SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00003188_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein O (SelO)
SpeciesNeotoma lepida (Desert woodrat)
Promoter IDSPR00003188
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00003121_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00003188_2.0 # Promoter # Selenoprotein O (SelO) # Desert woodrat (Neotoma lepida) Full length # Forward
AATAAAGGAAAGTCTGCAGATCCAGATAAATTGAGACTGAATGTCTCCAGTGACACTGTC
TTCTGAGGGTGTGCATGGTCTTATGTCCAGCAGATTCTTCTCCTTTTCCGAGATATAATG
GACATTTTAAATATTTGCCAAACAGACCACGTACACCATAAAGATATCTCTGCACATCCA
GGAGTAAAATTATTCTAAGTGTCATTTTATCTACAGCAGACTTAACCTAGAAGTCAGTAA
GTTAAAGATACAGAGAACATGTGTAACTTGGAAATTAAATAAAACACTACCGAACAGCCC
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GGTTTAATTCCAGCAATGCAAGGGTAATTTAACTTTAAAAGAATTAATTAACGCACTCTG
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TGTAAAGGCAGGACAAAAACTGTGGAGAAAAATATGGCAGAATATTCTGCAAGATTTTTA
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GACATTACCTTCCACCAGGAGCCAGCAAGGGCCAGGCAGCAGCTCCCACATCCCCAAGCT
GGGTTGGGTAGAGGAACAGCTGTGCTGTTCCAATGAGGACAGGGGACCCCTGTGCACTTG
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AGCTGCAAGGGGGCTTTCAGAGACCCCAGCTGCATCATGACGCACACATGGGGAAACGCT
GTGGCCTGAGTCATCCTGCTTCTGCGGCTCTGCTCAGGTGAAATGGTCTCCTCATTTTTA
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CTCCCCCATAGACAAGGCAGTGGTCTTGAATGAGAGTGGAAATGGGAGAATCTGTGAAGA
GCCCTAGCCTGAACAAGTGTGAACAGAATGGAGCGCCCCCTTCTGGGAAGCCCTATCCTT
ACCTCCCTAGTGGCCTTTGT
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