SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00003187_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein M (SelM)
SpeciesNeotoma lepida (Desert woodrat)
Promoter IDSPR00003187
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00003120_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00003187_2.0 # Promoter # Selenoprotein M (SelM) # Desert woodrat (Neotoma lepida) Full length # Reverse
CGGTGTTCATTTGGATGACTTTTTGTTGGTTTCTTGCTTTCTGCCTTTTCCTCAGTAGTG
TTTTACAGCAAAAGAAATACGACTAAGACTCATCACCGGCTGAACTCTGGAAGCAGAGAG
ATAAAAAGACACAAAGGGTTTTGATACCCTACTAAAGTCAGAGGTCCGTGGTCACACTTC
TGTGTCATCCCCTCCAAGTCTCAGGCACTAATGTGGAAGAGTGGGTGGAAAGACTGTAGG
CCAGAGGAAGTGGGAGAGTGCTGTGCTGCAGTTCCCATCTGTGGGTGAGGTTCACTAAGA
CACTGGNTGTTTATGATGTTTACAGAGAGATGGAACAATGGATGCTCTGAATGTTTATGA
AGTTTATGGAGAGATGGAATGTGGGGTCCTGCCCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAAGATGTCTCCATAAAATCAGGCTATATGCAAGCCT
GTAGGGCATTTTCTTAGTGATTGATGGGGGAAGGCCCAGCCCATTGTGGGTGGTGCCAAC
CCTGGGTTGGTGGTCCTGTAAGAAAGCAAGCCATGAAGAACAAGTTAGTAAGCAGCACCC
CTCCATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCCTCCAGGTTCCTGTTCTGCTTGAGTTCCTGTGC
CCACATTCATTGATGTGATCAACTGTGATGTAGAATCATAAGCCAAATAAACCCTCTCCT
CCCCAACATGCTTTTGATCATGGTATTTCATCACTGCAATAGTAACCCTGACTGTGGCAA
GTAGGTACCAGGAGTGGGGTGTTGCTGTGAGATGCCTGACCCTGTGTTTTGGGAAGGATT
GTAGAAGGACTTTGGAACTCTAACCTAGAAAATCCATTGAATGTTGNGAGCTCAGTGAAC
TGTTCTGTGGGAGCTTGGAAAATAAGAATGCTGAGGGCANTNCAGANGATGGAGGTCTGG
CTTGTGAAGTTTCAGGGGGAAGTTTAAAGACTCTATCTGGACCATTTGTTACTTCGAACT
AAGATTCTGTGGTTCTGGTTAGCTGGGGCTGAAGAATCNGCTGTGATTAGCAAGCTACAA
GAACTGCTGAAGTGAAGCCTTTGCTTTGCTGGAACAATTGATGGTGGTCAGCAGGGGCTG
AGAAATTAGTGGTGATTGAGAAGAGACCAGCACAATTGAGGTGAAGTCTTCTGGAAAGGG
TTTCCTCGGGATCAGCACAAAGAAGCTGTGTTCTTGAAATGGCCNAGGNTGTATCTCATG
CTGGCAGTTTAAAGTTGGGAGTATAAGAGAAACCCAGGTGGTACTGGTTTTGAAGGCATG
AAGAGGTCATGGGAAGCAGCTGAGGTTTAGCACTGTGTGGCAGGGCTGGAGGCNCTGAAG
AGAGAGCCCAGGAGAGGCTATTGGTGAAAGTGTAGTACAGTTGCAACAAGGGACCCCAAC
TATTTTGGAGATGCCAGTACCATGGGATGNCCACCAAAACAGCAGCAGCTGTGAANTGGA
GCCAGCCAAAGGCTAGAANACAAGCTGTGTGCTGCAGAGAGTGGGTGACCCAAGCCCTTT
GCAGGAGTCCAGAAGATGGTGAGTGGATCCCAGANATTGGACACTGTGTTATTTACACTG
TTGGGAATTTGGTTTTGCTTTGATCTGATTGTAACTGTGTCCTGGTTCTTCCCTCTTCAA
GTAAGAAAACATTTCAATTAATTTTGACTTCTACAGGAGCCCACAGTTGAGAGATTTCAA
ACCTTTAAAAGAGATTTGGGATTCATAAAGAGACTGTATATTTTAAAAGGACTAAACTTT
TAAAGTGTTTGAATTTGTAAAGATTGTGGGACTCTTAAAGTTATTTATGTTTTTATGTGA
GATGTTGGGGATGAATGAATGAAAAAGGAAAGGTTGTAACTTAATGGTGATGTATTTGTG
TGTTAAGTTGACAAAGGGTCAATTGTGCTGGATAGTTTATGTCAACTTGANACAAGCTAA
AGTCATCTGAGAAAATGCCTCCATAAGGCTGAGCTGTAGGGAAGCCTGTTTTCTTAATCA
GTGATCAATGTGGGAGAGCTCAGCCCATTGTGGGTGGTGCCATCCCTGGGCTGCTGGTCC
CGGGTTCTATTAAAAAACAGATTGAGCAAGCCATGGGAAACAAGCCAGTAAGCAGCACTC
CTCCATGGCCTCGGTAGCTCCTGCCTGCAGGTTCCTGCCCTGCTTGAGCTCCTGTTCTGG
CTTCCTTTGATTATGAACAGTGATGTAGAAGAAGAGTAAGCCAAACAAACCTTCTCTTCC
CTAACTTGCTTTTGGTCATGGTGTTTCATCACTGTAAGACGGATTTTCTAAATAGTCTTG
TTAAATAAAACACAGAGACAGAGATGGGGTGAAAGTCTGGCAGAGATCAGAGGAATTAGG
AACAGCTACCAGACTCACCTTAGACTGCTGCCGCTGCTTCCAACATGGAGAGAGACTTCC
ACANTTTATACATCCACTTTTATATCCCTTCTGTTCTGTTCTCCCATTGGCTCTTTCAGC
CTAGCTACATCACTTCCTCCTATGGCCCACTTCTGTCACTTCCTGCCTGTCTGTATAGAC
CTCCAGAATTCTATGGTTGATGCTGGGATTAAAGGCGTGTGTCTCCACGCTTGACTGTTC
CTAGTGTGACCTAGAACTCACAGGGATCCAGACAGACCCCTGCTTGCTAAGTGATAGGAT
TAAGGGCGTGTGCTAATTTTGAAAGGCTAGCTGCTGACCTTGTTCCTCTGATCTTCAGAT
AAATTTTATTGGGGGACATAGATAAAATACCACCACACATCACAGTAATAGAAACCCTAA
TAAAGACAGCCCCTCCACCCCCCACGTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
CCTCTCTCCCTCCCTCCCTCCCTATCTCCCCAAGTCGATATAAGCAATGAGGACTGCTAA
GAATCAGTCTTAGACAGCCTGATCTGCCTGGAAAAAGTAGAGGCTAGCCAAAGAGCTTCT
CTCAAGAAGCAGAGACCAGCTGAATGGCATAGAAGAAATAGGCCAGTGGAGCTGCCTGAA
GGAGACTCAAACCAGCTGGGCCACTAGCAAAAGACACTCTCCAACCTGTGGAGCTGCCTG
CAGGCCTCAGAGTGTGCTCCTGTTAGGGACCTGGAGAAGTCCCAAAAAAAGACCATCATA
CATGTATGCAATCAGCAAGAGGGTTTATTATCCTAGCCTGCTGGGGCCTGCCATCCCACA
CAAAGGCAAGATGGCAAAGACCCTGAGAGGAAAGTGAGGGCTCCTTTTAAACCTAATCAA
GGGGAGTGTCCAAGGAAGTTAGCTCATCTTAGATATGATTGGCTTATGTGAGTGGCATCC
ATGTTAGTAACTTCTAATTGGCTAGGGTTAGTTGGGGTTCAGTCAGGGCTACAGTTTCCA
TATTTGGGCAGGCCTGGACAAGTCCCAGGCTTTATCCTTGAGCTGCAGTGGAGGCTGGCT
GGCCTAGCATGTACTGACTGTGGGTGCTGGCTCAGTGGCCCAGGCTTGGTGCGTCCTATC
TCCCTTGTCTCTGTTGACAGGGGTGTTGGAGATTGATTTCCTTTGTTTGTGGNTCTTTTA
GAAACTGCTTATTCAGTCTCAGGANACTGAAANTGAGGCCTCATCTTTGAGAGAAGACTG
AGCAGCCTCTCACTCTAGGCTTCTAACTTTTATGAACTGCCACCTGTCTGGGGGTGAGCT
TTGGTGATGCAGCTGTCTTTGTGTTATTTTTGCTCTTGTAAGTAACCCCTCACCCATATT
CCTGTCATGTTACCTAAGACTCATGGGTTCACTAAGTTGGACTTTGGTAGAACCCATGCT
TGAGTCTGTCATCAGTTCTCTCTCTGGGATGAATAGATGTTTGTTTATGGTTCCCCAGGA
ACAGTGTCACACACATCCCCAGTTTGGGTTTGAGGATGTATAATTGTTTTGTTTTTTTGT
TTTGTTTTGCTTTGTTTTGGTTCTTTAAGACAAGGTCTTACTATGTAGCACCTGCTTTTG
CTTCTGGAGTGCTGAGATTAAAGGCATGCAACACCATACCTGGTTGTGTTTTGTTTTTAA
TGACATCCCCACTCTCTCCCTGTCCCCCCTGTCCCATGCTGACAACTACTAGCTGCAATT
GTGGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAGCTCTGTGTTTAAATGGCATGTTGTGG
AAATGACCCTCCCTGTGCCATCCCTCACTTTCCCCTGGGTATTGGCCACTCATGGAAACA
AGACCAATAAAGGACTTTAATTTNAAAAAAAAATTAAAAAGGATAATTACCAATAAAAAA
GTAATTTTGACAAAAAAATA
Chart Advanced