SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00003424_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein O (SelO)
SpeciesMiichthys miiuy (Mi-iuy croaker)
Promoter IDSPR00003424
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00003357_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00003424_2.0 # Promoter # Selenoprotein O (SelO) # Mi-iuy croaker (Miichthys miiuy) Full length # Reverse
GCACTGAGAGGGATCCATGAGGACCAGTCAGTCCTAATCAGCATCGTGTGGTGTGGTATT
AGAAGGTATTGGAATGAGTGTAAGCCTATGCAAAGTATTAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAA
AGGAATAGAAGAACACATTTAGTCCAAATTGAAATATTATAAAAAAGAACAAATAAAAAG
ACTGAAAAACTAATGGCTCAAATACAGTTACAAGAAACTTTATAAAATCACTGAAGGGAG
TCAAAAACACAGAAGAAAACACCAAACACACCAGAAAATGTTAATATTGAGGACTACAAT
TGAGCATTCTTGCTTCACCTCTTTGGGGTACAGGACAGAGAATCTCCAGCAGGTGGCGGC
AACAGCAAGAATAATATAATGAACAGAGAAGAAGAAACCTCTGACTACAAATCAGTTGCA
CCATGTAATATAACTACATGTTTTGGTTGTTTATACGCCTGCAGCGTTTCTCTCACTTAG
AAGAGACGTTGTGTAGTTTTAGCTGGACAGCTGCCTCAGCTCCGTGTTTGTCATCCTGTA
ACTAGTTAATGCTACTCAGCTGTGGCCGGGTGGCTAGCTATCTGGCTAACAGCAGCTAGG
TTAACCACAGCTAATCAAACCTTCAACAGCGGCGTGAGAAGATGGACTCAAGTGTCTGCA
CGGTCCTTTCCAAAGGTTTGTTTGCTTTGAAGACAGGAACCATTAAAAGCACATTTCAGG
TGAAAGTTTGAGTTCAGCTGACGTTGACTTTTATCAGTGCTTCTGCTATAACTTAGCTTA
GAAAGCTAGCTTAGTGGTTTAACTTTGGATAGTAACGTTACTTTGGCGTGTTTTTTTTAA
ATTTTTTATTATGCATCGTAAATCATATAAAGTTGTACGTACAGAGAAACCACTTCCTAT
ACAAACCTGGCTAAAGTATAGCTAACTGGGTTTTAGCAACATTGTTGTTGCTGAACATGC
ACCTTTCCAGTCAGGTTGCATTCAAAACACATCGCTGTTCCAGAATTAGAGATTGGCAAC
TCAAATATTGTATTAACATTTATTGTCCAGCCAATTGTGGAGCTGTACCCATATTTTCTA
TTGTATAATTAAATAATTTAAACACATTTATTTCACCACATTAGTGACTTCAGCTACACT
CCCTTCTGTTTTCCAGGTGACCTCTTACCTCTGGCATCACTGCGCCTCCTGGTCCCACCT
CTCCAGCTTATGGCTGCCTCCATGTGGCAGGTTCTGAAGAAACAAGATGTCATGAACTAC
TGGAAAGTGGCAGATTTTGTCTCTTTAGTGATGGACATGATCCCAGAGCTGCTAATCTAC
AAACACCGGACGCAACTTAACCTGGGTTTAAGAGCCAGGGTGGGTCAGAGGAGTTGATGG
TTATAGACCGTTAATGATATGTAAGCTGTCTTGTGAGTATTCTGGTGCAATTTCTGCTTG
TTTTTCCTCCTCCTCAGTATATTCTAGAGTTGTGCCGAAGTGAACAGTTTGTGGAAACTG
ACTTCATCTTGTCTCATCTGGAGAAGATTAATCCACAGCACCCCACTCTGTTAGATGTAA
GTGTCTACAGTCTAGATTAGCAGATTTTTATTTCATACACCAAAATTCCAACCATTTTGC
AATATTTCTGCTTCTTAAATCAACATGTGTTTATTGTAAACTTATGCTGCTTGGCTAGGC
AAGCTTATTGAAACCACTTAGGCAGTGGTGAACTTAATATGTGTCCATTTTATGCCCATA
TTGCAGGTGAAAGAATCAGGAGAGCAAGTAGCAGTTAACTTTCTTGACTTGATCCACACT
CTGCTCAAAGACCCTGAAGAGAGACAAGACTTTTTCTTGGTGAGGCAGTTATCAAATTCA
ACTGTAAATGTTACTTTCCATTATAGGTTATAATTTGTATGCAGCTTGGTTCAGTCAGTT
GCACACATTCAGTAGGATGTGGAGTATGATGTACAGTATTTTTAAGTACTTTAAGTTTTG
TATTCAGTAAAATAGTTTTTTTCACAATCTTGTTTTGTTTTTCAAAGAATGTCTTCCCCG
CTGAGTATGGACCTCAGTACGACAGCGACTTACAGATGCTGTTTTCAGAGTTCCTCTTTC
GGCTGGCTCAGCTGTTGCCAGTTCCTGACCTTGAGCAGGTGAGATGTTGTTTCATCTCAT
TCAACAGTTTCTCACCATCAAAGAACACTTCCATATTGCTTCTATACTACAAACCTCTTT
ACACAATTTATACATGACATCAAGCAATACTGTATGCATCTGGTGTGACCTCACCAATAA
TCCCACACATGGTTAATGTAATATTAATATAATGACCTCTTGGTCACTGACATCAAATTA
GCTTTATGCTGATAAAATACACATGTAAACAGTTGAAACATTGTCAGAAGAGACCGGCGG
TACTTTAACAACAATCCAGTTTTTAATTTTAGAATCAACAGTAACAAATGGATACATGAT
ATATATAGTATACACAGGGATCAACATTCAGTTTTTTTGCTTGCTCCAATACAAATTGTT
TTATGTCGTAGCGTTTGTCAAAAAGCAACAACAAAGCAAACTGAACCATACATAGTTGGA
GTTTCGCCCACATCCTCTAACGCCACCCAACTCAACGACTGTTTTCCAGAATAACTGAAG
TGCTCAGTTGCGCTTCAGCTTATAAACTTTGTCTTTAACCATCATCATCAGCTCTCTCTC
AACTCTCACCAGAGATGAGAGAGAAGCAAGATGGCATTTTACTTGCTCTGGGCAAATTGT
TTAGCCCCGATGCACAGTTTAAACATTAGAAACACTCATCAATGGTAATGTCTCTGTTTT
GCCTTTGCTATAGTTCAAAGTAAAACAGACATGTGACTGGACATCCTTGGCTAGTAATAT
ATCCTACAGGTGTTCATTTGGCCAATACGATGTTGGTATCTGATGTTAGTATCCTACTTT
TGAAGTTTAAATCTTTTTGATTAGATACAGTTTGGTATAATATGTGTTTTCGCACATTTC
CCACAGACTGTTTCCTGGCTTGGAGCTGAGTGCTCTGCATTGGAGGATTGTGTGCATTCT
GTCTCTGAGCCTACACACTTGAAAAATTTGCTCCAGCACCACAAACACCTTGGGCATTTA
GAGCAGCACGGTAAGTCGCTTCCCAACACCACTAATCTATTGTGTTTCTCTTTCATTGTT
GAAGACAGACAATAACCTGCGTGTCATTCTTGTTCCTTGTGCAGTTCCACCTTCTAGCAT
GGGCGACAGGATCCTCTCCTCCCTTTCTGCGATTTCCCCTAGCAGAGTGGCAAAAAATAC
TGAACAACCCAACCAACCAGATCCACTGCAAAGCCTCAGTGATGACACACACACTGTGTC
ATTCGTGGAGGACGCAGCAGTTGAAATAATCACAGTGACAGATTACGCAGAGGTTGAATT
GGGCACAAGCACCGACATCGAGGTGGTGATGGAAGAGAACTGCTGTGAAGGAACAGACAC
TAGCACACCGGCTGAAGATTCGCTAGTAGTTCTTCCTGATGACACAACCAGGGAAGAAGA
AGTTGAAGCAGGAGAGGAAGCAGTACAAGAAAAAGGTGCGAGTGGTTTGACAGACATCAT
CCTTCCAGATGCTAACAAGGAGGACATGTCGTCCTCCCAACACAAAACCTTTGTGGGACC
TCATGACTGCCCAGACTGCGAGAAGAAATTCAAGTTTGCCTCTTCATTAATCGCCCACAG
GGTCATCCACACCGGTGAACGCCCCCACCGCTGCAACGACTGCGGCCGCTGCTTCTCTTT
CAGGCAGTCCCTCGACAGGCACCGACACACACACAAAACCGGCCGCAAGTACAACTGCGC
CATCTGCGGGGAGACATTTCACTCTTTGTCAGCGCGCACAGAGCACAAGCAGACACACAT
GGAGGACAGTGTTTACGCGTGTCATCAGTGCAACAAGAAATTTAACTGGGAGCTGGCACT
CGCAAGGCACCTGAAAACTCACAGCGAGGATAAAAACGCAAACAAGCCTACAGTGAGCTG
TAAAGATGGACAAGAGGTTGTTCCAGGTGATGAAGGTGTCAGCGAGGCTCCTGTACTTGA
TGAAGCTGACAGCCAGGTGGATGACAGTGGTGATCTTGAGAATGCAGAGGTTCAGAGCGT
TGACCGTCACGCCTCCGAGTCTGACAATGAAGTCATTTCCCAGGTGAAGGTCCGCACAAG
TGGGCGCAAGCGCAAACCGACCATGAAGATCCAGGTGATAAATTTACAGAAGCGCATGAC
AACTAAAAGAAAGAAGGAGATCACCAAGACGAACTCCACAGAGCTGAAGCCTTTACCTTT
CAACTGGTAAAACCATCTGTCCATATTTACCACTTTCCATGTGTTGCTGTCTCACAAATT
GTTTCCTTCATTTCATGGTTAAATATGACTAAGATGAAGCACCTCATGTTTATATTTCCT
TTTTCTTTAACAGTGCAGAGCACTCATATGGGTCATCTGTGGTCTCATCAAAGGACAGTG
ATGAAAGTGAGTGTTTGTTTTTTGATCTCGCTCACCACTGTTACATAAGCAGAGAGATAC
GAAAGCTTAGACACTGATACTATTACATTAAAGAAAATCAAAGCAGCTGACTATCTGGTA
ATCTGTAAGTTCAATTTGAACCCAGTAATTTGTCCATAACTAAAATTAAATTTGCTACAG
TTTATTTAAAGGAAATTAAAAATTTCAAGTCATGAAATGTGAGAAAATAACTTCTAACTT
AAATGCTTTGCTTGGACACCAAAAGTGAAAGTGAATTTCCCCGGTGTGGGTTAAATAAAG
TCTATCTAGTTTATCTTATTTAATATTAAAATAATATTAATATTAAAACTTAAATTCGGT
TATCTCTTCTTTGTGTTCTTCTAGCATCTTTCAAACTAATTGTTTGCAGTTTAATTTTAT
TCATTAGTAAATTACAGGTTAATTTCTGTTCTATAATTTGCAGGGTTACAGATAATCATT
TAATGGCACTAAATAAAGAA
Chart Advanced