SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002917_2.0
Identity
PromotertRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesVicugna pacos (Alpaca)
Promoter IDSPR00002917
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002852_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00002917_2.0 # Promoter # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Alpaca (Vicugna pacos) Full length # Forward
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCT
CATGAGTGCCCTTAAGGCTATGGGGATTGGACTATGTGCCACTGTTTTACATCTCCGAGG
TACATGACTGAAACAAGCCAGTCTGTCCCCTCGTGGAATTTACTACAGTCTAATGGAATG
AGACAATAAATATGTAAACAGCAAAATGCAGAGTGTATTTTCAGCTAGTGGTGCTCTGTT
GCCTCCAGTTTCTTATTTCTCTTTTTTAAGGTCTTAGGTTTCCTAGTTAGAAATAATAGG
ATTCCTTTATCAATTTGACAGTGTTTGCGAAGCATCTACTCTGTGCCAAGTACTAAAGCA
GCTTGCTACAATGTCAAATAGTTGAAAAATAGAGATGAGAGATACAATATATGGCCAACT
CTGGCCCTGTGGTGAACAGGTACTTTGTATATTCAGAACCCCTGTACCCAGGGACAGATT
TTCTGACTAGTAGATCATGCTGGCCTAAATATTTTTCCTCTTGTTCTTGTAGATGGAAAA
CCCTACTGGTTTCACATCAGCTACTGGTGTGAAAAGACTTTCTGTAATATGTTCTACTTT
TTAAAACACTGACATAGGTTCTCACATTTTCATCTTAATTGAAATAAGAATTGGAATTAT
TGTTTCCTGCACTTGATTACTAAACTCTAGCTGTGTCTTAATGATGGCAGTTACAGACAT
ATTACATTTACTTATTCTGCCTCATGTGACAAAGACTTTGAAGTGGGTTATAAGAATACT
GTAAAATAAATAAATGTAAATTAAAAACCAAGAACAGAGAAGATAGGGGAATAAGAAAAG
ACACAAAGGAAAAATAATATGCAATAGAGCAGTGTTTAAGAATGCAGTCATTGGTTGCAC
AACAGTGTGAATGTACTTAATAGAACTGTACACTTAAAATGGTTAAAATGACNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGCTCCAATGTGGTGGAATTCATCTCTTAAGTA
GGAAAGGATGTCAGGGTTTAGCCACTTCCTCCTACTCATGTTTCTTAGTGATGCTTTAAA
AAACAGAACACCAGGAATCGCACAGACATCCCCCAGTTAGGTAAGGCCTATGGATTTACT
TTGTCCAACTAGATTGTAAGTTTCTTAAGCATAGGAACCACATTCTTTAACTCTGTATCA
GCCTGGCCTGTGAAATGTGATCAAAAAACCTTTCTAATTATGAAAAATTTAAAACAAATC
TTCAAAGAATAGCATAATGAACTCTCATAGAGCTACCACCTAATTTCAAAAATTGGTAAC
ATATTGCCATATTTTCCTTACCTATCTGTCAATAAGGATAGATTTAGGTAGGTAGACACT
TTCTCTTTCCTGAACCATGAAAGTAAATTACAGGCATTGAGACATTTCACCGCTAAATAT
TTGAGTGTACATTGCCAATCCCTGGGCATTCTGTTACATAACCACAATGCTCATATCACA
CTAACAGAATTAACAATGATTCCCTAATATCACACAATGGCCAGTCTACATTTAAATTTT
TATAATTCTGCCCAGAATATTTTTATAGCTTTTATTTGTTTTTTAATGAATTAGGATCCA
GAGATCAGATTCTCCATTGCATTTAGTTTTTTTGTCCTTTTTTTAATGTAGAAAAGCCCA
CTTCTTTCTTTTCTCTTAACACTGACTTTTTTTAAAATTTGTTTTTCTTTACATTTTCTT
GATGACTTTATTTATTTATTTAGCTTTTTTTGGCAGAGGGCAGATAATTAGGGTATGTAT
GTATGTATGTATTTATTTATTTATTTTTGGAGGAGGTACTGGGGATTGAACCCAGAACCC
TGTGCATGCCAAACACACACTCTACCACTTGAGCTATACACTCCCCCCCAACACTGACTT
TTTAAAGAGGTCAGATTAATTGTTTCATACAAGGTTCTACATTCTGGATTCTGGTCCTGC
TTTCTGGATTTATTTGTTTCCTTGTGGTGGTGGTTTACTTATTTTGTTCCTAATATTTCC
TGAAAACTGGACATTAGATCTAAAGGTTTCATTGGATTGCATTAAACATTTTTGGCAAAA
GTACTTCTTAGGTGATACAATACATAAATAAATGAGTCTGGGACTGGCCTAAATTGGCAG
TCCTTATACTCAGGTTTGTAAATTCTGAACTGGATTATGGCAGGGAGCAAAAACAGTATA
GGGTATGATTAGGAAAACATTTTTCCTTCCCTTCAGGCCCAGACTCAGTCTCCCATCTGG
ATAGCACATCTTTTTTTTTTTTAACTGAAGTACAGTCAGTAATTTCCAGAATATATAAAC
AGCTCGTACAACTTAATAAAAAAACAAACAACTCAATCTAAAAATGGGCAGAAGACCTAA
ACAAGTATTTCTCCAATGAAGACATAGGAATGGCCAATAGACATGAAAAAATATTCAGTA
TCACTAATTATCAGAGTAATGCAAATCAAAACTACAGTGAGGTATCACCTTATACCAGTC
AGAATGGCCATCATTCAAAATTCCATGAACAATAAATGCTGGAGAGGATGTAGAGAAAAG
GAAACTCCCCTACACTGCTGGTGGAAATGTAGTGCAGCCATTATGGAAAACAGTATGGAG
ATTCCTCAAAGAACTAAACATAAACTTACCATATGATCCAGCAATCCCATTTCTGGTTAT
ATATCTGGAGGGAACTCTAATGCGAAAAGACATAGATATCACATCTTTTAACAGTTTACT
CTTTCTGTTTTCTTTCCAGG
Chart Advanced