SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00003491_2.0
Identity
PromoterMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesMiichthys miiuy (Mi-iuy croaker)
Promoter IDSPR00003491
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00003424_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00003491_2.0 # Promoter # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Mi-iuy croaker (Miichthys miiuy) Full length # Reverse
TGATGGATTTGTGGTGAGAAACAAAGGGATGAGGATTTGTTAAGGTTGTTATGTCATCAT
TCGCCATCCTTAATCTTTTATTTTTTTAAAAACTTAACTTAAAACAAAATTGATACATTG
GATAAGCATGTGCACTTGTTTACATAGTAATTTTAATTAGTAATAAATGACTAATTCTCA
GGGAATTTGGTGAAAATAGTGTGAAAAGGTAATTTAAAGTGCTTTTACATTAGACATAGA
AATGAATCCAAATAGCATTTAGAAGATAAAAAAAAGAAACAAAGAAGATCCTTAAATTGA
ACTTTTAGCGGCGCTGTAGAAGTCTCTGTTGGACTGCAGCTACAATCAGCTTCCATAGGG
TGGCGACATTTCTCACAAAACACAGTCAAACTCCCAACATAATGTTTACATTGTATGGCA
TTTCATGTGCCATCTTGTAGCTAAGAAACCATGTGAAAACTTTGTCTTCCAGAGTTGCTT
GGTTGGAAACAACATTAATGTTTTTTTAATTCCAGCAACCTTTTCACGTTCACCTTGAGA
CTCACGACAGTATGACAGAGCTCAGGTTTTATTGTCAGAGAAGCAACTTTTATGCAGATT
TGTGTATGATTATTAGCTTAGTACCTCCAATGAAATCATCTTGAATTTGTAATGTAACAT
TATTTGCACTTAATCTGAATAAGTGATGTAAATGAATTTACTTCAGCCGAGACAAGACTG
CCTTTTATTTTCCTAAAGTCTCTCTGTGAAAACAATAAAACATAAACCCTCCAACACCTC
ACTTTATGTACCGTGCATGTGTTTGTGTGTGCGTGTCGGCGTGTTCATGCATGCATGTGT
CAGCCCATGTAGCTATATACAAATATATTTCAAAGATAAACCCCTGTTTCGATTATTTGT
CCCCTTTTCTGCCCCATTTGAGACGGGACCTGCCGTACCAATAATAAATGTGTATGACTC
ACACGGTGACACACAGATACGCAGTCAGAGACGACTCATTTATCTCAGAATGAGAACCAC
TCATGTATGCAATATGATACACACTTTGCTTAAACCCTCGCTCCTCTCCCCGCAAACCCA
TAATTATGTGTAAATGTCCTATTATACATCGTCTGATCACAATGAATGAAATTGAATTAC
CAAATAAGCATTGTGTGCACTATTCTTGTTAATATCAAACACATTTACTTGAAAGTCTAT
TTAAAAATGAAAATCACACTCATTGTTGCACTCCAAAATACAGAGATGATATCTAGAAAA
AGCTTTTTGGTCGACCGCAGTAGTGTGATTCACCCCGCTCTCATTTTTCCCCCTCCCTCT
CTGCTATCTTTCTTTCTCTGTCTGTGTGTATGTGTCACATCCTGACACCTGTGTGTAGGT
GTGGACCAGGGCACAGGTGCAGGTGCAACCTCTCAGGGCCTATTTTAGTATTGGGACAGA
TATTTTTTGCATGTGTCTGCATGCAGCAACCGTGCGTGTGAGTGTGTGTGTATGTGTGTG
TGTGTTGGGGCATGTAAAGCTGTGGCTTACTTGATCGAACCGCGCTGAGTGGTATGTGGT
TGGGCCAGCTAGCTGTTTTCCAGTCCCTGCCTATATTTTTGCATGCTGTTGTGTTTTGTC
AAGTGTGCTAGAGGAGATAACCTTTTAATAAAGTGATCTTCATTTCCTCCGTTTTGAAGT
GAGGATGGTGTGTAAGCTTTAATCGCTTGGTGAAATCAGGTTTTCCGCCATCTGCGATGA
TGTCTGACTTCAAGAAGAGATGCCTCAGTGAACCACGGCATGATTCTGTTTATTTCTGCC
ACATTACTGGGAAGGAGTTATCACAAACTAAGGATATGAGTCCATTATATGTAGGAAGGG
ATTCAGATTAGCTGTGAAAATTACCATGTTTAATACAGATACATTAAAATTACATTCAGA
AGTAGCTGCCTGTGTGTTTTCTGTGTGTTCCTTTTGTGATAGTTTAAAATGGGGCATGGA
AATGCATGGTACTCTCATACGCATCCATACACAAACACAGTGAGGCAGGGCAGGACAGGA
ACCAGGCTGTGTGTGCCCTTCAGACAGAGCCTATTGTCTGCAGATGGGCCTTTAATGGCC
CCACAGCTGGCCACAAAGAGCATACCGCTCCAGCTCACTGCTATGCCTCTCACTGGCCTA
TACTCAGTCACCCTGAAGAGAGGAGGCAGCTCACAGGCACACCAACACCACTGTTTGCAT
GCATTTGATATCTTATTCTATTGTACTCTTACAGGGCATGTTTGGTGTTTATTTTCCTTT
CCTCCTTGTCAAATTCTTTGAAACTCATGAAGAGAAATGCTCAACAAATCGTTTAAAGAA
AATAGAGCTGCGGAAATGCGTGGCACCGGGGAAGATAGATGGAGAGAGAGAGAGGTGCTG
GTTGTTTATCAAAAGTACTCTGCACTCTTTACCTGCGTATGTGCACACACACACACATAT
ATATATGTATATATAAACACACGTCCCAACCACTACCTCTAACTCCGTCCTGTACTGCCG
CCTAATGCAAAAGGCAGCGCCCACGCAAAAGAAACAAACACACTAAAAAGACACCTTGCA
GAGACATGCACCCACACAAATTTCTTGCACTCTGATACGCTCTGTATTGTGTCCTCCTTT
CACAGCTTTTCATTTATCTTCTCCTTGACAGCTTTAATAGATCTTACCATATGTACATAC
AGTGCTGTGCATGTATACATGGTTGATAATAGCATTGTTTTATACCATTTCCTCTTTAGA
TGCTATGCGGTTAAATAATTTGTTTCTTTAGACACCCAACACGGCATTGTTTGGTAAGCT
GTATAAATAGAACAATAGCAGAGAGTATTCTGGTGATGTCCTACCAGCTGGAGAATTGTT
GTGCCTTCTTGTCCTGTTCCTCACATAATTACTTTTCTAGATTGTAGAGGTAGTAGGCAC
ACAATTGAATATGTGTGTGGGTGTGTGTATCTTCCGCTGCATGTGTGATGGCAGAGGGAA
AACAGAGCTCGCTTTTGCTATATGGCCTGTACATTTTCTCTCATGATGTTATGAGAGTTG
TGTGCAGGGTTTTTGCAGATGCCAGATGTGTTTGCATCCCCTCCCTTGGTCTCCCTTCCC
CTCCCTCTGGTTCCTGCATGGGCGCAGGGTCTCAATCAGAGCATCAGGGCTCCAGGAACC
GGAGCACAGCAGTCTCTCTGTGCTGCCCAGAGAAGTGCAGCCTTGTCTGGGTCGGTGCAT
CTGCAGCCCGGGGGCGAGCTGGGGGAAGAGGGCGAACCCTGGTGCCCCCTTGCATGCTGG
TTTCACTTGAGGTCTTCTCTGTCGGCACAGCCTGACCCCTGAACTCTGGGGGAGAAACAC
AAGTTTTTCCAGATACAGTATATATATATACACTTCTGTCTCTCTGTCAGGTTGCACAGG
TTGATGACACACACAACTTTTAGACAAACTGTTTCTCCAAACAGGTTAGTTTGGTACAGC
ATTGAAAAGAAAAACAAAAACTAAAGGCAAGCTCACACATGCTCGCACATAAGCAGGCGT
GTGTTCCTTTCCCATAGAGAAAATGTCACGAGCCTGGTCCTCCTTTCCACTGGGAATAGC
AATGGGTTAAGGGTGGGGGTGCAGGGCAGCACGTGCTGCAGGGCCTAGTTGGCTTGCTAA
CTGGCCCACTGGCTTTTCTGGCTGATGGCCCACACTGTGACACTCTGCACCTGGGAGCCT
GTGTGTTGTCAGCCATGCTAGCTAGCTCAAGCTACCACCACATGACACACAGGAAACACC
GAAATAACTGCTGAGTGTCTTCAGCACAGAAACCACTTACTGTGGGTGTGCTGCTGACAG
AGAGGGGTGATAAGAAGGGTTAAAGGAAAGTAGAAGACAGAGGAATACTGCTTGGAATGG
GGACTGACTGGTTTGTAGCATTAGGGAGAATAAGAATAGAAAACTGGAAAGGAAAGTGAA
ACACAAAGATGCTAAGGCGCTTGCACCTGTGCAGTCTTGTGTTAGCGGAAGATTCCACCA
GCCTTGATTCACAACCATATGGTGCATTTATGTATTCACTGACATATGCAGCGTGCCCTG
TTTATCTTCTCGTTTTGATAATCAGCCCACCACAAAGATGAATGCACGACAATCAAAGAT
TGACATTTTACAGCTGGAGTGCAACAGTTAAACTTCCAAAACATCTCTTATGTTAATTTT
CTGGCTTTATCTGCTCTGTCCATCTGCGCCTTGAGTCATCTGAGCCTCACCTCGCACAGG
TGTGAGAGAGATTTACCAGCAAGCCCTCGATTAGAGCTCCACACAGGAAAGTGTTGTGCA
ACATTTGGGCTTTCAGGTGGTGATGTGCTGATGTGTCACCATTCTGAGGAAAGAGGACAG
AATCAGGACACACACACACACACAAACACTGTTTGCATTGCAACATGCACAAACCATGTT
TTCTGTCCGCTTGCCCCAAATGGTTTATTTCTGCCAACAGTGCAGATTGAATCTTGTGTT
TCAGTTTCGGGATAAGAGCCAACATGAGACGGTGGCACGATTGTGTTATCATCTGTTTCT
GAGTATATGTTTCTGTCTATGTTAAAGATGTGAAGGAAATGAGTAGATGGAGGGAGAGAA
AAAGAGAAGGGAGGAGAGATGGTGCTGGCTGCACCAGGAGGAAGCTGGGTCTGATGCTTC
TCCATGCAGCTGCTCCCAAACACCCACACTCTTCCTGTTGGAGTGTGTATGTGTGTTGAC
TTTTTGTGTATAGATTTAGTGTCTTACTTCAACGTAAGGAAAGAGGAACCTGTATCAAAA
AAATCTCGGCGGCTTAGTAGTTATTTTAATTAGTATACATAACATTGTTTAAGCGTGGGC
TTTTTATTAAGCATTTTTGAAGATGCAAAAGAGAACAAGGATTTTAAATCGTTCACGGTG
AAGACAAGATCAATCACCTGTGATCAAAGGCTTAGAACAAAAAGAGTTCAGTGGTGCAGT
TTGAGAACTCGAAACTTGAA
Chart Advanced