SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00003571_2.0
Identity
PromoterSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesRousettus aegyptiacus (Egyptian fruit bat)
Promoter IDSPR00003571
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00003504_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00003571_2.0 # Promoter # Selenocysteine synthase (SecS) # Egyptian fruit bat (Rousettus aegyptiacus) Full length # Forward
TCAAGGGCCCAGGGGTTACAGTTAAGGGCTGGGAGATAGGAAAAATCTGAGTTTTTTGAG
AGATAGGAAGAGGTGGAGCGAAGATTAGGTGTTTAATGTAGTAAGAGTAGCACCCCTATC
TACCAGGAATTGATGAGGCTGACTATGTTTATTCAACTTGAGTGTTTAAGGGGAAATTGG
GATGTTAGGAGTGTTTGTACTTCTCCGGAGCACCCTCATTTATCAGAATTAAGGAATTTT
CTTTGTTTCGGTTTTCCTTTTATAAGTTAAGACATTCTTTTTTTCCCATGTCTCTTCTGT
TTATAATATCTACAGTGTCCTTGTCAAAAATGGTTGCTCGGGAAGGGGACCACCTGTTTG
ATCTGCAAGAGCACAGTTTATTTTGGATTTTGTCTCATTTTTATTCAAACCCCCTCTCAA
AATGTTCTGACAGGTGTTTTAGTTCAGGCAAAGGTGCTGTTTTCCATTCTAATTTATATT
TTTGAATTAGGCTTCCAGTTTCAGGTTTAACTCCACTGACAGAATGAGGTGAAAGCTTTT
ACGCCAGCACCTTCATTAACTGAATGTTGTCACAGGGTATTTTTCTCCTCTATCATCATT
TTTCCTGTTTGTATGATTGAATTAAGAGCCAATCAATTGTTATTGGAAATGTTTGGGGAT
ACTACTTTTAAGAAGACTTTGCCCTACTTATCATGCCTTTTTTTTTTTTTGACCCTAGAT
TTATTGTGGAGAGATCCTGTAGATCAGAGGTTCCCAACCTTCTGGCACCAGGAACCAGTG
CTCCTATGAGAATCTAATGCGTGATGATCTGAGGTGGAGCTGAGGCGGTGATGCTAGCGC
TGGGGAGCAGCTGCACATACAGATGGAGCTTAATTCATTTGCCAGCCGCTCACCTGATGC
TGTGCGGCCTGGTTTTTAACAGGCCATGGACCGATACCAGTCCCAGCCTGGGGGTTGTAG
ATCTCTTTCTGGGCCAGTTCAAACAGCTTTTGCCATCAACAATTTAGCATCTGAGGTTCT
GACCAACATGTGTACAAGATGATATAGGTTAGGTAATCCTGGATCATATACACCCAAAAG
AATTTTAAATTCTTCTAGGAATAGTTACTGGTCTTGTTGGAATGTTGAGAGATCCTCATT
TATAGCTCTTAATTCATCTTGGGTCTAAAGTTTAAATTCTACAGTTGCCTGCATACCTGG
CTCATTGGAGGGAGAGATTTTTACAGGCAACTAGCATTTTGTGGTTTTAGCAGAGTTGTT
GGGAAAAGGAAGGGGGTCTGGTCAAGAGGAAGAGAAGGGAGTAGTTAACATTGGTGAGGA
AAGAGAGAAATCAGAAGGATAAAGGGAAAGAGGGATATTGGATAAAGGGAAGCAACTGGA
GGACAGAAGGAGGATTTACTAGAAAATGAGTCTAGTTTGTTGCTGCTTAAGTTTGTCAAA
TTGTTCGTTAGCTTTGGCTAAAGAATCTTTTAGTGAAATAATATTTGAACCAGAATTTCT
TTTGGAGTCCTCTGAATACCCATCAAAAACTGCTGCCCATTGACCTGATAAATCTTAATC
CCCCTTCTTTTCTAAGGTGCCCATCAAATAAAAAAAATTATTCAAGTCAAATGTTCCTCA
GAGTGGCCACTGTAGGCCCAAATCCTCATCGCTGAAGTTATGTCAATTAGAGAGCTAGGC
ATCAGAATTAGGATTGTAATAAGAACGCATATAGGCAGCAGCAGTTTTTCCTAAAGGAGG
AAAGAATTTAGGCTTAGATGACGCCAGGAGAGGTGGCAACAGTTGGTTGAAAGTGATGCT
TGTGGTCTTTGTGTCATAGGCCCCCCCACCTTATGGTTGGCCCCCTCCGAACATAGACCC
GACAATCTGTGCCCCATGGCAGATGAAAAATTAGAGTAAACTCTCTCTAAATACAAGGCA
AATTCTTAGGACAAAAAAAAAAAAAAAATTCAAGATGGAAGGAGAGCCTCAGCTAGGTTC
ACTAGTGATTCACAAAAAATTTGTCCAAATTGATGCCAGTCTGGTGAGAACTGCAAATTC
ACCGTTCTGAAAGGCTAGCTCCGACAACAAGCATATAGGGCTTACGCCTGTGTTCTACCC
TATGATTCTCCTCATGACAAACAACGCTTTTAGATAGCACAGAACAAAGCAGAAGAGAGC
CAAAGGATGAAGGGAAATGCTTGATTCCAACGAGGATGCCAAATAAATGTGAACAAATAA
CAAAAGCTGGGTACCAGACTTTGAAGATCTGAGGAACTCAAAGCAACAATAGCAGAGTTC
ATATTCGCCACTGACTTACCGCATTACCACTGACTCGACAAGCCACAGCAGCAAGGCACA
AAAGGCCTCTGTGGGTACCACATCTGGTCGAAGCCCGAAGTCCATGGTGATGGACGGTGG
ACTGTGTCTCAGTGGAGTCTCCAGGAAAACTGTGGAAATAAACAAAGGATACCCAAATAA
CAAACAGAGACTACTCAGAGCCTGCTAGAGCTTTTGCATTTGCATTTGCATTTGCATTGG
GCAGACTCAAAAGGGAGGCAGGAGAATGGAAAAGCTTTATGGTGAAAAAAGTAAGAAGGC
TTCAGGTGTACTCAGGTTGGAGGTTTTGGCAAGGGGAAGGTAGGAGTGGGCTAACTAGAA
ACAGGCACCACATGTCATTGGTTTGGGGAGCATATTTGGTTAGTCCTGAGTTGGAAGCAG
GTGAAAAAATTGGGAAGCTGGCAGTCACTGACCATGTCTTAACTGCTCTGGGCAGATTGC
TGCAGGGGATGTGGGTTGGCTTCGTGGGCTACTTGTTGCAGAAGTTGTAGGTCGGGGTTC
TCATTATATATGGTCTGGCCCCTGTCCATTTGTATAATCAGTCTATCAAGGTGAAGATGT
CATTGAGAAGTTAGATCTCATTTAATCACCATAACTATGTCCTTGCCGTCCCTATTTTAC
AGATGAGGAAAGCAAAGCTCAGGAGTCTGAGTAATGTATCCAAAGTCATGCAACTAGTGA
GACAAGCAAAATTTAGACCTACAAATGTTGGACCTATTTTTAACCATGTTACATCTTGTA
AAGGCAATGAAATTTTTTCATTGGGTGAGTTAATGGACGAAAGTAATTTTGGAGCACTTC
TTTTGAAATTGTCTCTTCAACCTGCGGGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTAGTGAAGGC
ACGTCTTGATAGATTTAGTTTTTGGAAACAAACATTTTTTCAAATTTAGACTGGTAAACA
ATGAGACAACCTGCTGGCACAAAACCCAGTGTGTCCATTCAGTTATAAGATGGCTCTTGG
GATTTTTGCACATTTTGCATGTGATCGACAAAAGCAGCTTTGAAGGCTTTCCTAAAGGAA
AAGTTGTAAAAAAATAGTTGCATTTTGGGAATAAGAACTCAACTTTTCCATAGTTTGAAG
GCTAATGTTTATTCTAAAAAACAAGCTAAATTCTCACTATTTTGTGATATACTTTTCTGT
ATAGTTTTACACGGTTCTCAAATTATCTACATCATTCAACGAATATTTGTTGGACATCTC
TTAGATGTTCATGTGTGCTGTGAATACAAATATGAAACACAGTCCTGTCAGTTAGGAGCT
CAGAGTCTGATTAAGGAAGATAGAAAATTAACAACTGGAATGCAAATTAGACAAGTAGCA
TGGCTGTTAAAGGGCAAGATGCCCTGAGCACATGCAATAGGAATAGTAGTGAGTCGGTAC
ATGTTAAACAATAGATTCCTGGGTAGGTGGGATGGGAAGGTAAGGGCCTGTTTTATAGCA
TTTGCTGATTTCCTTGGTGTAAATACTCCCACATGATGCCACTAAAACAGGATTTGGACA
GATGTGCAGCAGTACACTGGTTATATCCTATTTCCACTATATAGATACAATCAATATAAA
TAATGTCAAAAGCATAGATAATAGTAAAATGTAGTAAAATAATTAAGAAGTGATGAGTTT
GAGCATTTATTACTTTTGTTTTTAATAGTTAATTGTAAAGTTACATAATTAATATATTGC
TAAAGAGCAGCTGTATTAAATAACCAGCTCACAAAATTACTGAACATTTAACAATCAGCT
CTTGCAAGTGAGTACAAACCAGCGCAAGTGGGCTCTAGCACACTACTGGACAAGAGCAAA
GCCAGGAATTACTGTTTACTCACCTAAGGTGAAGATTGCAAGGAAATCTTAGGCAGAGAT
CCTACCTTTTCATTTCTAGATCTCTGATACCTAGTGCTAAGTTGTTAAATGGTCAAAGTA
AATCATTAATTCAATATTTAAAAAAAAAATAGCGCCTACAGTATTCTGGGCAGCGTTGTG
GGATGCCTACGGCAGCAAAAACCAAGGCCCTTCCTGCGGGGAGTTTACATTCATAGCTGT
GTGTGTGTGCATTAACAAATATCTGTCGTAACAGGTGGTGATGATGAGAGTTAGGGTTAA
AAATTCTGTAGTGCAAAGGAGAAAAGGAGTGGGGCATTGTTATTTCATAAAGAGTTGTCA
GGCAATTTTAAATGTTGAGACGTATAAAGGTAAGGATGAAAGATTCGGGATCTGAGAAAC
GTGGTCTAAGTAAGGCTGAAGCACAGACTGCCCAAATCTCACCGTTTAACAGGACTGGAA
CACAGTGCTCTCAGAAAAGTTTCCTTCAGAGAAGACCACGCAGCTGCCCTTAACTTTCCT
CATCCCCTCTGCACAAGTGCAAAGTCCCTCCTTTAAGTCCGTCTCAGGAACACTAGGGAT
TAATTAGACCAATCAGACGCAGCGAGGAGGGGCTAATTCTCAGTAGTAGCTGAAGCCTGC
TAAACGCGCTGACACTCCTGCGCATGCTCAGATTCTTCAGTTTCTGGCACACTAGCTGGG
GTTGTTTGCGCATGCGCGAAAGCGAGACGCAGATATTTGACCCAAGGCCTTGCCGTACCG
TCCAGTAGGTCGGTTGCATTCTCGTTCCGGGTGTGTCGTCGTCTGTTGACTGTTCTCTCG
GGACAGTCACCACCACCGAC
Chart Advanced