SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002423_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein T (SelT)
SpeciesRattus norvegicus (Rat)
Promoter IDSPR00002423
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002358_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00002423_2.0 # Promoter # Selenoprotein T (SelT) # Rat (Rattus norvegicus) Full length # Forward
TAAGGCACATATGTATTCAGAGAGGGCGGACTGGGCATGGCAGTTCATAGATACTTGCCG
TCCCGGCACTTGGAAGGCTGAGGTTGCAGGGTTGTTAGGAGTTGGAGCCCAGTCTGACCT
AGTATACATAATGAGCTTCAGATCAGGCAGGGCTTTGGCTCCAAAAGAAAATGAAGAAAA
GGAATGAAAACTCAACTAAGACAATACTTAAACAAAAGACATTTATGTACTTGTGATAAT
TGATCTAAATTACAGTGATATGATTCATAGGTTCATGGTGATATTATGTTCAGCTGCATT
AAGAATATCTGGTTGATGAAATCAGGATAAGCATATTATATTTTAGTCTATTTAGACTTA
CTAGATCAAAATACCTTCCTTAGGTTAGATGGTTTCTAAGCTATAAAAGCTTATCGCCCA
CAAACCTTGTGACTGGAGTCACAGCAAGGTGCTGGTGGACTCCTTCTCTGGGGAAGGACT
TCTGTTTTGTGTCCCATCGGGGAGGACATAAAGCCACCTAAGAATACTTAATAATCCTGG
GCATGACGTCGGAGCAGTCATGGCCATGTGATCTTGTCAGGTGGTGGCAGTCTGGATGTA
TGTAGCTTTCAGGAGCCCCCTTCCATCCTTGTTGGACAGGCTGTCCTTGTTTCTGCCTTT
GTGCTGTATATTTCAGGCTAGCTAGCACATGAGTGGTCTTCAGGGTATGATTCCCTCCCG
GCCATATGTATCTGGCTTTTAAAGTAGGCTCTGAAGATTGAACTTGTCTGAGCAAGCGCC
CGTGACACAAACACAGAGATGGGGTGTTTCCTGCCTGAGTTCTCCTGGGAGACACAGCAC
ACACCTCTTCAGGAATGGAGCCCACAACAACCCAAAGTAGCAATTGTACAAATGTCCAAC
CTGGCAAATCAGTATTTTATTGGATACTAACAGGACTGTGGGTAAGAGGTTTAACTATAT
GGAGCAGGAATGACTCAAAAAGCAGCTCACTTTCAGTTACTGAAAAGCCCACCATAAGAT
GGGTGATGAAATACAAAAGCTATAAGCCTGCTCCCCTATCTAAAATCTCTTTAGCCTGAC
TGGTCATAGTCTACCCTGCAGCTGTTTGCTTCTTTTATGAAGCTCGGAAAGGCCTTCAAA
TCCCGCTTTCCTAGATCTGTGGCTCTTTGTTCCTTCCTCCTCTCCTGGAGGGATGTTTCA
CTAGGAGGAAAATGTGCCACGGTAAAGTCAGAGGGCAACCTAAGGGGTTAGTTCTCTCCA
CCTGGTGGGCCCTTGGGATCAACTTCAAGTTGTCAGACTTGGCAAGGAGCATCCTTACCT
GCTGAGCCTTCTCACTGCAAAGGGGAAAATTACATTATGTTTTTGTAAAGTTGGAAATTG
AGGCATCATTGTTCCCTTTGCAGCTAGTATATTCCATTTTTAGAAATGTGTTTTAATAGG
TCAGGCTCACGTTTGAGCCCGGACCATGGACAGAGTGGCAGGGAAGCAGCAGCTCCTGCA
GGCTGTCCTCTTTCCACCATGGGTCCTGGGGATTGAACTCTGCTTGTTAGGCTTGGCAGC
AGGCACTTTTACACACTGCTTGTCTCAGACACATAAATGTAAATAAATGTTCAATCTTGG
TTTTCCTTTAGGAGGCAAGAAATGATTTGGCTCCTACTCCTGTCCCACAGAGTGCACCAC
GGAGCACTGTCACCCAGTCTGCTTCGGGTGATCCTGAAGTAGACAAAAAAATTAAGAATC
TAAAGAAGGTGAGGCTTGGATGAAAAGCAGATATGTACATGATGATTAAGAGTGGGACTC
AGGTGCTTAAAGCAGGGATTTAAAAAGTCCGTAACAGTTCTCATTGTTGCTTCATTTCCA
TAACAATATTGTAATTGAGAAGAGATCTCAGCTTAGTTCCATTCACCAATGCTTTAATGA
CTGGAACTGCTTGTGTGTAATTGTGAAGTAACACGGAATGATGGGGGCACATCTGTGTAG
GGAAGGCATGTTTCGTTGTCATGGCTGTGGGACTGGGGGTTGAACACGGGGCTCGTGCAT
GCTAAGCAAGTGCTCTTCCTCAGAGCCACATACCCAGCCTGGGGCACCTCCCTCAGCATC
TCGTTTGCTACACGAGACATCTCACTTATTAAGTGAGATAAAGGCCTTATTTCAAGTAGA
CAGGTACTTTATTCCAGTTTTTAAAAGGAACACACAAACAAGGGAGCTTATGGTCTGAGG
GGAGGCTTCTCTTAAGTGCAGAGATGCTGCCCTGCCGCAGTGGGATGCTGAAATAGATGC
CGGCCTCTGTGTTAGCCTTAGGAATCCACACCTGCCACTCAGTGAAAAACTTACTGTGCA
AACCTGACAGCCCAAGTCGGCTCCGACTCCCAGGGAGATGAAAAGAAAGGGAGAGGCGCC
ACAGAGCTTTCCTCTGCCCTCCATGTGTGTCCCGCAGCTTAGGCACCACACACTCACACA
GGATAACTAAACAACCAAAACTTGCAAAACCTATTTTACCCAAACCCATGTTTTTAAAAT
ATAATTTTATGTTTAACTTTTAACAAGAATTTATCCTTCCATTTTAACAAACCATTTTTG
AAAGAAATGTAGTATGGTTGTTGTTAATACCAAAATCTGCTGGACCAGAGAGATGGCTCA
GAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAACAACTACATGGTGGCTCACAACCATCTGTGATAAGAT
CTGATGCCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTACAGTATACTTACATATAAAAATAAA
TCTTTAATAAAAGAAAAATTAAGAATCTGCAATAGAAAGTAACTCTTCTTTCTCCTTCCC
CATATTTGGTTTTACAGAAACTGAAAGCGATAGAGCAGCTGAAAGAGCAGGCAGCCGCTG
GGAAGCAGCTAGAGAAAAATCAGGTGAGCCTGCCTTCGCTGTCCATTTGGTTACGGTCGT
TAATACAGGCAGTCCTTCCATCAGAAAGAAAAGCACAGAACACTGGCCCAGACCATGGTG
CTGAGTCACTACTCCTAAGGGGTCTCCTAATGCTCTCACTGTAACGGTAGTGACAGTTAT
GGGTTAGGTAAATGACCAGAGTTTCCTCCTTCCTGCCTGCTGGACTCTGTCCTCTCGTTC
TCCATACTTGTAAGCACAAGGAGATGCAGGAAATCTTGCACCAGAGGGGACAGCGAGGCA
GCTCTGCATTGCCCCTGACTGCCTAACGAAAACCAGGTAGAACTGCTTTCTAATCTGGGT
TTGCCAGTGACTCTGATAAAGTGTAAGAATACTGCATTTCTACCTTTTGTCCTTTATATG
CCTGGGTACAGGTTCATATTTATTTTCTATTTAATAACATTATCATTTGAAATGTTTCTA
GTTGGAGAAAATTCAAAAAGAGACAGCCCTTCTCCAAGAACTTGAAGATTTGGAATTGGG
AGTTTGAAGACTCACAGAAAGCGAATTTGTTAGCAGGAAACACTATAAGCAAGTCTGTTA
ATCCCATGGTGTTTATGGAATTACCACAGGTCCACCATTAACATCAGTCTATGTCTTTAA
CCATTTATCCAAGGTTGATATGTGTAATTATTTAATGATGTCTTTTCAATTGACTTTTAC
ATCTGCATTCTGTATCATGTCAGTATATAATAAAGAGAGATGATTTTTTCCAGATAAGCT
TAATAAATTGACAGACTTTTTTAAATGGTTAATAGTATTTCCTATATAAAAAAAAATAAA
GACATTTTAAATTTGTTTTGCCTCCAAGTTAAAAAGTTCTATAAAACCTGGCTGTAGTGG
CAGACATCTTTAATCCCAGCAGTCAGAAGGCAGAGGCAGGTGGATCTCTGAGATCAGTGG
CTACCTTGTCTATAGAGTGAGTTATAGGACAACCAGGGCTACATAAAGAAACGCTGTCTC
AGAAAACCAAAAATAAATAGTTCTTTATTATAAATTTACAGGATGTGTTATTCTTACCAG
AAAACTATGAAATATGTTGCTCTAATTTTTATTTTCTAAATGAAGAAACTTAAGTCCAGA
AAATTAAGGAATCTGTTGGGTCTGGAGCATAGAGAGATGGCTACTTGGATAAGGACACTG
TCTGCTGTCCCAGCACCACATGCAGCCATGTCCAACTCCCAACTCCAGGGGATCTGACAC
CCTCTTCTGGCCTCCACGGGCACCAGGCCTGTACAAATATACATGTGGGTGAGACATTCA
TGCACTAAAATAAAAATAAATATTTTTAAAAGAAAGAAACCTGCTGGTGTCAGGAAATGG
AATTGAAACCAAGTAGTCCGACTCCAGGGTCTATGTGCTGGGTTCCTGCAGTCTGCTGAA
GGGCAGTGTGACTGCTGGATCATACAGTGTATTTGTTTTTCTCTTATGAACACTGCCAAA
TTACTCTCTGGCAATTTGTTCTTCCATCATTAAAGTTCTTCACTTTTATCAGTGATGACT
GTAACAAGGCCTCTTATTTTGCCAAATTAAGAAAACAATTTTTTGTGTAATATTATTTTT
ATGTATTTAGAGGGGTGTTTATGTGTTTTGCCAAATTTGTCAGTTGTTCATATTTTATGG
TTTGTTTTTCCTTTGATTATTTCTCTTATCTGATTTTTCCAAACTTTTTTTTGGTAAACA
TTTGTTTATTGGGTGTTTAATTGTGTTTTGGTGGTTGGGTATGTGCCCTGGCTCACATGT
GGAGGTCAAAAGACAACTCCCAGAAGTCCATTCTTCCCTTTCATGTGGGTTCTTGGCATC
AACTCACTCATTTACCCAGTGAGCTGTCATGAAAGCACTAATATTTCTATTTAGGAAGTG
AAGGCATATACATTATTAACAATTCAAGGGGTAAAAATTCAACATAAAATGAAAACACAT
CTCTCACTTGTATTCTTTAGCAACATTCATCAATTCTTTTGTTCTAAAAATACAAAGTAT
ATGATATTCAATATATTTGTTCATATATATTTTAAAGAAATGATGGGATATAAAACCTGT
TCTGTGCCAAGTGTAATCCT
Chart Advanced