SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00003152_2.0
Identity
PromoterMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Promoter IDSPR00003152
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00003087_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00003152_2.0 # Promoter # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) Full length # Forward
GGGGGCTCTCTCCATGGCAACCGGAAAGGGTTGCCTGGATACGGGTGTGAACAGAACATG
TGGTGTGTGGACTGAGAAGGCTTGCTTCATGGTGAAGTAGATGTGAGTAACTGCAGCGTC
CTGGGCTGCTGTATGTGAGCATGTAGATCACTGCTTGTCCGTCTTGTGTGGGGGCACAAA
ATTTAGGAAAAATGGCATCAGTTAATCAGAAGAAAATTAGTTCAGGCTTACAGAAGTGTC
TTGTGGTAGTGGCAGGCTGGCTGCTGTTTGTTCCTTGTTTTCATCATAACACTCGATGGT
GGACTAAAAAAAATTAAAGCCAATCATCATAGATGTGTCGAGAGCCCACGTTTTATAAGC
CTATCAAATCCTGGTGGATAAAATCAAGTGTTTGAATTTGCATTTGAGCCAACATTTAGC
ATGTGATGGTATGATGAATCTCAGGAAGCTCAGGGCTGACGTAGCCATATAGACACATTC
TGTAATTATCTAGACCAGCACTTGAATGAAGGTGGCTAGTTTTGCACAGTACATCATTTT
ATCAAGTGCATTACGTAGACATGCAAATTATTTAGACCAAACCTGTGGTGCAAATCTTGG
GAAGAAGATTTTCACTTAATGAAAGTTATTGGAAACAGTTATATGTGCTATTTCTGTAAT
GAATGCTGAATCTGTAACGTTGGTGAATTTAATTGGGATTGGCTTGTGTGTGTTGTTGGC
TGTTGGTTGCAGATTTTAAGGATGCCAACCAATCAGAGCGCTGCCATATGCTCAGCTTAT
AGTTGTAGTCAGCAGTGTGTTATGTACATTGACAATATAACATTGAAGCGGTTAAAAGCG
GTGGGCGAGAGGCAAAAAAGCAGTCCAAGTATATGTGGACTCGCTAGTTGTTGGTTGAGC
CTGGTTAATATTCCGAGTGAAGATTGAGGGGTTTGTTGTACTTTTCTCCTACCCCATGAT
TGCTACAGTTTCTCTTTTGAGATTTGGTGGTTGTGTTTACCCAAATTCACAAGTTCCTCA
CCAATATCACTATCCTCAGCTATTTTAATCCATCTCTTCCCAAAACCCAGCAGTGCCAGA
ATGTTCCGGAAGATTCCAACGGACACACGGCGCTGTGCAGGATCTGGACAATGTGAACGT
AGCCAAATTTCCACCTGCGGTAGCAACCTAGCCAATCAGAGCGCAGCCATATGCCCACCT
TATAGTGCTGTTAGTCCGCAGTTTGTTGGCATTTCTCACTGACTGTAGATTGACAGCATG
GCACGTGTTCAACGCCAACGTGGTGGACGCCAGGCGAAAAGATAGCCATGCGTAATGGTA
GTCCAACAGAATGTATTGTCCTCTGTATTTTAATGACCATTCTGTCTTCGTAAGTCCTTG
GTAGGTGGTTAAAAAAAAAAAGGTGGAGTCCTTTTTGAGTCCCTAAAATTAGTACATATT
GTCTGAGGAAAATTACTCCAATCCCGATTTGTTCCAGCGTAGTTTCCTCTCCGAAATAAA
AAAAAATAAAATAACGTGGGTCGATTTCATCTGTTGTTTTCTGAAGTTTGTCCGGAAAAA
AGAGAACTCCCATTTTCAAATTGCGCCGTCCCCTCTTGCAGTATTCTTTTGTCAGGCTCT
CCCACCCTGTCCCTGTTTTCTTTCTCTCTTTCTCTCTGGGCATTGGCAGTGTTTGGTGGG
GAGGTGTTGTGGTCTGGGTAAAGGCGTTGGCACCGACTCTAAGCTCATGGTGAAAGGAGA
CCGAATGGCTTCGCCTGGACTGCCGCCAAAACTCCATGAGAGGAAAACAAAACCCAGTAT
GGAAGACAACGTGTGTGTAGAGAGAGAGAGCGCACGCGAGAGAGAAGGAGAGGGGCATTA
TGGGAATGTGAAGGGAGGAGGAGGTTTAGTGAGAAATGTTTGTATGAGAGCGAGCGAGAA
TGCTTGCGAGATAAATAAAGCGTAAGACAAAAGGCATTATGGGAAAGCAAAGGAATTGTA
ACAAGGTTCAATCTGCTGAAATTCAAATTCTGGTATTAGATGCTCTTTTTATTTATTTAC
ATGAATTTAAACGGGATGCATAAACATTTTGAGGACGAGATTTAGATTACTGGTTGTCGG
TATGTCAGTAATAAAATAGGAGTTGCCTTAAAAAACCATGTCTGTCCTTGATAAATTAAA
AGTATTAAATATTTTATTTTCGGCTTTTATTTTGAATAGAGTGGAAGTATGAAATAGCGT
TACTGGTACCACCAAAAAGAAATTTATTATTATTTTCCAATTACAACAAGTCCCGAAGTG
TTTTGTTCCTCTTATACCACTGCAATCTGGCAATTTGCAATTACAGTTTTTGTATTTGTG
AATGACGCATCATATATTTGAACCATTTACAGTTAGATTTTATGTTGTGGGACATCTGCG
AAACAAGTTCCTGTCTTCAGTCATTGCGTTTACATGGAAAACTATAATCCGATATTAACT
CTGATTAAGAAACTAGCATGTAATCAGCGATTATTGATGACCTTAATCCGACTAAAGTCA
TACTCGAAGTAAACGCAAATGGAATTAAGACGTGTTGAGTATTCCTGTTTTAGTCGCATT
ATTGAAGTATATTACAGACATGTACACACCTTAATCACACTATTAACGTCGTGTGGGAGT
TTTCACCACATTTTGCGACAGGACACGTACACACACGGCAGCGCTCACCCGTTTTACTGC
AAACAAGAGAGCACGGCTGCGTCCCAAACCGTGTACTTACCTGCTACAGTATATAGTAGG
TGAAATACATGTATCTCGGCTACTATTTAGACGGTAAGTACGCGGTTTGTGACGCAGCCC
ACAGCTTCAAGCAGTCGTCTATTTGCACGTACAGCACGACAAATAATTAACCGCACTTGA
AGCGTTCGTAAAATTAAAAATGAAACACCCAAAACTGTATACGGTTGCATAACGAAGACC
AACTGTACATCGATACGTGAAATTCTGGAGGGACGTCGGACGGCGTGGCGTGGGGACGTA
ATGACGTGTGCCGTTAATCGCTCTATGTTCTATAACACGTAAAACAGGAACATGAAAGGA
ATATTCTAAAAGCGACTTGTGTAAGCACCTTAATCATAATATTGTCTTATTCAGAATAAG
GTCAATAATTATATTACTGCTGTCCATGTAAACGTAGTCAGTGTTATCACCATAAACAGC
CGTTCCCTCACCAGCCTCTCTTTCTTACTCTATCTCTTTAAATTACTAAGACAAAAACAG
CTTGTCGTGTAACAGAGAAACTAAAATATTTTGACAATTTTGCCAATTAGGTAACATACG
ATAAGATAAAAACTTTATTTATTCCATACTGGCAAAATCCCCTTGTTACAGCAGCTCAAT
TACACACAACAGATAAGAAAATACACATTCAATAGGAATAGAATAGCAAAATGTCTTCAA
AAATATAAGGCGTGTTGATAAATCATGGCAAGTGGCATGTTTTAAAGAAATGTTCATTAA
TATTGGGCAAATAAATCCAGACAGACTTGTAACTGTAATTTATCACAGATTCATCAGTTT
GTTTTCAATTATTATAGTTACTGACGACATGATAGCAGTGATATTGTCCATGTCATGCAG
CTCTAGTGTGTGATATAGTCTGATGTTGAATGTGTGTGTATTCCGCTTGCGAATAAAGAT
ATGCTCCGTTTCGATCCGTATTGCTTGAGAAAGGGCTTTTTGGACACTAGGGAGTGGACA
CTTGTGTGTGGGGGGGTGGGGGGTGGGGGGTGGGGGGGCTGAAGGGGGGGGTTTATCCAT
GTGTTCATAGTATTGTGGAATGTGTAAGCCAGTAAGCAGACTGTAGCTTTAGGCTGCAAA
TCACTTCAGTCTCCTTTGCCTTAATCCGTGCCACATCTGTGCCATTTTTATTGTAGTTCC
AGCATGGCACAGTTGGCAAAGACAACCCAACTACCCTGTAAATATTTTGTTTAAACCTCC
GAATTTCTAAGTGCACTTATGTTCACTCTGTAGGGAAGTCAGGTTCTGGCTTTCATAGTT
GGATGCCTCTTTGGGGGGTGGGGGGCGGTGTTGTTGCAGTGAATGTAATGAATGAAGTTA
CTCTAAAATTGGAACTGTAGCCTGTGTGTGTATTTTTTATTGTAATCTGTTAAGTGTCTC
TCAGTGTGGAGGCCCAAGCTTTGATCCTGCTTAGCTTGACCAGACTGAGCAAATCTGCAC
TAATCCTCCCAGTGCTATCCCTTACACACACACACACACACACACACACAAAAAAAAAAA
AGCAAAAAAACGGGTTGACCCAACTTCCTCTGTCGATACTTGTTCAGGGAACCTACAGAC
CTTCTTATGACCCGGCCCACATTTGTACTGCTTAAAGAGCCGAGCTGTTACACAGTCAGA
CAAGTGACTTTGGTAATCAGTTGTGTAAATATAATAACCACTTGTGGTGCAGCAGGTAGC
TACAGGGTCACTGATTCGATCCTGATTTCGGGTTAATGTCTATGTGGAATTGTCCACGTT
CTCTCTGTATCCATGGAGTCTCCTCCAGTTTCTCTGGTTTCCTCTCACCTCCCAAACAAC
ATGCCAGTCAAGTGGATGAGTGTGTGAATGGGTTTATATGTGATGCCCTGCAACAGACTG
GCGTCTCATGCAGGATGTATTCCCGTCTCGTGCTCGGTATTCCCGAGGTTAGGCTCCAAA
TCCACTGCAACCTGCACCAGGATGAAGTGCTTGCTGGAGATGGAAAAGTCTCGTTTTTGT
TTGCGCTTAAGTTCAATACTGTAATTGTTAAACAATGAACTTTGATGATCTTAGAATTCC
TTATACTGTCAAAGTCTAAACCGAATTTCTCCAGTGTTGTCATGGTAACGAAATGACACC
ATGCACAAGCTCCTGAGGTCGCTGGTTATTGGTTTCAGATCAGCAGTATTTTGGGGTGTT
GGAACCAAACCGAACTCGATGCTCCTTAACATCTCTCTATCTGTATCTCTCTAGCGAAGC
ATGCAGTCACAGGGAAGCCC
Chart Advanced