SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002480_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein U1 (SelU1)
SpeciesSarcophilus harrisii (Tasmanian devil)
Promoter IDSPR00002480
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002415_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00002480_2.0 # Promoter # Selenoprotein U1 (SelU1) # Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii) Full length # Reverse
TTTCTGAAAATCAAAAGCAAGTTTGTTACTCTGCCACTCTAACTGGAGCCAGAGGCTCTG
GCAAATATCCATAAGGAAGCTAATGTCAAGAGTCCTCAGGTGTTTACTAAATGCTTATCT
TGGGAATTACTCTGAGGGAACCAACAGTGATAAAAGCCAATCTAAGGCAGCTCAGCAGAT
CCTAGGTCTCAGGTCAGCTCACAAAATAGGCCTGAATCACCAAGGAAGCTCATGTCAGTA
TTTGGGCTTAGTTCTTACCATCCTCTAGAGCTTGCAGCTCTCTCTCTTTTTTTAATTAAA
ACTTTTTATTTTCAAAATGTGTACATAAGAAAAATAAAAAACAAAAAATACACTGAATAA
TTTTCAACATTCACTCTTAAAAAACCTTGTTTAGGTTTTTTTTCCTCCTTTCCCCCATTT
CCTCCCTTATATGGCAAGTGATCCAATATATGTTAAACATATGCAATTCTTCTATTCTTA
TTTCCACAATCATCATGCTGCACAAGAAAAATCAGATCAAAAAGAAAAAAAATGAGAAAT
AAAACAAAATATAACAGCTTTCTTTTCAAATAATAGCAAACTTTGTTTCAAATCTGCAAA
AGACTGTTTCTAAAATAATCCTTTGGGCAGCTAGTTGCACCCTGAAGTCAGGAGGACCTG
AGTTCAAATCTGGCTCAGACACTTAACACTTCCTGGCTGTGTGACCCTGGGCAAGTCACT
TAACCCCAATTGTCTCAGCAAAAATAATAATCCTTCGAGATAGGTAAGGTAACCTTTATT
AGATCATACAGCCTCACAACAACTTAGAAGGGTGGGCTTCAGACTTGACACACAGTAGGT
GCTTAATAAATGTGTATTGATTTGTGTTATCATTGGTATGGAAAACTCTCCGTTTCACCC
TTTTCCTCCAAATTCAGCATTCTAACATGCCTTCTTGAGGCATCTAAGTGGGTGGGGAGT
CAGGAAGGCCTGATTTCAATTCTGTCCTTGAATATTTAATAGTTGTACAGCCATGGACAG
GTCATTTAACTTCTGTCTGCCTCAGTTTTTTCAACTGTAAAAAAGTTTTTAAAATACCAC
CCAGGTTTGTTATGAGGAGGAAATGAAAAAATAAATATAAAGTGGTTAGAATAGTGCTCT
GCAAATAGTTAGAGCTTAATATATGTTTATTTCCTACTTTTCTTCCCTCCAGGTTCACAT
AGCTAATAAATATCATAGGTAGGATTCAGGTCCACATTTCTTCAAGTCTAGCACTCTTTT
TATTATATACTACATTGATCCAGGGTGGCGAAAAGGGGAAAAACTCAAGGGTTACTTAGA
GGGCAGAACCAAGAGGATTTAATGATTGGCTGGATGTGATGTTGTGAAGGAGCTGAAGAT
TGCCAAACTATAGTTTCTGAGTCAATACTGGATAATATTCAGCTGAGGCTGTTCCAGTCA
GCAACACTACAACAATGGTCCAAGGGCTTGCACTACTACCTTAAAAATCAAACTCCAGCC
AAAATCACAATGGTAGTTCTGGCTAAATTGGCCATGCCATCCTTGATTGCCCATACCACA
AGGCCCGGAGTTTTCTTCCTTACACTTAGACAATTCCTCTAATTTCCTGATATGAATGTA
TGGCTCAGATGAAAATACTGTTTAATTGTTGGGTTAAATTCCAACCTTAATGTTTTCCTC
AAATCCTCCCCAGAGAGATTTGAGGCATGATAGTTTCCAAGTCTGTCTGCGAAGGTTAAT
TTAGTCTGACCCTGCAAGAGATTCTTATAAAAATAAAAGAAAAATTAACCTCTATAGTAG
ACCTTAGTTTCCTCATCTATAGAACAAAGAACATAGAGATTAGACTAGCTAAGTGGCATC
CAACTTAATCAGAAACAGAGGCCATTAAAATGCACAGAAGGGTCCCAGTGGGCTGCCTGC
TGACAATTTTAAAGTATGTTTATTTATTTGGTCAAATGTCTTTCAATTACATTTTAATCG
GGTTTGGGCCACACTTGGGGGTGTTGTAGGCCACAAGTGGCTCATGACACTTTATGTTGC
CTTGGAAAAGGTCTCCAAACTTAGTGTTCCCATGATTCTTTTTTGATTCACCTTTCACCT
CTCACTCACTCCTTTCCAGTCTAGTCTTTCTTCATTGGATCTTATGGCTATTAACTATGG
AAGGCCCCTAGAGCTCTGTTCTGGACCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTCCTTCTATATTC
AGTAACTCGGAGAACCTCAAAAAGTTCAATTAGCATCTCTATGATATGATTCTCAGTTAC
ATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATGTATACATTCACAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACACCCCTCATTCTTCTACTAGTC
CCACATTACTGTCTATTGGACATTCTGTTCTGCATATTTTGTAGCCATTTCAAATTCAGT
ATATCCCAAGTGACACTCATTATTTTCCCTCACTCTCAGCCCAACCCTACTCAAAAAAAA
TTCTCTACTTTACCATTTTGCTGTTAAGGACACAATCAATTACTTGGTTTATCAAGTCCA
GTGTCATCCACCATTCCTCACTCTCACTGACAGCACAGATCCAATCAGTTACCAAATTTC
TTAATTTCTTTGTTTTCAAATGTTTCTCAAATATGTCTCCTCTCCATTTAAACAATCACC
GCTTTTGTTCAGGCCTTGATCACTTCTCATCTGAATTATTGCACTGGCCTTCTAATTTGT
TTCCCTGCCTCAACTTGTTCCTCACTCCAATCTTTCTTCCAAAAAACTGTCACAAAGATA
ATTTCCTAAAACATGGGTCTGTCCATACCACTCCTCTACTTAATAAGCTACATAAACTCC
TTTGCTTGGCATTTAAAGCTCATTACACTCTGATCCTGGCTTATTTTTCTGCCCGTTTAA
CATAGATTTACATCCATGTGGTCTAGAGTTCAGTCCATACTGGCCTATTTGTCAGCCTCC
CACACAGCCCTTCATCTCCATTGAACTGGCTAGCTCCCACATTCTCTCCTCAGTTCTACC
TTTCAGATCTATGGCTTCCTTCAAAATTCAACTCAAGACATTTTCTACAGACAACTTTCA
ATGGCTCTACCTGCTGCTAGTCTTTCACCCTCAAGTCAGCTTCTGCTTAATTTTTATGTA
ACTCATACATACCTATTTGTGTTTTTATAATCTCTCCAATTAGAATGTAAGCTCCCCTCC
ATTGGAGAATGGCTGAATAATTATGGTATATGAAGATACTGAAGTATTTTTGTTCTATAA
GAAATGATAAGCAGGCTGATTTCAGAAAAGTCTGAAAAGACTTACATGAATTGATGCTGA
GTGAAATGAGCAGAACCAAGAGAATCTTGTGCAAAATAAGATTATGTGATGGACTTGGCT
CTTTCCAACAATTAGGTGATTCAAGGCAATTCTTAGGATGGAAAGTACCATCCACATCCA
AAGAGAGAATTATGGGGACTGAATGTGGATCAAAGCATTAGTATTTTCACTTCTGTATTA
TTGTTTGTTTGTTTACTTGGTTTTTTCCTCCTTTTAATCTGATTTTTCTTGCACAGCATG
ATGAACATGGAAATATCTTTAGAAGAACTGCACATAATTAACCACCATCAAATTGCTTGC
TATCTGAAGTGAGTGGGGGAAGAAGGGAAAAATTTGGAACACAGAGTTTTGTAGTGGTGA
ATGCTGAAAACTATCTGCACATATTTGGAAAAATAAAAAAAACTATTTTAAAAAAAGAAT
GTAAATTTTTTGTAGGCAAGGACTGTGTTTTTTTCTTTGTATTTCCAGACTTTAGCATAG
TGTCTGGTACATTGTAAATATATGATAAATGCTTCTTATATTAATTGATTGCTTGTCCAG
GGAAAGGGGACAAAGATATTTTCATGATTCTGATAACAATAACAACAATAAGAATTTATA
TAGTGCCTACTATGTATCAGGCATTGTACTAAATGCTTTAAAAATACTATCTCATTTGAT
TAACAATTTGAAGTGCTATTATTATCCCGCTTTGACAGTTGCAGTAACTGAATTAAACAG
AGATTATGTGATGTTTCCAGGATCATTTAGGTAGTGGATTTGAGCCTGGATTTGACCCCA
GATCTTCCTTATTCCAGGTCCAGCACTCTATCCACTAAATGATTGTCAACAAACATTTCT
TCATCCTTCACCACATTTCTAGGCACTGTACTAAGTTCTAGAAGAAAATATTTCTAAAGA
TATTCATTTATATTTTGTAAATACCTTAAAATTGTTTTTATGACTTATCAGAACTCCACT
GTCCCTGACTCTCCTCACCCTATTCCCTACCAGCCAGCTTTTTAAGTGATGATGATGGTT
TTTGTTCCATTTCATTGATCAAGAATTAGAAAACAGGATAGTCTATTCCCTTAGCCCCCC
AAGTCTTAACAATTCTCATCTTTGAAACATCTGTGATAGCCACACGTTTATAATGAATAA
GAATAATTATGAAGTTGAGTCCAATCCTGGGATGAATCTGAAGTAGGGTTTGGGAAATAT
AGTTAGACTAAATAGAATTATGCATTTTGGGTTTTTATGTATTAATATTTATGATATACT
ACATACATATCTACTTATAATGAATAATACACAAACCACACAGACATACTCATTTGCAAT
GAGAGCTGATATTCACATATATTCTTTTATTTAAGGCTCACAAAAGTCTTGGAAGGTTAG
TCTAGAAGCACTTTTAAATGAGGAAACAGATTCAGAGAGATTAAGTTATTTGTCCACAGT
CACATAAGTATTAGAGGTAATATATCTGAGTCCAGTTCTTCCTGCCTCTAATTGTAGCAT
TCTATCCATTCTGCCAGGTTTCCTGCTACATTTAAGGATATAAGAATACATGTGTTCATC
ACTTCTATGCAATCATTAGACTGTGCAGTTCTCCATTAAATTATAAGCTTCTCGAGATCA
GGAACTGTCTTTTACTTTTC
Chart Advanced