SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002908_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein R (SelR)
SpeciesVicugna pacos (Alpaca)
Promoter IDSPR00002908
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002843_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00002908_2.0 # Promoter # Selenoprotein R  (SelR) # Alpaca (Vicugna pacos) Full length # Reverse
CTCAACATAGAGTTTGCTCTGGAGTCAGTTTGTCACTTACTCTTGGCAAGAATGATGCAC
ACTTTGTAAGAGACCCTGTGTCCCAGCGTCCAGCCCTCCCGGGGGAGGTGCCTCTTGGAA
GGGCAGCCCAGGGAGGCTCCCCGGGACACTCTGCAGGCTGCTTCCACTTCCGGCAAGTCC
CCGTCAGCCTCCTCCCCAGCCAGCTTCCTGGCCACCCTCCAAAGCCCAGGCACCACATCT
CCACAAGGCCTTCCTGAGCCCCCTCCTCTGGGCTCCCACATCTCGTGGGTCATCTTGAGA
GAGAGAGTTGTCTGCTCCAGAAGCAGGTCTGGGCCTGAGTCTCTCCCTTCCTCAGCTTTG
CTCAGCACAGGACTGGGCATAAAGGACAACCTTGTGCGAGGAGAGGGCAAGAAGCTCCCC
CGAGGCAGGGCATGAGGTGTGAACTCACCCGTGGGAGATTTTGGCCACGTGGATGCTGGG
GATGCTGAACTCTCTGCCTGAGACTTCCGACAGCACCGTAAACCAGTCTCCATCCCTGGA
GAGAGAAAGGCGAGGGGGCCCCTCTCAGAAGGGCCAAAGCCCTGGGAACTGCTCATTCAG
GATTCACAAGGACCCTCAAGGCTGGGTCCTGTGCCCACTTGTCCCATTTGCATTTCCCAG
GTTCCCTTGCACTAGGTGGTCTGGGCACCTCCTGGGCAGTGGATGGCAAAATTCAAGGCT
CCCTTGCAAGGCCTTGCCACTCACTGCTTCTCCCTGCAAGTGTATCAGGTTGCCTAAAAT
CCCACCATTAGGGCCATGTGTGAGCTTGGCACCAAAGGCCATGTTCTTTTCTCCTGGAAG
GGGCCTCCTCCCATTAATGCATCTTCAGGTATCGGAGGAGGGAGCAGAGCACCTCATGGA
GTGCCCTTGGAAGACTTACTCAGAGACGATGGTCAGTGGCTCCCCCAGCCTCAGCGACAG
CTCTGCCTGCTGGCCTACCGGGAAACTGCTCAAGGCCACAGCGGTGGCCTTGCTTCTCTC
TGCACAGAAGGACAGAGATGGTTACCCTCTGGCCAGACGCAAGCTCCAGTGTAGTCTGGG
TTTTTGCCATCAGTCCTCCCACAGGCGCCCTAGGGCATGTCTGCTGGGATTCTGGGATGG
CAACCTGGAATCTGACACTTTTCCACAGGATGCTGCAGAGCCCTGGGGGTGCCCAGACAT
CACTTGGGGTCTCCTCAGGGAAAGGGTTGGTGAGACAAGAAGAGTGGGACTCCTCGCTAC
AATCCCCTTTTACATACAGATCTCCACAGGAGATTTTGATGAAGGAATTCTGTTGTTCAG
CAAACTTAAAACTGCCCACTCTAAGCAGGAATCAGCCCAGATCTCTGAGCTCAACTTCTG
AAAGGCACTGATGAGATGGGTACCAGATGAACCAGCTTCGAGGGCCTGGGAGGGGGGCGT
GGGATCCTCTAGAGTCGACCTGCAGGCATTTTTTCTTCTTATTCTATNNNNNNNNNNNNN
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TGAGCTCCAATGTGTTGGAATTCTCCTGCCAACACAGACATCAGGATATTTGGCTCTGCA
TCCTTCTAGTTCTGCTTCAGTGTGTGGCCATGTCTTTCCTCCTAAAAAGTGCTGTTGGGT
ATAGAATATTCTTGGTTATCTGTGATGGTTAATTTTATGTGTCAACGTGGCTAGCCCACA
GTACCCAGATATCTGGTCAAACACCAGTCTGGATGTTAATGTGATACTATTTTTTAGATG
ATATTAACATTGAAATCAGTAGTCCTTGAATAAGACAGATGACCCTCCGTAAAGTGGGTG
GACCTCATTCAATTAGTTGATACCCTTAAGAGAAAAAGACAGGTCCTTTGAGGAAGAGGG
AATCCCCCTCCAGCCTCAGCTCTGGAATTTCACAGTATTAGCTCTTCTCTGGGTCTCCAG
TCTGCTGGCCTGCCCTGCAGATTTCAGACTTGCCATTGCCCACAATTGCATGGGCCAATT
TCCTATACACGCGCCCACACATACCCTATTGGTTCTGTTTCTCTGGAGAACCCTGACCAA
TACATTAGCAAAACCCCAAATCACAATGTGATTTGAGAAAGGATTTGTGGACTGTTTTGA
CATCAAAATATTAGAATTTGCAGGATATTTTGATTGCCTAAATGTCCTTAAAAACTGGCA
TTTTTAGTCAGGACTACCTTAGAAAGTTTCCAGTTATAGATTTAGCCTGTGCATTGTATG
AACTCAGTTTTTCCAACCACCATAGCTCTAACTTTGCTTCAAGTATTTCACAGCACCTCT
CAGGATAAGAGGAGACTTCAGAGCATCACTGTCCAACAGAACTTTCTGTGATGATGGTAA
TGTTCTTTAATTGTGCTGTCCAAGAAGGTAGCCACTAGCTGCACATGGCTACTGAGCACT
TAAAATACAGCTGGAGTGACTGAGGAACTGAACATTTATTTAACTTTAATACATTTTAAT
TAATCTTGGTTTAAATTAAAATAGCTGCTTATGGCTTGTGGCTGTCACGACAGACAGTGC
AGCTTTGGAGAGCTACGGAAGTAGGTTGGTCTTACAACTGCAGCTCAGTCTCCAAATAAA
CTGGTTGAAGAGGGAAGCCGGGGTAGATGCCAGGGGGACCATCACACCCCACTGGTTAGC
TCCTGTCAGTCTCTCACATTTTCTAGTTTTATCTGGTTCAGTGNNNNNNNNNNNNNNNNN
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