SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002557_2.0
Identity
PromoterMethionine-R-sufoxide reductase 1 (SelR1)
SpeciesSus scrofa (Pig)
Promoter IDSPR00002557
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002492_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00002557_2.0 # Promoter # Methionine-R-sufoxide reductase 1 (SelR1) # Pig (Sus scrofa) Full length # Reverse
TGGCGCCGACGGGGAAGCTCCGGCGGAACCGAGGACACAGCTCCACCGCAGGGTCTTGAG
CCTGCCTCCCGCCCCACCTCCCGAGAACCAATCGCGCCGGGACGCAGGATGGGCCGGGCA
CCTCGAGGCCCCGCCCCCAGGGGAACCAATCACATCCAGAGGAGTGAGACACCCTCTCAG
GGTTCGCCTCCCGTTGACCCGCCCCTTTTTCACAGACCAATCCCCCGCCGGAAGAAGGTT
CTGGTTCCTGCCTCCAGCAGGCCCCGCCCCCTTCCGAGGACGGGCTCCCTCTTCCCCTCA
GGCCACGCCCACCACTGAGGACCACTCCCTTGTAGCATCCCGAGGCCCCGCCCCTGCCGC
CGCGTCCCCGAGCACCAGGGGGCGCCGCTGAGCTGCGCTGGGTTTAGGATGGCGACCTCG
GTGCACCCTGAACCGCGGCGGGTCTCATCCTTTCCTGGCGTGAAGCACCAGGCTACCGGC
CGTTGACCAGGTTTCCCTTGCCCCCACATCTGAAACACCACTGGAGGAGTTGCCTCTGGC
TTTTATTAGGGGGCTCAGGAAGGGGTTGCATCGCGTTTTTCAGGCTCCCTCCATCCCATC
CTGCCTACAAGTCTCCTGAGGTCTCCGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TAGAGCCCCTCCTGCGGATGCGTGTGGAGGCACGCGTGCCACGCCCGCCCCACGCTGGGG
CAGGAGGGATGTGGTGTCTGAGCCCCAGAGAGCAAGGCGGATGGGCTCACCATGAAGATC
CTCTTCTCTTGGGCTGTCTGGAAGCGGCCGTGGCCGAACTTGGAGGTGGTGTCGATGAAC
TTCAGCTCAACGTTCTCCAGGGCCCGGCGGCTGTGGTGCACCAGGAGGGACTGGGGCCCG
TGGGGGAGGGGAGCGTCAAGGCAGGAGGTCCCCGCCAAGCCCCTCCCGTCACCCCAGGTC
ATCCAGGAGTGCCTGGCTCACCTAGCTGGGTCCGTCCCTCTTTGCTCTCCCCATGACCCA
NNNCAGCGCAGGCCAGCCCCCCAGCCCCCCGACAGCCCACAGGCCTCCCACTCTCCGGCC
CACTGCCCCACCTGACCTTCCTCAGTGTGATGACCCGCTTCTTGGTGCCTGCAATGCAAC
CCTTCAGCATGACGAAGTCGTTGTTGACTTCCCCGTAGCGGGGGAAGCCACCCTGCGGGG
AAGGTGGGTCCGGGAAAGGGGCTGCTGAGTTAGGGGGCTGCTGGGGTCCCTAGGAGGACT
CCCCTGGCCTTGGGCGACAACACTCTGAATCACTAATCAGGCCAGCCTGTGAGCCATGCC
TTAAGTCCTTTCCATAATTATCTTAATAATCTGCATTTTACAGCGGGGGAACCAGGCTCA
GAGGGTCGCTTGCCCCAGGCCTGGCAGCTGCTGCAGCTCGGGTTCTTGCTACAGTCAGAG
CAGCTGCACTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TGTCTGCAGAGAAGGCGGTGAGGATGCAGGAACAGGAGCGGCAGGGGGCTGGTCCCCCTG
GGGGGCCCCAGCCACCCCACACACACCCTGCTGCCTCAGCGGAACTGGCCGCCGCCCCTC
ACCAGCGGTGTGATGGACTTGTCGGTCATGTCGTAGCTGGTGGACGCGTTATTCTTAACC
ATCTTCCCATCCGACATGTGCAGCCCTCGCCCAATGCGGTAGATCTGTCACGANNNNNNN
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