SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002918_2.0
Identity
PromotertRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesVicugna pacos (Alpaca)
Promoter IDSPR00002918
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002853_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00002918_2.0 # Promoter # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Alpaca (Vicugna pacos) Full length # Reverse
CTTACAGGCCAGCCTCCATGGAATTGCGGTAAGTTTTGCAATCAGGAAATGTGATTCTTC
CTACTTTCTTCTTCTTTTTTTACTTTCTTCTTATTTTTTGACATTGTTTTGGCTATTAAG
GGTCCCAAGCAATTCCACATGAAATTTAGAATCACCCTGTCAGTTTCTACAATGATGTCA
GCTGGGTTTCTGTTGAGTATTGTATTGATTCTGTAGATCAGTTCAGGGACTGTTGCCATC
TTAACAATGTTAAATTTTCTGATTCACGAACATGGGATGTTTTTCCATTAATTTAGATCC
TCTTTAATTGCTTGAACAATGTTTTATAGTTTTCAGAGAATAAATTTTACACTTCCTTTA
AGTTGATTCCTATGTATTTTATTCTTTTTGATGTTACTATAAATTGAAATCACTTTCTCA
TAATTTTATTTTTGGATTGTTCATTGCAAGTGTATGGAAATACAAAATTTTTTGGTATAT
TGATCTTGCATCTTGCAATCTTTTTGAAATTGTTTATTCTAATAGTTTTTGAGTAGCTTT
CTTAATGCAAGATTATTTCACCTCCAAATAGAGATAGTTTTCCTTCTTTCTTTCCAATCT
GGATAGCTTTTGTTTCTTTTTCTTGCCTGATTGACTGATTGCTTTTGCTAGAAACTCCAG
CACTTCTAATTCTAATGTTGAATAGAAGTGGTGAGAGTAGATGTGCTTGTCTTGTTCCTG
GATGAAAAAGCATTTACTCTTTCATTATTAATTATGAAGTTATTCGTGGGTTTTTGTGGA
TGCTCTTTATCAGTTTGTAGAAGCTCCATTCTAGTTTGTTGAGCATTTTTATCATGAAAA
GGTATTGGATTTTGTCAGATGCTTTTCATTTGTTTATTGAGATAATCACTTGGCTTTCTT
TGTTTTTAAAGATGTAATGACATATAAATACACATGAAAAAATGCTATGTGTTAGTCAGT
TGATGAAAATGTTGCGACTAGAGGCCCCAGTAACCTAACTCTATTCCTCTAGGAACAAAG
GTTCAGTATTTGCTAATTTAGTGTTTGCAGTGACTTTATAGAACCTAACTATCAAGAAAA
AGAACTGATTACATATAAAATAAAATTTTATCTACATTATAAAAAATATACAGATGAAAC
AGAACAATCATACATAACATTAACAAAAGAAGTAACAGCTGACATTTACTGAACAGTTCA
GATAGCAAGAAGCTCTAAGTTCTTTATCTATTATCTTATTTTGTTACTCCTTGAATTCCN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAAGTGGTAAGTGAATGTA
TATTTACTTATTTTAAGATAAAAATAAGCAGTTTAAAATATAATGATTTTTTTTTGTCTC
TTGATTCACCAACTACCAGCCCTGATTGCATCAAATAATACGGCTTTTTGTATATTGTGC
AGAAATTTAAGCATAAGCTATATGAATAATGAAGCATTTAAAAAACCATCTTGATCGACA
AAGCTTATTTCTTTAAATGGTCTTAGTATTGAAAGACTTGACGTCCACACTCTACTGGGG
GCTGTGAAATCATCAGTGGCTTTGCCTCTGGAAGGTCAGCTTCTTAATTTATTAAAGATG
ACGTGGCCACCATAAGGCAGGATGACAGAAATCCTGGCAGCACTCCTTTCCTTCTGATCT
GCCAGTCATATTTTTGGAGCCATTTCCATTTTCTCCTTTCTTCTCTCCAGGAGCAGAGGT
AAATTGGAAGAAAATGTAATGAAAACAGCTTGATGAAGCTAATGAAGACCCTCCACATTC
AGCCTCTCCCCAACTGCTCCTGCTCACCCAGATGAGGCAAAGCCATGATGGAACATAGTT
TATTTTTGTTTAAAAATCACTAAACAAGGAATACAAGCTCATGGTAAAAGTTTCACACAA
TGCAGAAAGGTAAATTCACTTATTAGTGTAGCCTTGGGCAAGACAGGTGCCTCTCTGATC
CTCAGTGTTTCCATTTGCTAAACAGGATGAGAGCTAATTTGGAGGACTGCTCTGAGGATA
TGAGATAATGTATGTAAAACACCCATTATTATTATTATCATCATTTTACTTCATGGTTAT
ATAGGTACTAGTTTCATATCCTTGACCAAAGAATGATTTTCCACTAATGAGAAATTGGTT
CTTTTCCAGCAAGTTGGAAATATTGGGAGGAACCCTCAAAAGAGCAGTGATTATAGAAAG
GGACTGTCCAATCAGCCAAAGCAGCTGCATCAACTGTGATGGTAAATGATGTGATGTCAC
GAATTCCACCACATTGGAGCTTCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Chart Advanced