SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00003322_2.0
Identity
PromoterThioredoxin reductase (TR)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Promoter IDSPR00003322
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00003255_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00003322_2.0 # Promoter # Thioredoxin reductase (TR) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) Full length # Reverse
AAGTACAGAGGAGCGTTCAGTTACAATAAAAATTCACAGATTAACTAACGCTGATTCATC
AAAAAAACTCCTGATATTAATTATTTTCCTTTAACAGCACATCCATGCAGTTTATTCCTC
ATGTAATAACACTACTACTACTACTACTAATAATGATAATAATAATAATAATAATAATAA
TAATAATAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGTAGTAAATAAT
AACAATAATAAGTAAAAGGTTCAAATAATGCTCAATCTGTCTAGTTTTCTGGATGTTCTC
TGAACGTTATCATACAGTGCTGTGAAAAAGTATTTGCCCCATCCTGATTTCTTTTGGTTT
TTGTGCATCTCTCATACTAAAACATTTTAGATATTCAAACAAAATACAACATAAGGCAAA
GACAACCTGAGTAAACACACTATACAGTTTTTTTTTTAAATTTATGTATTGAAACAACAA
AAAAAAAAGTAGTTATCCAACACCTATCACCCATGTGGAAAACTAATTGCCCCCTTAAAC
TAACATGCATAGTAAATCATATATAGCGCCCTGCTTGAACAAAGACACCAGATACAAACA
TACACAAGCCCTTATTTCATACCCTACATAGTGCACTCAGGATGCTGAACCCCAAGTAGT
AGCAATTATTTCACACTTTCTCTACTGCATACAGCTACTACAGACTGTTTAGTGGTCATT
TAGGATCCAACCAAACAACAAACCCATTATAGCTCCCTGGTGGACATTTAGTGAACACTG
CATAAAGTAAACAAGCACTACTTTTGACTTGGACAGGAAGAAGGAAAACAGCTCACACGG
AATTCAGCGCTTTATACTTCCAAAATAGTCCACGTATCATCAACAGCACTGGCGAGAAAA
ATAACTACACATACCAGTACAACGTTTAAAAGAAGTATTTACCTGTAAAATGTCTTCTTG
GCAACAGAAAAGCGAAGTGACAGAAAGGTTTCAGTCTGTGTTTGCCTCTGCACAAGGCGG
CCGCCATGTTGTTATGCACAAGTGAAAGGACCCCCTGAGTGACAAGTGTGTCCTGCGAGG
TGCCTGATACAAATTCCAACTTATAAATAAATACATAAATAAATACATATATAAATGAAT
AAATATTGATATTCGTTACAAACATAAGTCAAAATAGTGTCTTTTGAAATTAATGTAAAA
TATATATCACGTTATATGATGTTTTGAAAATCCGTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAACAT
ATTTTCTACCGTGTTGTAAAACCTTAAATTAACTTTCTATTTAAAAAAATTTACATATTC
GCCAATTATTTCAGCTTTGCTTTTAAATCAACGATTTTTTTATTATTATTTTTTTGGATT
GGCTGGTGCATACTCACAAGCAGTTTTCTGAATGGACGTTAAGAAGGCGGTTTTATCACC
ATAGCAATCTTGTTAAATGTTATTCTGTTAAGCAGAGCTGTCTTGGGTTTTTATGATTTA
TATTATCAAAATATATAATAATTTTTAAAAAAAAACACGGTTCGATTAACAACCAAAAAT
ATACAAAAATTTATAAATGATTTCACCAAAAGTGTACATTATATCTTGCTTTATTGCATT
ATATCTTGTACATTTTGTTCTAATACTTCTTGGAGAAATGATATAAAAGTCACTCTAGTG
TCAGTCCATTTTGTGGTGTATAAATATTAAACTGCGCATTTATATATATATATATATATA
TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTCGTAT
CTTAGCATGTTCAGCAACGTTTTTATCTCACGGACTTTTAATTCGAATTTTAACCAATCA
GAAAGCAGAAAAGCAGAAGACGGGAAACTATTCACCAATCCCCGTACAGAAAGCGGGGCT
TGTCTGAATACGGGTAGGCAATACATATAAACGTAAACCAAATGAGTAGTTCTCTGGCGC
ACTCTAGTGGCAGCAAAATGACCGTTAACTGTAACAGCAGTGGGCGGGGCCGCTAAGACA
ATTTGACCAATCACAACGGAACCGTTGAAATATTCGCCAAAGGTGATTGGTTGGTTCGTG
AATCACTCTAACGCGAGACTGAGAACAACCAGAGAGAGAGAGCGAGACAGACACACACAC
ACACACACAAAGTGGGATTTAGGTCTTTGCTCAGGAAGTAGACTGCGAGCGGTTGCGTTT
CTGTCAGTGCGAATAATAATTTAAAAACATGCCGGTGGATATCGAGCAGTGGACGGGTCC
TCTCTCCCTCACTGAGGTGGAGGAAAAGCCGAGCAAACCCCTAACGGTTAAATACGGCAG
TGTGGAGATTGACGAGTTGGGGAAAGTGCTCACACCCACTAAGGTTAGCATGCACAATTT
AGCCACTGCTGCTCTTGGCTAATATTAGCTTTGTATAATGCAGCGTTGCTGCACAGGTCG
TTAATGTGATCGTGCATTAACGTTTTATTGCAATAAAAATGCAACTGCGTTTGGTTTCAA
CTCGTTACGTAATTGCCGTTATGGTGCCTCCAAAGCGCCTGCTTGTAAAATAGAGCGCTG
GCGTAATGACGTCACACGCACCGGTGGAGTTGCGGAAGTTAAAAACTGATTCCAGTCGCC
TTACAGTCACTGGTTTAAAACTACAAATCCGATAAACAACAGCTAGCGAGCACTGTGGAC
AATAAATTATAATATTTATCATATTTAATTTTAAAATACAGTGTAAGGTATTTTCTAAAT
CACATGTTGGTTTCAAATCCTCAGCTGTTTAACAGTTTGTTTAGAACGGGGTTTTATTTA
GACCCGGATGAGACCGCGCGCTCTCATTTGTCCACGTGACCACGCGACGCTTTAACGGTT
GCTAGTTATTGTAGTTTGTCGGAGGAAAACAAAATATATATTTTTTTCTTTTTTATAAAA
GAATATGGAAACATATGCTGCGTCGAAGTGTTTCATTCATCTCACAGGATAGCAGTGAAG
TTCTGTAAATGGTCCGAGTTTTCCCTCATGGATTAGTTCTGTTTAAGGCTCAGTCCAAAT
AGCACATTATTCCCTAAGGAAGTACACTACATAGGGTCTGAAATAATAACCTGCACAGTA
AGTAGAGCACAGTGTGTCCGAATACAGGCGAAAAAGAAAGATAGGACAGACAGACAGTAG
GAAGAAAAATGGAAGGACAGACAGTAGAAAGAAAGATAGAAGGACGGACAGACGGTAGAA
AGAAAGATAGGACGGACAGACGGTAGAAAGAAAGATAGGACGGACAGACGGTAGAAAGAA
AGATGGGTAGACAGAAAGATTGAAGACAGATGGAGGATAGATGACAGGACAGACAGGTGA
TAGGACAGATGGATAAAGTGTGTGTGTGTGTGTTCAGGTGCAGAATCGGCCCACAGTGAT
CGAGTGGGAAGGCTGCGACTCGAGCAAGCTGTACACTTTAGCCATGACTGATCCGGACGC
TCCGAGCAGGAAAGACCCCAAATTCAGGTACACACTCACACTGACACAGAACCAGTTTCC
AATCTGAAAGAGCTGGTTCCGGGTTCCGTCTCAGCTCCTGATTGGATCTGTAGTGGACGT
CAGCGACTATGACACGATGATGTCGTACTCGAGCCCTGAACGTCGTACCTGTGACGGTAC
AGCTACGTACCCACCCTTCACCCGTCTTAACTCCGGACTCAGAGAAATTTACGCTGTTGA
AGTCGAGCAGCTGTTTAGCCGCGACGTGTAACCTGCGTAATTACTTATCCCTTTTAACTT
TAAATTCGGGCCGGGCCAGTATGATCGAAATATATCACGATATTTCTACCATACATCCAC
TGCTTTCACTCGGAGTTTGTTTATCACGATTACGGATGATATACGGTCACATCGCCCAGC
CCTACGTTAATCGGTATGACGTCCAGACTCGTTATTTTATTCATTTATTAATGCATTTGG
CTGCTGTTTTTTTTCTCTCCCCGCTCTAGAGAATGGCATCACTTTCTCGTGGTGAACGTG
AAAGGGAACGACGTCTCCAGCGGGTGCGTGATGTCCGACTACGTGGGTTCTGGTCCCCCG
AAAGGAACCGGTGAGATCTAACGATGATTTATATCTAATATCGGTATGATTATCGTGATA
TAAATCATGTACGGTGTAAATATTTTCAGGCGTTATGATAATACAGTGTGTGTGTGTACG
ATTGATTTTCAGGCCTCCATCGTTACGTGTGGTTGGTGTACGAGCAGTCGGGAACGGTGA
ACTGCACCGAACGCGTCCTGACCAACCGCTCCGGAGACAACCGCGGGAAATTCAAAATCC
AAAACTTCCGCAAGAAATACGGCCTGGGCGCGCCGGTGGCCGGGACCTGCTACCAGGCCG
AGTGGGACGACTACGTCCCCAAACTCTACGAGCAGCTAGCGGGGAAATAATCAGGGATTT
GTAAACAAAATAAGTAAACGAGTGCGACGGCATCCGATGGGATACGTGTTGCTATGCAGA
TTTAATTTGGCGGTGTGATGTCACTGATTGTCGTTAGGCTCTCTGTGATCGGTTGAAATG
TCTTACGGAGAAAAAAAAAAACGTTTAGAAATTTCAAATCATATCCCACCTCAAAGCAAT
CAGTGAAATCACGTTGAATCCGGAGTCTTGCCTTGCTTTCAACATGTTGCACTTAACAGG
GGGGGGGGCATTTTACTTAAATTCCCCCCCCCCCCCCCCTTCTTCTTCTTTAATTTATAA
TCCCTAATGTTAGCTTTTGTTCCGCCCCTCGAACACACCGCTTTAACGTCACGTCCTCGT
TAAACAAACGAATAAAGAAAAACGCATTCAGACATGTGTTGAGCCTTTTATTTACAAATA
TATTTCAAAGCATTTGGGACAGAAATCATGCTTCTTTTGGAACCTGAAAACAAATTTAAA
GTGCATGCACACAGTAAAGCGAGGTTTCTATTCACAAGGATTCTCGATTCTCATTTAAAA
AAAAAAAAAAAAAACTAAAT
Chart Advanced