SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002644_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein J (SelJ)
SpeciesTakifugu rubripes (Fugu)
Promoter IDSPR00002644
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002579_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00002644_2.0 # Promoter # Selenoprotein J (SelJ) # Fugu (Takifugu rubripes) Full length # Forward
CCGAGGCCATCGGAGGAAAGAGAGGACTCTAGCATTAATACCTGTCGTTGTCTTCAATGA
ACTTGACCAGCTCCTCCTCAGTGTAAGGTTTTCCTGGGATGAGGACTGGATCATTCATGA
AGGGCTCGTAAAAGTCCACCTCATTGAGCTTCAACTCCAGAGCTTTGGCCACCTGTAATA
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TCTTCTCCCATATTAAGTGTAGATGCAGACTTGGATCTGGGCTAAAAATAATGGATGCAG
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GCACTAAAATGTGGGGATGGGTCGATCAGGGACATGGAAGGAGTGAGAAGAGGGTGCTGC
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CAGTGCAAGGCCGTGTTCATCCCTGGTAGCTCGCGTGTTTTATCCAGCAGGTTACCTGGT
TACCTGGTTACCTGTCTGCGCAATCGGCAATTGTTTATCGGCAAAATGTAACTCGCGTTC
GGCGAAAATGTGCAATTTATGCCGTTAAACGCTGGTCGGTGGGGTAGGCAAAACAATGGA
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CATTTGTATACATACAATACCAATTAATCGTAAATTTAATTGAAACAGGACTCGTAACTT
TGATTGACTTTTTTTTGCAG
Chart Advanced