SelenoDB: selenoproteins database

SelenoDB
Release 2.0
Chart
Advanced
Promoter Report for SPR00003359_2.0
Promoter
Thioredoxin reductase (TR)
Species
Xiphophorus couchianus (Monterrey platyfish)
Promoter ID
SPR00003359
Promoter release
2.0
External ID
None
Transcript
SPT00003292_2.0
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A)
[Report annotation error]
Orientation
Reverse
Structure
Feature	Col Promoter	Col Coding exon	Col Non coding exon (UTR)	Col Intron	Col SECIS
Residue	Col Sec	Col Cys or Other
Toolbox
Forward Reverse
Sequence
>SPR00003359_2.0 # Promoter # Thioredoxin reductase (TR) # Monterrey platyfish (Xiphophorus couchianus) Full length # Reverse
CGGAGCAAAAACAACACAAACCGCAACTCAGGAAATTATTAAATCCCATTTAACAGACTG
GAATTAGCAGTCTGTTAATTCTGTATTGTATCTGTAATATCTGACAATATCTGTATCAGT
CCAGATATTGAAACAAATCAATGACAATTTGAGCTTTGAGCTACGTTTTCCTGTATTGGC
CGATATGAAACCTCAGATATTAAACCTCAAATATTGGTATCAGAACTGAAATTGAAATAA
AGTGGATCGGTGCATCACTAGGTTTCTCATTTTGAGCTTGAAGTAGTTTTAGACGAAACT
GTATGACTTTTTTGTCCCCCCATTTTTAGAATGTTTAATGAACTCTGCAGAACGGTAAGT
TTTATGATCCACAAATCTGGCATCCATAATTAATGTCAATTTCATTGGTACTTTATCAGT
GCCAATGAAAATGATGCAGCAGTTTCCAGCTCTGGGAATATTCTAGTGTTCAAAGCTGAA
TTCAAACTGCAAGTTAACACCAGCAGCCATCTTAACACCAACACTTAAAAAAATTGGCAA
GCAGCATTTACTAAGTAATTTAAAACATTTCATCTAATAAATGCTGAATCTCCTTTTGCT
GCATTTTGTTTAAGAGGATTTAACAGATGGAGGAAACTATAAAGCTTAGGCTCACATCAC
CAGCAAACATGTCACTTATTCTGTTTTGAATCATAAAAACTGTTTTAAGAGCAGTGAGTT
TATCTGTACATTCTGGATGTTTACTAAATAGATTTGCAGGCTGTAGTTATGTAAACCATT
TCATACAAGATTTATATTTAGTAGCAGCTCGTAATATTAGAAGACCAAAGCATCTATACA
ATTAACTAAATACATTCAGCTAAAAACTTTTGTGAAAGTTTATGTATGTGGTCTGTTGCC
TAAAATAACGCATAAGGATGCACAGATACAGTAATTTAATATCAATACCCAATATTAATA
TTTCTGTTTCTGTTATGGCCAAGAACAGATATGAGTACTTTTCATTAAACTTTGGGGAAG
AAAACATGAGACCAATGCTTCTCTGCTTCAGTTAAACTTCCCACAATCCTTTGCTGCATC
AATATCAAATGACCAAACAAATACCGCATGACCAACCTGCTCACAGTTTTATTTATTGGA
CTGGTAATGCATAACTAATATCGACTAACGGATGTTAGTTTTTTATTTTATTAATCCACC
TGCATTAATAAAGCAAACCATGACTAGATATGCAAACAATTTTATATAAGATTCATGAAC
AACTAGAGATATTAGAAGACCAAACAATGTTTAAAAACTTGACTGCAAAAATGGGATTTA
TATGTTGAGCTCATAAAGCAGCAGGATGTCGGTCCACTGACCTGCATTATTAAAACAGAG
CAAAACACTGCAGCTGAACCAATGGTTTTAAACTGGCTTGGAAAGACATTTAGAAATTCA
GCAAAAAAATCCCTTTTGGAATTAGCATCATAGGATCCTACTTAAAAAAAAAAAACAAAA
ACAGAATGACTGGAGTTGTCTAAACTATTTCAAACTGGGAAAAGAAAAAACAGGCAGGTG
GCATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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Advanced