SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00003202_2.0
Identity
PromotertRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesManis javanica (Pangolin)
Promoter IDSPR00003202
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00003135_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00003202_2.0 # Promoter # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Pangolin (Manis javanica) Full length # Forward
ATCTATTGTATGGTAATAGATGTTTTAACTAGACTTTTTTGTGGTGATCATTTTGCAATA
TATACAAATATAGAATTATTATGTTTTACACATGAAACTAACATAATGTTAAATGTCAAC
TACATCACAATTTTAAAAAGGGAAAGATGGCCATAGTCCATGAATTGATCTACAGTATCA
AGGCAATCTTTATCAGAATCCCATCTGACTTCTTTATAGAAATTGATAGGCTAATTCGAA
AATTCACATGAAATTACATGGGACCCCAAATAGCCAAAACAATCTTGAAAAAATGAGAAG
TAGAAAGACTCACATTTTTAAAAAAATTAAGGCATCATTGAAATACCCTCTTATGAAGGT
TTCACAAAAAAAAAAACAATGTGGTTATTCATTCACCCTTACTATCGAGTCCCCCCCACC
ATATCTCACTGCAGTCACTGTCCGTCACTGTAGTAAGATGCCACAGTCCCCATTTGTCCT
CTCTGAACTACACTATCTTCCCTGTGACCCCACACATACCATGTGTACCAATCATGATAC
CCCACAATCCCCTTCTCCCTCCCTCCCCATTGGCCCTCCCACACCTCCCCTTTCATAACC
ACTAGACCCTTCTTGGAGTTTGTGAGTCTGATGCTTTTTTGTTCCTTCAGTTTTNGACCC
TTCTTGGAGTTTGTGAGTCTGATGCTTTTTTGTTCCTTCAGTTTTGCTTCATTGTTATGC
TCCACAAATAAGGGAAATCATTTGGTATTTGTCTTTCTCTGCCTGATTTATTTCTCTGAG
TATAATACCCTCTAGCTCCATCNAGACCCTTCTTGGAGTTTGTGAGTCTGATGCTTTTTT
GTTCCTTCAGTTTTGCTTCCTTGTTATGCTCCACAAATAAGGGAAATCATTTGGTATTTG
TCTTTCTCTGCCTGATTTATTTCTCTGAGTATAATACCCTCTAGCTCCANTCTCTGCCTG
ATTTATTTCTCTGAGTATAATACCCTCTAGCTCCATCTGTGTTATTGCGAATGGTAGGAT
TTGTTTCTTTCTTATAGCTGAATACTATTCCATTGTGTATATGTACCACTTCTTCTTTAT
CCATTCATCTACTGATGGACACTTAGGTTGCTTTGATATCTTGGCAACTGTAAATAGTGC
TNTTCTCTGCCTGATTTATTTCTCTGAGTATAATACCCTCTAGCTCCATCCGTGTTATTG
CGAATGGTAGGATTTGTTTCTTTCTTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATGTACC
ACTTCTTCTTTATCCATTCATCTACTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCT
ACTGATGGACACTTAGGTTGCTTTGATATCTTGGCAACTGTAAATAGTGCTGTGATAAAC
ATAGGGGTGCATATGTCTTTTTGAATCTGATAAGTTGTTTTCTTTGGGTAAAGTCCTAGG
AGTGGAATTTCAGGGTCAAATGGTATTTCTATTTTTAGTTTTTTGAGGAACCTCCATACT
ACTTTGCACAATGGTTGAACTAGTTTACATTCTCACCAGCAGTGTAGGAGGGTTCCCCTT
TCTCCACATCCTCACCAGCATTTGTTGTTCCTAGTCTTTTCTATGTTGGCCATCCTAACT
GNNCCTAGTCTTTTCTATGTTGGCCATCCTAACTGGTATGAGGTGATATCTCATTGTGGC
TTTAATTTGCATTTCCCTGATAATTAGTGATGTGGAACATCTTCTCATGTGCCTGTCGGC
CATCTGGATTTCTTCTTTGGAAAATTGTCTGTTCATATCCTCCACCCATTTTTTAATAGG
ATTATTTGCTTTTTGGCTGTTGAGGCATGTGAGTTCTTTATATATTTTGAATGTTAACCC
CTTGATGGATATGTCATTTACAAATATATTCCCCCATACTGTAGGATGCCTTTTTGTTCT
GCTGATGGTATCCTTTGCTGTAGAGAAGCTTTTAGCTTGATGTAGTCCCATTTGTTCATT
TTTTATTTTTTTTCCCTTGCCCGAGGAGATGTATTCAGGAAAAAGTTGCTCATGTTTATA
TTCAGGAGATTTTTGCCTGTTTTCTTTTAAGAGTTTTATGGTTTCATGACTTACATTCAG
GTCTTTGGTCCATTTTGAGTTTACTTTTGTGTATGGGGTTAGACAATAATCCAGTTTCAT
TCTCTTACATGTAGCTGTCCAGTTTTGCCAACACCAGTTGTTGAAGAGGCTGTCATTTCC
CCATTGTATATCCATGGCTCCTTTATCATATATTAATTGACCATATATGCTTGGGTTAAT
ATCTGGACTCTATTCTCTTCCACTGGTCTGTGGGTCTGTTCTTGTGCCAGTACCAAATTG
TCTTGATTACTGTGGCTTTGTAGTAGAGCTTNTCTTGATTACTGTGGCTTTGTAGTAGAG
CTTGAGGTCGAGGAGTGTAATTCCCCCAGCTTTATTCTTCCTTCTCAGGATTTCTTTGGC
TATTCAGGGTCTTTTGTTGTTCAATATGAATTTTAGAACTATTTGCTCTAGTTTGTTGAA
GAATGCTGCTGGTATTTTGATAGGGATTGCATTGAATCTGTATATTGTTTTAGGCAGGAT
GGCCATTTTGACATTACTAATTCTTCCTATCCATGAGTACAGGATGTGTTTCCTTTTATT
GGTATCTTCTTTAATTTCTCTCATGAGTGTCTTATAGTTTTCAGAGTATAGGTCTTTCAC
TTTCTTGGTTAGTTTTATTCCTAGGTATTTTATTCTTTTTGATGCAATTGTGATTGGAAT
CGTTTTCCTGATTTCTCTTTCTGCTAGTTCATCGTTAGTGTATAGGAATACAAGAGATTT
CTGCATATCCAATTTGTGTCTCGCAACTTTGCTGAATTTAGAGGTATTAGATCTAGTAGT
TTTGGAGTGTATTGTTTAGGGTTTCTTATGTACAATATCATGTCATCTGCAAACAGGAAC
AATTTGACTTCTTCCTTGCCAATCTGGGTGCCTTTTATTTCTTTGTTTTGTCTGATTGCC
ATGGCTAGGACCTCTGGAACTATACTGAATAAAAGTAGGTACAGTGGGCATCCTTGTCTT
GTTCCCAATCTTAAAGGAAAATCTTTCAACTTCTCACTTTTAAGTATAATATTGGCTGTA
GGTTTGTCATATATGGCCTTTATTATGTTGAGNCTTTTAAGTATAATATTGGCTGTAGGT
TTGTCATATATGGCCTTTATTATGTTGAGGCACTTGCCCTCTATACCCATTTTGTTGAGA
GTTTTTATCATGAATGGATGTTGAATTTTNTGGATGTTGAATTTTATCGAATGCTTTTTC
ATTTTCAGAGTATAGGTCTGATCATGTGGTTTTTGTCCTTTTTTTTTTGATGTGGTAGAT
GATGTTGATGGATATTTGAATGTTGTACCATCCTTGCATACCTGGGATGAATCCCACTTG
ATCACGATGGATGATCTTTTTGATGTACTTTTGAATTCAGTTTGCTAATATTTTGTTGAA
TAATTTTGCATCTATGTTCATCAGGGATATTGGNTTGCTAATATTTTGTTGAATAATTTT
GCATCTATGTTCATCAGGGATATTGGTTTGTAATTTTCTTTTTTTGTGGTGTCTTTGCCT
GGTTTTTGTATTAGAGTGATGTTGGCCTAATAGAATGAGTTTGGGAGTATTCCCTCCTCT
TCTACTTTTTGGAAAACTTTAAGGAGGATGGGTATTACGTCTTCACTAAATGTTTGATAA
AATTCAGCAGTGAAACCGTCTGATCTGGTAGTTTTGTTCTTAGGTAGTTTTTGGATTACC
AATTCAATTTCCTTGCTGGTAATTGGTCTGTTCAGATTTTCTGTTTCTACCTGGGTCAGC
CTGGGAAGGTTGTATTTTTCTAGAAAGTTGTCCATTTTTTCTAGGTTATCCAGTTTGTTA
CCATATAATTTTTCATAGTATTCTCTCATAATTCTTTGTATTTCTGTGGTGTCTNTCTCT
CATAATTCTTTGTATTTCTGTGGTGTCTGTAGTGATTTTTCCTTTTTCATTTCTGATTCT
GCTTATGTGTATAAACTCTCCTTTTTTCTTGATAAGTCTGGCTAGGGGTTTATCTATTTT
ATTTTCTCAAAGAACAAACTCTTTCATTGATTCTTTCTATTGTTTTATTCTTCTCTACTT
TATTTATTTCTTTTCTGATCTTTACTTTGTCCCTTCTTCTACTGACTTTGGGCCTCATTT
GTTCTACCTTTTCTAGTTTAATGGTGAGTTTAGACTGTTCATTTGGGATTGTTCTTTTTT
CCTGAGGTAGGCCTGTATTGCAATATACTTCCCTCTTAGCAGGGCCTTTGCTGTGTCTCA
CAGATTTTTTGGTGTTGAATTACTGTTGTTACTTGTCTCCATATGTTCTTTGATCTCCAC
TTTTATTTGGTCATTGATTCATTGATTATTTAGAAGCATGTTATTAAGCCTCCATGCGTT
TGTTGGCTTTTTCATTTTCTTTGTATAATTTCTAGTTTCATACCTTTGTGATCTGAGAAG
CTGGTTGGTACAATTTCAATCTTTTTTAATTTAGTGAGGCTCTTTTTGTGGCCTAGTATA
TGATCTGTTCTTGAAAATGTTCCATGCGCACGTGAGAAGAATGTGTATCCTGTTGCTTTT
GGATGAAGTGTTCTGTAGATATCCATTAAGTCCATCTGTCCTAATACATTGTTCAGTGCC
TCTGTCTCTGCTTATTTTCTGTCTGGTTGATCTGTTCCTTGGAGTGAGTGGAGTGTTGAA
GTCTCCTAAAATGAATGCATTGCATTCTGTTTCCCCCTTTAATTCTGTTAGTATTTGTTT
CACATATGTAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTCTGTTAGTATTTGTTT
CACATATGTAGGTGCTCCTGTGTTGGTTGCATAGATATTTATAATAGTTATATACTCTTC
TTGAACTGACCTCTTTATCATTATATAATGTCTTCTTTTGTAAGACTCGTATTTCTTGAT
TTCAAACTTAAAACCATTTC
Chart Advanced