SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002276_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein O (SelO)
SpeciesPongo abelii (Orangutan)
Promoter IDSPR00002276
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002211_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00002276_2.0 # Promoter # Selenoprotein O (SelO) # Orangutan (Pongo abelii) Full length # Forward
CTCAGGAACTATTTCTAAGATAAATAGTAAAGTATCATAGGGTATGTAGGATTAAATTAG
GAAATATATGAAAAGTGCTTAACATGTTAACTATTACAATTATTATAACATCAGGTTCTG
GTTTGCTGGGTTAGTTATTTCCTTTCTTCTTCAAGGTCCTGTAGGCTAAGAGGCAAAGTA
ATCAAGCCATTAGGAGGACTTTAAGGGTCACCTGTGACAAACTTGAACAACAATTTCTTT
TTCTTTTCAACTTATAAGTTCAGGGGNNNNNNNNNNCATAGTGACGTGTGCCTGTGGTCC
CAGCCATTTGGGGTGGCTAAAGGCAGGAGGATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCA
GTGAGCCGAAAGTTGTGCCACCACACTGCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCA
ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAACAGACAAAAAGAAAGACGAATAGATTATAA
TTATAGCAAGATAGCCATAGAACAAAGTTGTACAATTACTGCAGTGGGAGTAAATCAAGA
TTCCTTGTAGGTGTTATATGTGCTGCAGAAATCAGGAAGCAATTAAGGCACATTCTGGAA
ATAAAGCAAGATGTTGAAACAAGTTCAGGGTATGGTATCTGACTAATTAAAAAAAGAAAT
GGAACATTGGACCAATCGTTGAAATTTCTGTGACTTTCCTGTAAGCTAGATAAGATTAAC
AGTCTCTGGTCGTTTGGGGGCTTTTTGGTTGGGGCTGCTTTGCTCAGGAACATTTTTTAA
GATAAATAGTAAAGTATCATAGGGTTGGTATAGGATTAGATTAGGAAATATACGAAAAGT
GCTTAACAAGTGAACTATTACAATTATTGTAACATCAGGTTCTGGTTTGCTGGGTTAGTT
ATATCCTTTCTTCTTCAAAGTCCTGTAGGCTAAGAGGCAAAGTAATACAAGCCATTAGGA
GGACTTTTAAGGGTCACCTGTGACAAACTTGAACACCAATTTCTTTTTCTTCTCATCTTT
TAAGTTCAGGGGTCCATGTGCAGGACGTGTAGGTTTGTTACATAGGTAAACATGTGCCAT
GGTGGTTTACTGCACAGATCATCCCATCACCCAGTTATATGTATATATATATTTATTTAT
TTATTTGTTTTTGAGACACAGTGTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCACCAT
CTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCTCA
AGTAGCTGGGATTACAGACGCGTGCCACCATACCCAGCTAATTCTTTTTGTATTTTTAGT
AGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGCCTGGTTTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCT
GCCTGCCTCGGCTTCCCAGACTGCTAGGTTTACAGGCGTGAGCCACCGCGTTCAGCCCCT
ATCACCCAGTTATTAAGCCCAGTATTCATTAGCTATTCTTGCTGATGCTCTCCCGCCCCT
TAACCCCCTACAGGTGCCCGGTGTGTGTTGTTCCCCCTCAGTGTGTCCATGTGTTCCCCC
CGGCATGTCCGTATGTTCTCAGACAAGCTCCACCTTATAACTGAGAAGGTGCGGTGTTTG
GTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAAGATAATGGCTTCCAACTCCATCCATGTCCCT
GCAAAGGACATGATCTTATTCCTTTTTATGGCTGCACAGTATTGCATGTGTATACCACAT
TTTCTTTATTCAGTCTATCATTGATTGGTATTTCAGCTGATTCCATGAAACTCTATTGTA
AATAGTGCTGCAATGAACATACACGTCTATGTCTCTTTACAACAGAATGATTTATATCCT
TCTGGGTGTATACCCAGTAATGGGATTGCTGGATCAAAAGGTATTTCTACCTCTGGTTCT
TTGAGGAATCGCCACGCTGCCTTCCAAATAGTTGAAGTATTGACACTTTCACCAGCAGTG
TAAAAGTGTTCCTTTTTCTCCAGCATCTGTCGTTTTTTGACTGTTTAATAATAGGCATTC
TGATTGGCATGAGATGGTATCTCCTTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTG
ATGTTGAGCTCTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCATGTATGTCTTCTTTTGAGGAGTGTT
TGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTAATGGGATTTTTTTTTGTAAATTTGTTAAGTTCCT
TATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGTGAGATGGAAAGATTGCAAAAATTTTCTCTCATT
CCGTAGGTTGTCTCTTCACTCTAATGATCATTTCTTTTCCTGCACAGAAGCTCTTTAGTT
TAATTAGATCCCATTTGTCAATTTTTGCTTTTGTTGCAATTGCTTTTGGTGTTTTTGTCA
TGAAATCTTTGCCCATGACTATGTCCTGAATGGTATTGCCTACATTTTCTTCTAGGTGAA
CCTCACTTTCTTGATCTGTAATGTGAGAGGGCTGACCCACATCATTCCAGTTGTGAGAAG
TGCTATGGCGAAGACATCTGCTTAATTTTATTTAACGCACCAATTTCCAAACATTCGCCT
GCACGGTTTTGTTGTTTTGTTTAAGTCATTACTATTAACATTTTGCTGAACTCTTTCTCA
GTTTAGAAACTTCTGAACTAAATGACCCTTTTGGTCTTTTCTAGTGCCCAAATGCAGGGA
TTCCACGGTTCAGAAAACCATCTCCCATCTGAGTTAAATGTATTTGAAAGCATCTTATGC
TGATACTCACATGCACTGTTGAAGAACCAATACAAGACTTAAGCCCTGCAGAGTTTTGTT
AAGCTATTCTTTTTTGTAGGTTGTTTTTTCTTTTGGTACATTATATAAAAGTTTTTAATC
AGTTCCACGTTTGTGCTTCTTCTTGATCAGAAATTGTGTTATAAATATTTATTTGTAAGG
ATGACTTTGCCGTTTTGAATGACCAGTGCAGAAAACAGTTTCTCTTTTATTGGTGGAAAA
CTAGCATTCTGATTCCCTTGATTTCACTCCTACTTGTCAAATATCATTCTTTCTAATTCT
TTTTCATGGTGTGGAATATACTGAAGGTACTGTGGGCTTTAGAGCTCTCCAGAGCAACTC
TCAGTCTTGTGTTTTTACATTTATTCCTTGGATAAAATTAATTACTGGTGGTCTGTTCCT
GGTTAAAATGAAAAGTTAAAATATTAGATAGAGTTTTCTTAATTTAATGTTTTTCTTCCA
GAAATTAAGCATCATTTAACTATTTCACAGCTGTTTATAGAACTCCTTATATATTCTAGG
AGCTATAATAGTGAATGAGGCCTGCATTCTTCCCTCCTATTGCTAATATTCTAAGAGAGG
TGATAGATGAATAAATGAATTCCAATAACATCAAGGTTGTGATAAGGATAAGTATAGGAG
TCATGGGAAGTTACAGCATGTATTAGTCAGGGTTCTCTAGAGGGACAGAAGTAATAAGAT
ATATATATATAGGATATATACATAGGATGTATATGTATAACTAATAGGATATATATATAT
ATAGGAGATATATATATGGGATTTTATTAAGGAGTATCAACTAGCACAATCACAAGGTCC
CACAATAGGCCATCTGCAAGCTGAGGAGCAAGAAAGCCAATCAGAGTTCCAAAGCTGAAG
AACTTGGAATCTGATGTTTGAGGGCAGGAAGCACCCAGCACAGGAGAAAGACGTAGGCTG
GGAGGCTAAGCCAGTCTAGTCTCTCCACGTTCTTCCGCCTGCTTTCATTCTGACCATTCT
GGCAGCTGATTAGATTGTGCCCACCTAGATTAAGGGTGCCTTCCCAGTTCACTGCCTTTC
CCAGTTCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCAACACTCTCACAGACACACCCAGGA
ACAATACTTTGCATCATTCAATCCAATCAAGTTGGCACTCTCAGTATTAACCATCACACA
GCACCATCCTCCTAGTCCTGAAGAGTCAAAGAAGACTTTCTGGTGGAAATAATATCTATG
TTGAGAATGGAGTGATGTCTAAGTTAGCAAATGATTGTTGGCAATCCAGTATTGTAATAC
TAATGACTGTCTTTTGGGCGCTTGGATTATGTTGGACATAGTACAAGGCACTTTGCACAC
TTTACCATTCCTTCTTACAGCAACCTGGCAAGAGTTATCTCATTTTACAGAAATGAAAGG
CCAGTATCAATGAGATTAAGTAACTCAACCAAATTTCCACAACTAGTAAGTTGCATTGCT
AAAAGTTGAACAACCGTAAATATATTTTAACAGAAAATTTGGAAACGGTTAACCATGCAG
GTTCAAAAGCAATGTTTCTGGCTAGGTATAATATCTCAGCTCACAGCTATAATACCAGTA
CCTTGGGAAGCCAAAGTGGGAACATCCCTTGGTGTCAGGATGAGTCTAGCTGGGTAACAT
AGCAAGACTCTGTCTGCAAAATATTAAAAATTACCCGAGGTCACAGCACACGCCTGTAGT
CCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCCGGAGTTTGAGTTTGCA
GTGAGCGGTGATCATGCCATTGCACTTTAGCGTGGGCAATGGCATGATCATATTTGTCTC
AAAAAAAAAAAGCAATGTTTTTAGGTACAAATATATTCTTGATTTTGTATTGCATAAGTA
TAGGCAGATTTTCTGCTAATTGTTCCTAGTTCATATTCTTTAATTCAATAGATCAATTCT
AGAAGTTCTACACCTAACAAATTTGAGTTTACCTATAAAATGATGAAGGAACGAATTATG
TTTTACATTTATATTTTATTAAGTGAATTTTGCTTATGTTTTATTGATTGAATTTTTTCA
CCTTTATTCCAGTTATTGAGTATTATAATTCAAAAAATGCAATGCCTCTTTCTCGATGTT
GATCAAATGGCGTTGGCTACAAAAATTACTGTAAATGCTATAAAGATTAATAAACAACAA
TTTTCCTTTTTCCTCTTTAG
Chart Advanced