTTGCAGTTGCATCCACAGTGAGGAGATACAG
AGACAACCAAAGCTGCAATG
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