SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002517_2.0
Identity
PromoterThioredoxin reductase 3 (TR3)
SpeciesSorex araneus (Shrew)
Promoter IDSPR00002517
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002452_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00002517_2.0 # Promoter # Thioredoxin reductase 3 (TR3) # Shrew (Sorex araneus) Full length # Reverse
GTTCAGAAGGGAGGAAGGCCACGGGAGCGCAGGTCACAAACGGTCACCCCTGGGGCCGAG
CAACAGCACAGCGGGGAGGGCGCTTGCCGTGCATGTGGTCACCCGGGTTCAAGCCCTGGT
ATCCCCCGTGGTCCCCCAAGCCGGCCAGGAGTGATCCCTGAGTGCAGAGACAGGAATAAG
CCCTGAGCACTGTCGGGCGTGGCCCATAAACCCATCGCACCCCCCGAATTCATTCATCCC
CTATGTTAATCAGCACGGACTGAGTTTATAAAAACCTTAGAAATGGCGGGGCATTTAACA
AATATAAGGGATGTAAGAGAATCTCTTGCCTGCGCGCCTGGCTGTCTTCCCCGGGGCCCC
TTGGAGGGGATGGGCTCCAGCTTCCCTCCCCACCCCGAGCAGAGCTCCCGGCAGCCGAAG
ACCATCGGAACCTAGCCACAGCCATGCTCAAGGCCCCTCTCCACACGTTCAGATGAGCCT
CATGCATGACAGAGAACCAGCAGAGGAACCCAGGTGTGTGGGACCCGGGGCTGAGACNNN
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CCATATGGTCCCCTGAGCACTACCAGGAGTGATTCCTGAGTGCAGAGCCAGGAGTAACCC
TTGTGCATCACCGGGTGTGACCCGAAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAGTTGGTGAAATTGC
ATGAAGGCAGAGAACATGTTTTATTCTGCTCACAAGAAGTCTCGCAGCCTGTATGTATAA
ATGAATCACCAGAGGCTGGCAGGGGCACGGGTGCCAGGAATGCCAGAGGGTGAGGTTCCT
GCTCAGGGGAAAAGGGACCAGGAAGTAGGGGAAGGGCTCTTCTCCACAGCCTGATGGGCG
GCTGTGGGGGCCGAGACATCTGAAAGGCCTAGCGCCCCCGCAGGCTCACCCAGCCACCTT
CCGTCCACGCCCTCAGATACCCAAAAGATCAACATAAGGAAGCTACCCACGTTTAACGCA
TAGAGGGGCATTTTCTGCAGGGCTGAAGTAATAGTTTCAAAATAGTTTGTGCCACCCAGA
GACGAGAGACAGCTGACTGGAACAGAGAGCAGGAAAGAAGGCGACCTTGGGGGGCATTTG
TGACCATTCCCCCGTGTGTACTAACCACTCTACTTACCCACTTGATCCAGCTCCAAGGAG
TTATATTCAGCTCCCAGAGAAGAGAAGAGTTCTTTCACCTGTAACAAAAATTCATCTGTG
CTTCACTCTCAGAGATTCAGAGGGAGGTAGGACACGTGGGCACCGTGAGAAGGCGTGTCC
AGTCTCACTGGAGGGCCAGAGGCAGCGCTTGCCTGGCCGAGTGAGGCCCTGGGTTCCAGC
CCCAGCACTGAAAAAACAAAACAGCTGCTCTCAGGAGTCTGAGCCCGAGCCTCCTCTTCC
CCTCCGCCTCGGCATCCCTCAGACTCTGTCACCGCCTTTGCCTTGGAATTCCAGGCCTGT
AACTTTTGCCCTGGTCCCTTTTCTCCTTTTGTTCTCTCTTTTTTTTTAAATTTAATTAAT
TTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTGTTTTGCTTTTTTGGTCACAC
CCAGCGATGCACAGGGGTTACTCCTGGCTCTGCACTCAGGAATTACCCCTGGCTGTGCTC
AGGGGACCATATGGGATGCTGGGATTCGAACCCGGGTCGGCCGCGTGCAAGGCAAACGCC
CTACCTGCTGTGCTATCTCTCCAGCCCCAGTTTATTTATTTTTTAATTAGTGAGTCACCG
TGAGGCCTGATCCCTTTTCTGAATTCAAAGTGGGCAACACGCACTTCTCTGCTGGCCGCC
CCAGGAATTCCCACGGTACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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