SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00003336_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein M (SelM)
SpeciesMus spretus (Western wild mouse)
Promoter IDSPR00003336
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00003269_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00003336_2.0 # Promoter # Selenoprotein M (SelM) # Western wild mouse (Mus spretus) Full length # Forward
ATGCCAGAGCTGCCTCTCTAGCCCGTGTGTGTGTGTGTGTTATTTTTGAGTTGGGTTCTC
ATAGGTTTAGGCTGGTCTTAAACTCACTATGAAACGGAAGATTACTTTTTAAATTTTTTA
TTTGTGTTTTATGTCTGTACTGGCTAGTTTTGTGTCAACTTGACACAGGCTGGAGTTATC
ACAGAGAAAGGAGCTTCAGTTGAGGAAATGCCTCCATGAGATCCAACTGTAANNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAACATCCCTCCATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCT
TCCTGACCTGCTTGAGTTCCAGTCCTGACTTCCTTTGGTGATGAACAGTAGTATGGAAGT
GTAAGCCGAATAAACCCTTTCCTCACCAACTTGCTTCTTGGTCATGTTTGTGCAGGAATA
GAAGCCCTGACTAAGACAATGTCCATGGAGATTTTGCTTGCAAGCATGTCTGAACAGTAC
ATGCATTCCCCCCGGTGCTTGTAGAGGCCAGGAGAAGGCATCAGATTCCCTGGAATGAGA
ACTACAGACAGTTGTTAGCTTCCATGTGGGTGCTAAGAATCAAACATGGGCCCCCTGGAA
GAACAACCAGTCCTCTTAACTGCTGAGCCATCTTTCCAGCCCCTCTGAGGATGGCTTTGA
ATTCTGATCCTCGTGCCCTGTCTCTTAAGTGCAAGGATTACAGGCTTGTATTATCATGGC
TGGCTTTTCACACTGGTGTAGGAATCCAGACTCAGTCTTCATGCTTATACAACAATTGAT
TCTACATGTTAAGTTATCTCTCCAATATTTTTATATTTGTTTATTTATTCATTTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTCTGTCTGTCTGTGAGTGCTTGATATTAGAAACATGCGACGGTCAGAGG
ACAATCTGTGGTAGTCTCTTCTTTCCTTTTGTCATGGGTTCTGGGACTTGAACTTAGGGC
ATCAGACTTGGCAGCAAGTGCCTATAGTCACGGAACCATCTGCTGATGGTTCCCCCACCC
CATTTTTAATGCGCATTTTTAAAGTGGTGGAATAAGCCCAGAAAGGTAAAAATACCTTGG
ATCACAAGCAGCGTTGGCTCAGTGTTGACAAGGTTCTCTGGATCCCGTGGGAAAGGGCAC
AGCGTGTTCTTGCTGTCTGCCAGGGATTGGTTCCAGGGCACACTTCCATACCAAAACTCG
AAATATGAGGATGCTCAAATCCATAGATAAAATGGCTTAATATTTTCCTAAAGCCTGTGT
GGCCTGATCTTGTACTTTCTATCATTTCTAGATAATTTAAAACACCTAATACAATACAGA
TGCTATAAATAGTTGTAATGCTCTATTGGTTGGAATAACAACAAGAAAAGAGTCTGTACA
TGTTCAGTACAGAGGCAGTTTTTACTTCCTAATATTTCCAACTTGAGACTGGTTAAATCC
AGGGTGACAAAAAACTGATTGTACTTGCTGTGTCTGCTGAAGGCATGAGGACATGGAGTG
CCACCTGTTTCCTCCTTGGTCCAGGGAGATGATCCACAGAGGTGTTTGGGGCTCAAATCC
AGATCTATGAATTGGCCTATTTTACATTTCTGAAACAGTTCCTAATCTGCAAAACGGAGT
TCATTGCTGGAGGGGGCAGTTGTGATGAGGAAGGGGAAGAGCTAATAATGGAAGGTAGCA
CAGCCAGAGTCTGTCCTAATAACCCTGCCCTCAGGAGGTTGAGTGAGGAGTATTGCTTTG
AGTTCAAGGACAGTAGGAGATTGGTGTGTACCATCTCTGACCAGATACTGTTCTAATGAG
ATGCATTGTGTATATTAACCCTTCCAGCCTTTTCTAGGTAAAAAAGAATAGGTAATATTC
CTTTGTAAGAATTTATTATTATTATATGTGTGTGTGCACCGCGTGTGCCTGTACAGGCAC
GGACATGCCATGGTGAGCTGTTGGGGACGCCTGTGGAGGACAGAGCACAACTTGTGGGAA
TTGCTGTTTTTCTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGG
TTTCAGGGATAAAACTCAGGAGTCAGGCTGTCATAACAAGCGCTTTTACTCTCTGAGCTT
TCTTGAGCGGGGCGTAGGTAATGGTCCTCGCTTACAACGTGTGCTTTGGGGAATTGAAGC
TTTGATCGGAATTTCGTTCAAAGACATCAAAAGCGTATAAAGGAGATCTCCTAGGTTCCT
GCTTCCTTATCTTAACTCTCTGACCCAGAAATCCTTGTGTCCATCTGCGAACCTCCTGCG
CCCTCTGGTGACGCGAAGTAGTGCTGTCTCCTGGCATCCTGCGGGAGCGTTTCACACTTA
GTGGGCAAATGCAATATGGAGATTGTGAGAACTGGGAACATGAAGTCTGGAGGACCAGAG
AGTAGCTGAGACAGGGATGGGGGTTAGTGGGAGGCAACCACCCGATTTGTGTGGGATGTC
AGTGGGGCTATTTCTAGCCCTGGGGGCGTGGTTTATGGCTGGGCGGAGCTTTTGGCTTGG
GCGGGGCCAGCTTGCGGGCCAGACGTGGCGCAGCGGCCGAGTTTGGGTGCAGCCTGCGGA
ACGTCTCCTGCCAGGCACAG
Chart Advanced