SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002896_2.0
Identity
PromoterSelenophosphate synthetase 2 (SPS2)
SpeciesVicugna pacos (Alpaca)
Promoter IDSPR00002896
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002831_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00002896_2.0 # Promoter # Selenophosphate synthetase 2 (SPS2) # Alpaca (Vicugna pacos) Full length # Reverse
CCTACGCCTGGGGCTCGAAAGGTCGGTAGCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGGAATGGTAGTTAGTTAT
TGCTGCGCCTTTTGTAATATCAACAGACTGGAAACAACTTAAGTGTTTATCAATTATGAT
GAAAATAAATTATGATACATTTACATTACAGGCCACAAAATAACTGTAAAAAAGAATAAG
AAAACATTGATGTGATTATATTGATAACAGTTATAGTTCTAATAGGCACAATTCTAAATG
CTTTACATATATTAACTAACTTAATTCTCATAAAGACCTTATAAATTAAGATTCTCATGA
GATAATTCAGATAAGGAATATAAGGCACAGAGAGATTAAATGACCTGTTCAAATTCACAG
CCAATTTGGGGTGGAGCTGGATGTGAATCCATACAATTTGCTCCAAAGACCACCAGATTA
TACTTCCGATGATGTTTGTTAAGAGAAACAAAGACGCTTCAGAACAGTATGTATAGAACA
CTATTACTTGTTTTTAAAAAAATAGGAAAGTATATACAGAAGCATAGCTCTGGAAGAGTG
ATCACCAGAAACTGGATATTTTGATTGCTTCTGGGGAGGGAATGAGATGATAAGGGAAAA
GGACATTTTTTCCATTATATTGTCTTTTTCTTGTTTTAACATTTGGAACTTAAAAAAATT
CTTTTAAAGTTTAAATGTAATACATACTTGAAAAAAAATTAACTGCCTATGGGAATATAA
ATTGTTGCACACATTTTGGAAAAGAGCTTGGCCTCAACTGATAAATTTGGACATATGTAA
ACCCATGCAATTGCACCCATAGGACATGCCCTAGAGAAACTGCTGCACGAGTGCCCCAGG
TGATATATACAAGAATGACTGTCATTGCACATAAATTATACTTCAATAAATAATTAATTG
ATTAATTAAAAATGTAGGAGCTCTGGAGATTGATTGCATAACAATGTGAATGTACTTAAC
ACTACTGAACTGTACAACTAAAAATGATTAAGATGGTAAATTTCATGTTATGTGTATTTT
ACCACAATTAAAAATATTAAAAATATAGTAGATACTCATAGATCTTATGGTACATCGTTA
CAGTTGTTTTTAAAAATACTTTTTAATTGAAGCATAGTTGATTTACAGTGTTAGTTTCAG
ATGTATACATTTGGTTTTTTATTATTGCACAATACAGTATTAAGTTCTGGAGTGAATTGG
AAGGACCTAGAACATTAGAATTAGACTGAGTTCAATCTTGGCTCTCCTAATGACCTTAGG
CGAATTGTCTAACCTGTAGGAAAATCACTTTCATTGCCTATAAAATAGTCCTTTCACCTG
AAGGTAATAACACTTATCAAATAGCAATATTATGCTAGTTAAAATTTAAAATGTGTATAA
AGCACCTAACACCGTTCCTGGCTGATGGTAAACTCAAACTAAATGACAGAACTTATTATC
ATATAATACCATTAACATGGGTACAGGGACTGGAATTCAAATTCACAAAATTTATAATAC
CTTGAAAATTTTTTTATAAAAAGAAATTTGTTTATCTCCCTTAAAGAAAAAGAACTATAA
CAGTAAAATACTGGAAATGATCCAAGTGTCTGTCAACAAGGGATGCATAAANNNNNNNNN
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