SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002752_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein U (SelU)
SpeciesTetraodon nigroviridis (Tetraodon)
Promoter IDSPR00002752
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002687_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00002752_2.0 # Promoter # Selenoprotein U (SelU) # Tetraodon (Tetraodon nigroviridis) Full length # Reverse
TCTTTGCGCTTCCTTGCTTGGTTTTTTCTCACTGCATGATTCTAACAAGTCTCCAGACAC
ATCCTGGTGCTGAGCTCTTTTAAATTCCAGCTGGAGTAGATCCTCCCAGAGTTACCAAAC
CTCCAGCCCCCGTCTGGATCAGATTAATTTATCACACGCAGCTGTGTCCAGACATGCAGG
TCGTTGTGAAACCAGAATGTTTTCTTTCCAAGATTAAGTTGGAGAAAAGGACAGAGGATT
GTTTCAAAGTTTCCATTAATAGAATTTAAACCACCCACATCTTTAAAAGAACGGCGTGTT
CATCCCGTCACAGTTCTGATTAACACGGCGGTTCTTACATAACCCTCCCCAAAGTTGGGA
AATTGCAAAAGAGCTGATGATTGTGGGATTGGGTAAACATAAAGGTCCTCTCAGGTCACT
TTAGTGCTCAAAGGTCACTGGCAGAAAAAGGCCACCCCTCTGGTCCCTGTGGCCCATAAG
GCCACAGGGACCAGGACCAACCAGGACCAGCGTGGCTCTCTTGAGTGAAGATCGCTGCCA
GATCCCTGACAACAACCTGCTGCTGCCCCTGTTTCAGGCTCCTTTCTGCTCTTCAGAAGA
ACCAGACCGAGCCACACCTTGATCAACCGTTTATTTGAGTTCATTCTTCAAATGTTGTCC
TGACTGAAGAGGGTCCTGATGCCACCTGCTCTGCTTGTTCCTCTTCCTCCTGAAAAACAA
AACCAGGGTCAGATACAGAGGATTGTGCGTCTGAAGACCACTTTGGTCCTGTCCCAGTGG
CGCCACCTCCACCCTCGTCTACAAACCATCGGTTGGGCGTCTCCTCCTGCGGGAGGAGAG
TTTTCCTGGTGCTCCTGTGGACCATCTTGACCTTCACCTGATGGCTCTGCTGCATCACCG
TTGTCTGGAGCTGAGCTAGCAGCAGCACCGCCTTCTTCCGTCTCCTGAGAGGAAGCAGTC
GCAACAGTCACCACACACACACAAGCCTTTGATTCCTGCGTCAAGGCCTCCGTTTGGGTC
ACCTGGGGCTCAGCGGAACCTGCTTGACCTTCTGCAGCTGGAGGTGACTCTAAACCACCG
GTTCCATCTTCATCAACCTGCTGATCAAACACCAGAAGGCTGAAAACTCTTCCTTCCTCA
CTTGTTCCATCATCTCCCCATCCTTCAGCACCACCTTGGGTGTGGGTGAAGCAGAGTGGG
GGCTTTGGTTGGCCTGGACCTCCTCAGGCTCAGCGGTGTGTGAGTCCTCCGGGTGTGGGG
CTTGGGTCCGCTCAGGTTCAGAGGTTTCAGCCTGAACACCACCCAGACAGACGCCATTAT
TAAACGCCATCATGGAAGATGTTCTTGTCGTTTCCCACTAGCTTCACCTCCTTGTGGTCA
TCATCAGCTTCTTCTGTTGTGTTTCTCTGCTCCACCTCTGCTTTCAATGCTTCATCGACC
TCCTCCGGTGTTTCTGCAGGATCTTCTCTGCCAGGAGCCTCAGAGAAGGTGTGGCTACTG
ACCTCCACAGGGCTGGTACCTGCAACCTTTACCTGACACACACACACACACACACACACA
CACACACACATGGCTCAAACCAGTCCAGGTGAGCTCGTATCTGCCCCCCAGCGCTATGAC
TGGCCCTCTGTGATCACCTCTGGCTCTGTGTCAGTTTCTCCAGGTCCACCTTGAGGCTGG
ACTGTGTCCGGTTGGTGTTCTGGATCAGGGCTGTCCAGTTGTTCTTCCGTCTTGACGGCG
TTCTCCTCAGCAGCTTCAGTTGTGTTTCCATCCATCCCAGCAGGCTCCTTCTCAGAGCTC
TGTGGTAACGTACCAACACGCTTAAATACACAAAGATACCCCAAAGAAGCCCACATGTCT
AAAACGTACTTATTAGAAACAAATGTAATAATTGGGCCAGTTTTTGGTTAAATCCCAGTA
AGTCTTCATCACCTCAGACAGCTTGTCAGACTTCTCCAGGGCCTCACTGATCCTTCCATC
CTGCTCCTGCAGCTTTTCCTCTCTGGCCTTGGCCAGCTCCTGCTCCAAGAGTTCCCTTTT
AGCCCTTTTCTGCAAAAAAGTGAGGTCTCAACATGACTTGGATTGATAAATGCACAACAT
CCTGAATATGATTGAATGATGCCGAGTATTTATTGGGCCTAAAGCAGACAGTTTACGGAC
ATGCAAGGCTGGAAAGAAAAATGTTTTTCTGTGTATATACCCTCACTGAATGTGACAAAT
ATGTCCAGATGCTTCCTGTTATTTATTCTCACAGATTGTTTTCAGTAGACATTTTTTCAC
TTCTGTTCTGCAGGAAACGTCGCAAAAACAGGAGAAACAAAACCAAAAACGTTGCTGGTC
GGAAAACCTATGTTGTAAACACATTTGTGTATTAAAAGACCAGTTTCATAATCAAAAACT
TGACCAGACTTCTGCGTTTAACCCCCCCGCGCGCACACACACACACACACACACACACAC
ACACACACACACACACACACAGTGTGGTGTAACACTGCCCTCTAGTGGGAGACGGTGTTG
CGGAAGGCGGAAGGTTACCTCTTTTTCGTAGAGCGCATTAGCGTTGTATTTAAGAAGCCA
GTGCGCGAGGTGCCTGATGGGGTCTGCCGGCTGCTCCTCCGCCACTTTAGCTAGTCCCTC
CGCCAGACACTTTCCCAGATGTTTCTTTAAATATTCCGAGTCCATCTTTCTCCAGGTAAT
CAACAGCTGACCCAAAAAACACTTTAAGAATAGTTGGAAATAAATACGTTTCACTGATAC
TTTCTCTTACTTAGTGAAGATGTCGAGTTGTAGGAAAGTAAGTTACCAACCCCGCTACTG
GGTGCGCATCCGGATGTAATGGTGATGTCGCTATGGTAACGGGGTTACATTCTTAATCTT
CCCTCCTTTTGAAAATGGTTCTCGTTAGCTGAGTTTAATAACATTTAAACGTTGTAAAAG
TGAGAACGTGGTAAACACATGAGTTTACAATTTATATCTACTTAATTAAAGCCAAAATTA
AATCAAGACACGCCTGATGGATAGATAAGGCACTATTTTAAGCCGTGAACGTAATATTTA
TTGTTTATACATTTTTGTGAAGTTAATTTTGGAGCGTATAGAGAGCAGAAGGTAGGGAAA
TTTACAGCAAGCACAAGTAAAAAACAAACAAACAGATGACTTGTGTTGAAATAACAGATA
TCATTTTCCGTGTATAACCATAGTACACACCTTTGGTCTAAATATAACTTTGAGGATCAA
CTCTCTGATTCATGGCACTGATGCACTGAGCTTTCCTTTTTTACTTCTGCAGATGGAATA
ATATTTGCAGAACAGCCCCCCCCCATTGATTTTACTTCAGAAGCAGGTATTTGAGCACAT
CTGAGAACAAGATATAAGTTTTACCGTTTCAAAGAAAGATATAGTTTTTGGTATAACAGT
CAGGTTTGAATTTTTTATGCTTTTTTTTATCACAAAAAAAAGCATATTATGGGTGTACTA
ACAATTATCGTGTTTGCACTCAACATTTTCAAGTCAGCCTGAATGAATTAAATAACAATA
CATTAATTCTTCAATACATGCATGGTAAAATACTGTAATCCACTAATATTTGCACTAAAT
TAGTTCTTTGAGTACTTTTTGCTTATGGACATGGACACAGTACAAATTCTCCCCATGTTT
TTTCCTTATAACATCATTTGATTACATATTAAAGCTGCAGGGTGTACGTTATTTATAAAA
ACAAAATCGAAAAGCAGATTGTTTCAATATTCGCTAAATCTCAGTCCAGCTTTTGCATGT
GTGGTTTGTAAGTAGGGTGCTTGACCAGTGGAAATGCACGCTGCAGTGGCCAGCGGTGTG
GGAATGGGGACGGGGACGGGTCTCTCCTCCTGACGTGTCAAAGGTCCGCTCTGAAGCTAC
CTGGAGCGCCTCCTCCGGTTTCACTGCAGGACACCACTGCGTCAGCAACAGCTGTCCTGC
AGCCCTGCACTGGCTCGCACACGCGGAGAGCTACGCCCTCGGAGTGAGGCTTGACACAAG
AGTTTCCCACTGCTTCATTTTTCAGAGGAATTTTGTGGAAGTATTTGTCATATTTTGCAA
GGTAACCCGTCACCTGCTTCGCCTAGAGCCTGAAAATAAGCTGCATGGAAAAGAAAACGT
TTCCAGCCCGTCTCCAGACTGGAAGACTCACAGGCTCTGAACGACTTATCGGCAGTGCTG
GTTTTCATGGTTGTTATTTTGCTGTTTATTCCTCATATTGGCTTTTGGCTTGGCTGCTTT
ACTTTTGTCTTCAGAATATTTTGTTTGATAGAGAACAGTTTTCATTCCAGACAAAGGTCA
AAAAATATGTTGGTTTTTTAACCCTCAAAACAGAGATCAAATCAAATATGTATTTTTCTG
ACGAGACTAGCTTTGACTAATTATAAACAAGGCTGTAAGTGATCCTGGGTCAGAGGTCGT
GGAGGCTTTGCACCAGTTTCTTCTAGTTTGAGCCTGCGTGTGTGTTGTGAAGGTGACAAG
CTTTTGCTGTTTAACGATAGTAAGTGTGAGTGGAAAGTGCACATGAGCATCACAACAGAC
GCAGGTGACGCCTCAGACACACGGCAGTAATATCCAGTGCGGACGCTTCACAACCTTCTC
AGTGCCCGGTGAGCTTTCTCCCTCCGGGGCTCAGCCGTTATTTTTAGCCGGTGCTTTCAT
GACCAACAGGAACGATACTGCAATGCTGTAGATGCTCGTATCGCAGTATTTCACTCTCAT
TAATCCATGCTACCCTAGTCAGAGCTCTGCAGAGACCGGTTCTACTCCAAATCTTGGAAG
CGGTGGAGACGGGCGCTCCGGAGGACATCTTATGTAACCGGATGGGCTCCGGTCCCAGCC
AGAGATCCGAGGCAGGGTTTAACACGGCCGAGCTTCACCAGGCGCTGTTTTAAGCGCTTA
CGCTCATTTTTGGTTGCTTTTTTTTGGTCATTTCTATCATTTGTGCTGCTCCAGTCTTTC
CTAATTGTAGCGATTGTCTC
Chart Advanced