SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002911_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein U2 (SelU2)
SpeciesVicugna pacos (Alpaca)
Promoter IDSPR00002911
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002846_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00002911_2.0 # Promoter # Selenoprotein U2 (SelU2) # Alpaca (Vicugna pacos) Full length # Forward
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NNNNNNNNNNNNNNNNCCAATGTGGTGGAATTCAAGACAAATACCATAGATAGAGGATTG
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AAATTCCTAAATTCCCCTATGCCTGCAACCTGCCCCAAGAGAAACCAAGGTAGAACAAGA
AACATGCGTCAAAGACGACCTGGCATGCATCTACCATAGGACTTCTACAAAGCTGATGCC
AAACCATGTAATTCCATTTTCCTCATCCTTCACAATTCACCCTTTACACTTACACACACA
CACACACACACACACACACACACACAAACACACAGAGTCATCTCACTTGAGAGGCCTACT
AAACAGCTTTAGCAAGAAAAAAAAAAAGTTTGAAAAAAGGATGTGGACTCTTGAAACACC
CTAGTACACTTATAACTAGGTTTACTATACCAGCTCTTGAAAAAACAGAACTGAGGGACT
CTTCTCCAGTGTTAAGAATGCTCCATTTTTTAATAGGATTGTGGATAATGGGGGGAGGAT
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TAGAATCTAGCTAGTGGATATGAGTGTTCACTGTAAAAATCTTTCAACTTTTTGGGCACG
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TTTTCTTCCTTTTATTTTTCTTATAAAAACACTCCAAATAGTTGTTCGTTATAGGGAAAT
ACTTGAAATGTCTTAAAGATGAAAATTTGTATTGTTAACGGAATGCATGTTCCACATTCC
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TTTTAAAAAATTATTTAATTTTCAAAAACACCTTTATCGTGGTGTGGTTCCTGTACATAT
TTCAGATGTACAATTTGATGAATTTTGATTGGGTAGTTTTTGTAAAACTAAGGTCTCTTT
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TATAGGTGGCATTAGAATGGAACAAAAAAGTTGGATAGGGGAAGTTGAATGAAATGTAAT
TTCTAATGATATGTACACGT
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